1. Mapas paratransmisso genticaProf. Dra Adriana Dantas UERGS Bento Gonalves,RS

2. IntroduoOs mapas genmicos representam ainformao gentica cartograficamenteem cada cromossomoFornece toda as informaes relacionadasao dogma central e ao metabolismoorgnico e funcional necessria paraaplicao biolgicaConsiste em localizar um gene ou umlocus especfico numa regio determinadado genoma, num cromossoma ou numabanda cromossmica. 3. Mapeamento do Genoma Mapa Gentico: mapa que ilustra a ordem dos genes num cromossoma e a distancia relativa entre esses mesmos genes/marcadores moleculares. A unidade de distancia 1 cM. Mapa Fsico: engloba diversos tipos de mapas, com maior ou menor resoluo, mas que informam sempre a distancia em bp entre genes/marcadores moleculares 4. Cartografia cromossmica 5. Caritipos, Bandas e ideogramas 6. Tipos de mapas genmicosMapa de ligao genticaMapa de contguosMapa de restrioMapas fsicosMapa de bandeamento de cromossomosMapeamento do plasmdeoMapeamento da mitocndriaMapeamento do cloroplastoMapeamento RibossmicoMapas por clonagem posicionalMapeamento por FISHMapas de Alta ResoluoSintenia de mapas 7. Projeto do Genoma HumanoO Genoma Humano tem 3.2 Gb (3.200.000.000 bp) Objetivos do Projeto doResoluoGenoma HumanoConstruir um Mapa Gentico2 Mb (2.000.000 bp) detalhado do Genoma Humano Construir um Mapa Fsico 0,1 Mb (100.000 bp)completoObter todo o Genoma Humano na5 Kb (5000 bp) forma de clonesDeterminar a sequncia completa 1 bpdo GenomaIdentificar todos os genes 8. 280.000 ESTsEm setembro de1996, os pesquisadores descreveram comotinham gerado e analisado 280.000 seqncias expressas porcaracteres (ou ESTs).ESTs so pequenos fragmentos da seqncia copiada dasmolculas do mRNA. Como esta, representam fragmentos dosgenes.O total de 280.000 ESTs excede distante o nmero provveldos genes no genoma humano. (as estimativas para o nmerototal dos genes variam, mas na primavera de 2000, gene asuposio dos pesquisadores era ao redor 60.000.) 9. Mapeamento gentico(linkage ou mapeamento meitico) a descrio da ordem relativa demarcadores genticos em linkage groups,na qual a distncia entre os marcadores expressa em unidades de recombinao.Locais muito prximos raramente soseparados durante a recombinaomeitica.A probabilidade de separao muito baixa. 10. A abordagem bsica do mapeamentogentico para identificar genes relacionadosa caractersticas herdadas analisar umasrie de marcadores polimrficos em populaoes que segreguem esses genes deinteresse. 11. Genes LigadosLinkage Quando dois ou mais genes,responsveis por diferentescaractersticas, esto localizados emum mesmo cromossomo, a herana chamada de Vinculao Gnica. Nestes casos a quantidade degametas e portanto a freqncia dadescendncia apresentaro diferenasem relao ao diibridismo j que aincidncia do crossing-over serfundamental. Crossing-Over ou permuta a trocade partes entre cromossomoshomlogos durante a meiose e umdos principais fatores para avariabilidade gentica. 12. ComparaoDiibridismo/Linkage Diibridismo (AaBb) A aB b GametasAB A ba B ab25%25%25% 25% 13. Comparao Diibridismo/LinkageLinkage (AaBb)AaBbGametasA aA aB b b BParentaisRecombinantes 14. Genes Ligados - Linkage Na herana dos genes ligados, a freqncia dosgametas de um heterozigoto depende da taxa decrossing-over ou taxa de recombinao que ocorreentre os cromossomos homlogos. Os Gametas Parentais so formados mesmo que nohaja recombinao e aparecem em maior quantidade. Os Gametas Recombinantes so formados apenas sehouver permuta e aparecem em menor quantidade. A Taxa de Crossing expressa em porcentagem ecorresponde a freqncia de gametas recombinantesformados na gametognese. 