ugljikohidrati i glikoliza - pmf naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza...

20
1 1 Ugljikohidrati i glikoliza Seminar 11b 2 1. Suspenzija stanica kvasca uzgajana je u anaerobnim uvjetima te se glukoza fermentirala u etanol i CO 2 . Ako se želi promatrati količina 14 CO 2 , na kojem mjestu je potrebno ugraditi 14 C u glukozu? a) Na ugljicima 1 i 6; b) Na ugljicima 3 i 4; c) Na ugljicima 3 i 6. 2. Ako se u gore navedenu suspenziju doda inhibitor alkohol dehidrogenaze, stanice će umirati zbog toga što: a) Piruvat se neće sintetizirati pa neće biti preteče za sintezu glukoze te će stanice ostati bez energije; b) Mora se dodati još ATP kako bi započela razgradnja glukoze u ovim uvjetima. c) NAD + koji je potreban za odvijanje glikolize se ne obnavlja te je cijeli proces zaustavljen i ne dolazi do sinteze ATP.

Upload: others

Post on 31-Oct-2019

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

1

1

Ugljikohidrati i glikolizaSeminar 11b

2

1. Suspenzija stanica kvasca uzgajana je u anaerobnim uvjetima te se glukoza fermentirala u etanol i CO2. Ako se želi promatrati količina 14CO2, na kojem mjestu je potrebno ugraditi 14C u glukozu?

a) Na ugljicima 1 i 6;b) Na ugljicima 3 i 4;c) Na ugljicima 3 i 6.

2. Ako se u gore navedenu suspenziju doda inhibitor alkohol dehidrogenaze, stanice će umirati zbog toga što:

a) Piruvat se neće sintetizirati pa neće biti preteče za sintezu glukoze te će stanice ostati bez energije;

b) Mora se dodati još ATP kako bi započela razgradnja glukoze u ovim uvjetima.

c) NAD+ koji je potreban za odvijanje glikolize se ne obnavlja te je cijeli proces zaustavljen i ne dolazi do sinteze ATP.

Page 2: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

2

3

3