15. Genes Ligados - Linkage Na vinculao gnica a posio dos genes noheterozigoto (AaBb) pode ser Cis ou Trans. Estas posies tambm podem ser utilizadas para sedefinir quem so os gametas parentais e osrecombinantes. A BAb a baB Posio CISPosio TRANS 16. Unidades deRecombinao (U.R.) Mapa gentico ou cromossmico a representao daposio dos genes no cromossomo. Est diretamente relacionada a taxa de crossing. Unidades de Recombinao (U.R.) ou Morgandeos (M) soas unidades usadas para determinar a posio dos genes nocromossomo e correspondem a taxa de crossing. Exemplo: Em um cromossomo h a seguinte freqncia derecombinao entre os genes A,B,C e D:A-B 45%A-C 20%C-B 25%B-D 5% C-D 20%A-D 40%Qual a posio dos genes no cromossomo? 17. Rearranjos de DNAA combinao particular de genes presentes num indivduo pode ser alterada por processos de recombinao.Recombinao geral ou recombinao homloga:Ocorre entre um par de seqncias homlogas de DNA,usualmente entre duas cpias do mesmo cromossoma.Recombinao homloga ocorre durante a meiose crossing over com troca se segmentos de DNA entrecromossomas materno e paterno.Recombinao homloga tambm essencial paraqualquer clula em diviso, para corrigir o DNA em locaisem h interrupo prematura do fork de replicao. 18. MAPAS DE LIGAO GENTICApai meA a aaB b bbR RA a a a a a Aa A ab b B b b b Bb B bfilho-1 filho-2 filho-3 filho-4filho-5Recombinantes = 2 em 5 meioses (40%), ou 40 cM 19. Como avaliar a taxa de recombinaao?A taxa de recombinao entre cromossomashomlogos (paterno e materno) analisada pelaidentificao individual de cada parental.Realizada por meio da identificao de loci quedemonstram variao polimrfica.Locus polimrfico aquele que apresenta muitosalelos diferentes, e o alelo menos freqente deve teruma freqncia superior a 1% na populao.Locus polimficos funcionam como marcadores.genticos 20. CaractersticasUm vez identificado os stios (loci) polimrficos numcromossomo, possvel verificar, analisando a prole, se houverecombinao entre dois stios especficos ou no.O indivduo informativo aquele que heterozigoto para osloci analisados. Isto feito tanto por meio da anlise depedigrees como de anlise da progenia proveniente decruzamentos controlados.A unidade padro de distncia gentica o centimorgan(Thomas Hunt Morgan): porcentagem da progenia na qual umevento de recombinao tenha ocorrido entre duas marcasgenticas. 21. Cromossomos individuais em muitas espcies animais tendem a tercerca de 100 cM de comprimento (100 x 106 pb)Assim, ocorre um crossover por cromossomo por gerao.Marcadores localizados em cromossomos diferentes tm 50% dechance de co-segregarem, estando a 50 cM de distncia.50 cM o limite mnimo para se caracterizar dois marcadorescomo pertencentes ao grupo de ligao (linkage group) ou aomesmo cromossomo.Ainda assim, possvel, dois marcadores que se recombinem em 50%das vezes podem estar no mesmo grupo de ligao, desde queestejam relacionados a um terceiro marcador que mostre menos de50% de recombinao com cada um dois primeiros marcadores. 22. Definies = theta= Freqncia de recombinao1 unidade de mapa = distncia entre osmarcadores que representam 1% derecombinaoUnidade de distncia gentica = centiMorgan(cM)1cM = 1% de recombinaao 1.000.000pb1 cM = 1Mb 23. Marcadores genticosConsiderados atributos do DNA: Uma seqncia especfica previamenteidentificada em um dado locus (sequence tags) Repeties simples (micro-satlites) Polimorfismo de restrio SNP 24. Mapeamento por bandeamento (Citogentica molecular)A citogentica clssica desenvolveu-se principalmente apartir do incio do sculo passado e seu progressoacompanhou o aprimoramento de tcnicas eequipamentos de microscopia. a cincia que estuda os constituintes celularesportadores da informao gentica (cromossomos).Compreende qualquer estudo relativo ao cromossomo,em suas diferentes formas, tanto no que diz respeito amorfologia, organizao, funo e replicao quanto notocante sua variao e evoluo. 25. Aplicaes dos Corpos coradoscorpos corados esto cada vez mais brilhantementecorados, em cores e pseudo-cores das mais variadas.A obteno de bons resultados depende do perfeito domnio dediferentes tcnicas de colorao.Na citogentica molecular, a anlise cromossmica tem sido degrande importncia para o entendimento da evoluo, genticae estabilidade cariotpica dos materiaisestudados.A implantao de tcnicas de bandeamento, que permitem avisualizao de blocos de colorao diferenciada (bandas). 26. Como fazer?Muitos corantes que tm uma afinidade pelo DNA, fluorescem sob aluz ultravioleta.Cada cromossomo mostra zonas brilhantes e escuras, ou bandas,que so especficas em tamanho e localizao.Tratamento com lcalis proporciona s clulas uma colorao densada regio do centrmero, e isto produz o bandeamento C, que especfico para heterocromatina constitutiva.A regio centromrica que inclui o DNA repetitivo, responde apenas tcnica de bandeamento C, assim como qualquer regio intercalarque contenha DNA repetitivoOs bandeamentos Q, G e C so especialmente importantes para acitogentica,porque permitem identificar pequenas variaesestruturais, como delees,duplicaes, inverses, geralmenterelacionadas com determinadas anomalias do desenvolvimento. 27. Mapa de bandeamento cromossmico(n = 2) em metafase, ilustrando o caritipo normal e de variaes numricas eestruturais No caritipo normal, com dois grupos de ligao (1 e 2):NOR: regio organizadora donucloloT: telmeroS: satlitep e q: braos dos cromossomasCada frmula cromossmicacontm primeiro o nmerototal de cromossomas, seguidode uma lista das anomalias,com os cromossomasidentificados pelos respectivosnmeros. 28. Mapa padro debandeamento de cadacromossomo docaritipo humanoBandas G se coramcom reagentesespecficos paraseqncias ricas emAT. 29. Mapeamento por restrioEnzimas nucleases degradam molculas deDNA quebrando ligaesfosfodister que ligam umnuclotideo ao outroExonucleasesEndonucleasesCortam em locaisespecficos 30. Mapa de restrio: Cartografia fsica5..GTPyPuAC..33..CAPuPyTG..55..AAGCTT..33..TTCGAA..5 31. Mapas de vetoresOs vetores so ferramentas utilizadas para introduo emanuteno de uma seqncia de DNA exgeno em um dadohospedeiro.As caractersticas mais importantes de um vetor verstil so:Fcil insero do DNA exgeno a ser clonado, devido presena de um polylinker ou poliligante que consiste emuma regio vetora que contm vrios stios nicos de cortepara enzimas de restrioPresena de genes que atuam como marca de resistncia aantibiticosHabilidade de expressar os genes exgenos inseridos nahospedeira e se necessrio, apresentar propriedades quefavoream a no proliferao ambiental do DNA exgeno 32. Vetor de clonagem precisa:Replicar em Escherichia coli (E. coli)Ser facilmente separado dos cidos nuclicos dabactria e purificadoConter regies de DNA no essenciais para apropagao em bactriaReceber o DNA exgeno nestas regies, replic-lo epropag-lo como um componente normal do vetorOs plasmdeos possibilitam a clonagem de segmentosde DNA com tamanhos variados, tornando-os vetoresde escolha para diversos procedimentos 33. Mapa de restrio do plasmdeo pEA1 34. Clonagem Posicional por mapaA clonagem posicional o mtodo de encontrar umgene sem nenhum conhecimento da protena que ocodifica. O primeiro gene humano de doenaidentificado pela clonagem posicional era um para adoena de abscesso crnico.As perturbaes em mais de um gene podem causar ofentipo de CGD, caracterizado pela presena dasleses inflamadas que contm clulas imunes aofagcito. Um grupo Boston Childrens Hospital isolou ogene de CGD em Xp21. Os genes para a distrofiamuscular de Duchenne e o retinoblastomaacompanharam rapidamente. 35. SequenciamentoMarcador molecularMapa fsicoSeleco dos clones com mnima sobreposioClones com minima sobreposio Dividir em subclones (shotgun clones)subclonesSequenciar 36. Posicionamento dos clones nosCromossomas 1. Seleco de marcadores STS de vrios mapas genticos ( Exemplo: GeneMap99, Gnthon) 2. Hibridao dos marcadores com as clones da biblioteca BAC por ePCR/FISH 3. Posicionamento de clones BAC no genomaResultado:Integrao do Mapa Fsico no Mapagentico 37. Verificando Posies cromossomais Ordem dos clones Ordem dos clones era compatvel com as As sondas utilizadas foram 96 sobreposies das sequncias dos mesmosclones BAC fingerprinted Duplicaes e repeties 87 hibridaram apenas com Segmentos duplicados de grandes dimenses (>150Kb)uma banda tem Gaps geralmente cromossmica grande N de bandas que so partilhadas ( >75%) nos seus padres de restrio Representatividade do genoma Curtas repeties em tandem (>100 kb) originam clones semelhantes a pequenos insertos e esto presentes em vrios clones diferentes (padro de restrio semelhante) O mapeamento por FISH estava em concordncia com as posies Cerca de 96% da sequencia dos #21atribudas pelos marcadores STS dos contguosO mapa Fsico de Restrio eclones com base e #22 est representada nos o mapaem STS so coincidentes na ordenao dos clones 38. centromericbreakpointMKRN3 (ZNF127)MAGEL2NDNC15ORF2SNURF / SNRPNmaternally imprintedHBII-13(genes active only onmale chromosome)HB2-85HB2-IPWPAR-1HB2-52paternally imprintedUBE3A-AS(genes active only on UBE3Afemale chromosome) PFATP GABRB3 GABRA5 GABRG3PHERC2 breakpointChromosome 15q11-q13 regiontelomeric 39. Mapeado o genoma do fermentoEm maio de 1996, a primeira seqncia completa do genomade um eucarionte - o fermento Saccharomyces cerevisiae - foiobtido.Quando a seqncia do genoma do fermento foi obtida, era omaior genoma sequenciado ate ento.Contm quase 12 milhes de pares base empacotados em 16cromossomos.O fermento tem aproximadamente 6.000 genes em tudo.Quase um tero destes genes so relacionados aos geneshumanos; sobreviveram com relativamente pouca alteraoatravs de um bilho anos da evoluo que separam os sereshumanos do fermento, sugerindo que realizam funesbsicas importantes na vida celular. 40. Genoma da Escherichia coliEm setembro de 1997, a seqncia completa do genoma daEscherichia coli foi publicada.As bactrias do E. coli vivem na regio intestinal mais baixados animais. uma das muitas bactrias que residem emnossos corpos, normalmente no causando nenhum dano.O genoma do E. coli consiste em aproximadamente 4.600.000pares bases e contm aproximadamente 4.000 genes. 41. Mapas fsicosMapas fsicos: a montagem de trechos contguos de DNAcromossmico, nos quais a distncia entre posies de seqnciasdefinidas de DNA expressa de kilobases. O mapa fsico final aseqncia completa.Montagem de mapas fsicos:- Alinhamento de clones isolados aleatrios com base em perfis defragmentos de restrio.- Abordagem baseada em hibridizaes: uma sonda comum usadapara identificar quais numa srie de clones so provavelmentecontguos.- Sequenciamento de diferentes fragmentos de DNA e organizaodos fragmentos pela anlise de superposies (contigs) - Contigs podem ser estendidos pelo sequenciamento daextremidade de clones especficos, levando identificao desequenced-tagged sites STSs. 42. Mapa fsico Genoteca de BAC/YACMapa 43. Mapa fsico versus mapa gentico 44. Arroz Humanos 45. Mapas RNAs ribossomais (rRNAs)so transcritos deconjuntos de arranjostandem de genesidnticos 46. Mapeamento do rDNArRNA so polimeros adequados para estudo de diversidadegenticaSeus genes so universalmente distribudos entre grupos deorganismosMolcula de maior grau de conservaoProporciona analise de filogenia molecular, de acordo com os nveistaxonmicos das espcies, permitindo a separao de espciesdistintas.So regies no DNA nuclear de sries repetitivas em tandem, detrs regies (18S, 5.8S e 28S) e duas regies espaadorasintergnicas (ITS e IGS). Os ITS1 e ITS2 so encontrados entre assubunidades: pequena (18S) e grande (28S). 47. ITS = Espao Interno Transcrito REGIES VARIVEISITS-1 ITS 1ITS 218S5.8S 28S ITS-4 REGIES CONSERVADAS 48. Mapeamento ribossmico (rDNA)Estrutura do cluster gnico que codifica para rRNA.As setas indicam as regies franqueadas pelos iniciadores ITS1 e ITS2 49. rDNAOutra poro do DNA repetitivo encontrado no nuDNARepresenta uma das maiores famlias de sequenciasrepetitivas n eucarioticosConstituda de trs genes: 18S, 5.8S e 26 SEstas unidades esto associadas s regies organizadorasdo nuclolo (NORs)NORs: pores de fibras cromatnicas ondee esto osgenes que codificam os rRNAsO nmero de NORs varia de espcie para espcie hibridizao in situ no reflete o nmero de nuclolos 50. O tamanho da unidade ribossomal, com espaos intergnicos, varia de 7,8kb a 18,5 kb, com numero de cpias que pode variar de 600 a 8500 porgenoma haplide A unidade ribossomal constituda pelos genes 18S, 5,8S e 28S e dos espaadores transcritos internos (ITS) que intercalam os genes. A sigla IGS indica o espao intergnico, o qual separa as unidades ribossomaisOs genes do RNA ribossomal 5s (5S rDNA) varia de 140 a 900pb, cadaunidade de repetio pode variar de 1 mil a 50 mil cpias por genomahaplideO gene 5S altamente conservado em seqncias e tamanho 120pbEm plantas as seqncias ITS variam em comprimento de 500-700pb emangiospermas e 1500-3700pb em algumas gimnospermas 51. Fluorescncia nos stios de rDNA em trs espcies de arrozrgp.dna.affrc.go.jp/.../ nl4.html 52. Mapeamento por FISHHibridizao in Situ (HIS) um mtodo empregado para avisualizao de seqncias definidas de cidos nuclicos, empreparaes celulares, atravs da hibridao de seqnciascomplementares (sondas).In situ significa no local original em LatinEnvolve uma sonda de cido nucleico marcada com um sequenciade DNA ou RNA hibridizando com DNA ou RNA in situ (nas clulas)Localizao da sequencia de interesse clula, tecido oucromossomoUsada no mapeamento de genomas de plantas, na deteco deseqncias nicas e, principalmente, de seqncias de DNArepetitivo. 53. O cromossomo metafsico tpico formado por duas cromtides irms,uma delas oriunda do processo deduplicao da cromatina.Esse mtodo, descrito por Pardue eGall (1969), permite a deteco deseqncias especficas emcromossomos metafsicos, bemcomo em ncleos interfsicos. Atcnica proporciona a interaoentre conhecimento da biologiacelular, citogentica clssica egentica molecular e 54. Princpio do mtodo:Durante a diviso celular, os cromonemasespiralizam-se, tornando-se mais curtos emais grossos. Podem, ento, ser vistosindividualmente e passam a ser chamadosde cromossomos, este est relacionado comcromossomos mitticos metafsicosO material gentico descondensado cromatina - ativo, pois pode ser transcritomais facilmente nesse estado. 55. VisualizaoMicroscopia ptica mais comum, usados para sondas marcadasradiativamente ou marcados com peroxidase ou fosfatase alcalinaMicroscpio Fluorescence sondas marcadas com fluorescencia, luz UV excitaa fluorescncia FISH (do ingls, fluorescent in situ hibridization) Identificao especifica em dois cromossomos: cromossomo 2 marcado com green cromossomo 4 marcado com orange. 56. Aplicaes1.Obteno de mapas fsicos,funcional e estrutural do genoma2.Determinar a distribuio e posiode material cromossomo extra-especifico3.Determinar a existncia depareamento e recombinaointergenmica4.Determinar a existncia desegregao preferencial(responsvel pela herana nomendeliana de alguns tipos decromossomos)5.Determinar a presena e tipo derearranjos cromossmicos 57. Hibridizao comparativa genmica GISH (Genomic in situ hibridization)DNA total genmico marcadas comDNA total genmico marcadas combiotina de clulas para anlise biotina de clulas normais (DNA(DNA teste) controle) marcado com digoxigenina Co-hibridizao A partir do Resulta em sinal normal do cromossomo (caritipo DNA:parcial)Sinais a partir Dna teste Sinais a partir da co-hibridizao hibridizado do DNA controle 58. Mapeamento de OrganelasMitocnndria e cloroplastos possuem genomas que noapresentam herana Mendeliana.Genomas de organelas realizam segregao somtica emplantasGenomas de organelas so DNAs circulares que codificam asprotenas das organelasFormado, geralmente, por molculas circulares de DNAuma organela apresenta vrias cpias de seu genomaGenomas de cloroplastos so relativamente grandesComparaes de DNA mitocondrial sugere que os sereshumanos descendem de uma nica fmea que viveu a 200.000anos na frica 59. Mapeamento Mitocondrial 60. mitocondrias mostram tamanhos variados de genoma o nmero de genes codificadores de protenas pequeno a maior parte codificadora de componentes das subunidades dos complexos da respirao I-IV genes codificadores de RNAGenoma mitocondrial apresenta introns, exceto nosmamferos 61. Organizao do DNA mitocondrialDNA mitocondrial de clulasanimais compacto e codifica 13protenas, 2 rRNAs e 22 tRNAsno h intronsalguns genes se sobrepem asprotenasesto envolvidas na respiraomtDNA de levedura 5x maiordo que o animal devido presena de longos intronsocorre maior disperso de loci 62. Genoma VegetalOs vegetais so constitudos de trs genomas: genomasGenoma nuclear 90%Genoma plastidial ou cloroplasmtico - 5%Genoma mitocondrial 1% 63. Organizao do genoma mitocondrial: mtDNAs ocorrem em todas as clulas eucarticas aerbicas e gera energia paraproduzir ATP pela fosforilizao oxidativa A maioria dos genomas mtDNA genomes so circulares (mtDNAs ocorre emalguns protozoarios e alguns fungos). Em algumas espcies a %GC alta, de facil separaao do mtDNA puro a partirdo DNA nuclear por gradiente centrifugao. Multiplos genomas por mitocondrias e muitas mitocondrias por celulas (facilisolamento por PCR). Tamanho do genoma de mtDNA varia: Humanos e outros vertebrados ~16 kb(todo o mtDNA codifica produtos gnicos) Leveduras ~80 kb Plantas ~100 kb to 2 Mb(perdas de mtDNA no codificante) 64. Marchantia polymorpha 121Kb136 genes: 4 rRNA, 29tRNA90 genes codificadores deprotenas - destes 20 estoenvolvidas no transporte deeltrons durante a fotossntese 65. Genoma nuclearParadoxo do valor C (DNA haplide) = pares de baseNo existe correlao entre o tamanho do nuDNA e onmero de genesAngiospermas 80% do nuDNA DNA repetitivoCorrelao positiva entre a quantidade de seqncias deDNA repetitiva em um genoma e sua quantidade de DNA 66. O tamanho do DNA nuclearPlantas superiores - 1,1 x 106 pb a 1,1 x 1011pbAngiospermas 3 x 108 a 1 x 1011pbOcorre um incremento na escala evolutivaRNA associado a cromatina (RNA nascentes, presos a fita molde)representa 3% de sua composioOs genomas nucleares das angiospermas encontram-se entre os maioresconhecidos.O genoma nuclear de Arabidopsis thaliana tem 125Mb que compreendem25.498 gens.Do arroz (Oryza sativa) tem se seqenciado duas variedades e seugenoma quase 4 vezes maior que o de A. thaliana e compreendem de32.000 a 55.615 genes.Para o milho (Zea mays), embora no seqenciado, se conhece muitainformao estima-se que 60 a 80% de seu genoma nuclear estaconstitudo por elementos mveis 67. Organizao do genoma nuclear 68. Genoma do cloroplastoCodifica vrias protenas e RNAsCloroplastos apresentam DNA com tamanho variado:120-190 kbCodifica todos os rRNAs e tRNAs necessrios para a snteseprotica, e aproximadamente 50 protenasOs genes da organela podem ser transcritos e traduzidospelo aparato da mesma 69. O genoma cloroplastoSequencia no genomavaria de 70kb - 201kbVariao no comprimetnoprincipalmente apresena de reperiesinvertidas (RI)100-250 genes: Gene expressos Fotossntese 20 genes Metabolismo 70. Genes perdidos na evoluo dos cloroplastosZea (75)5 (2)1 (0)Oryza (75) 45 genes presentes4 (0)Nicotiana (76) em todos os genomas7 (5) 12 (0)Pinus (69) Confirmao que129 (34)1 (0)Marchantia (84)genoma dos34 (9)14 (14)Euglena (58)plastideos ancestral 1 (0)Ancestralplastidio 20 (1) 77 (0)Porphyra (200) foi altamente reduzidoOdontella (124) (( 235)99 (3) das cianobacterias Cyanophora (136) 71. Genes do cloroplastoLand Plants AlgaePhotosyn.Epifagus Euglena OthersPorphyraTotal 101-107 4082113-166 181Gene expressionrRNA44 3 3 3tRNA 30-321727 28-3635r-protein 2-211521 21-4447Other5-6 2 46-9 18PhotosynthesisRuBisCo/thylakoid29-30- 26 31-4853ndh 11---/10 -Metabolism/misc.1-5 2 17-14 25Introns18-216 149+ -/1/3 - 72. Contedo de tRNA no genomamitocondrial em diferentes espcies 73. Plantas Modelos para estudos genmicos Arabidiopsis thaliana --model flowering plant and dicot Oryza sativa (rice) --model monocot Medicago truncatula (barrel medic) --model legume Lycopersicon esculentum (tomato)--model fruit-bearing plantAlso maize, tobacco, Chlamydomonas, wheat, etc. 74. Arabidopsis thaliana Modelo de genoma em plantasA. thaliana membro da familia dasBrassicaceae (mostardas) .Genoma: 125 Mb (muito pequeno parauma planta).Trigo: 16,5 Gb, Soja: 5 Gb.Cromossomas: 5Genes: 25.498 (comparvel ao humano)Website: http://www.arabidopsis.org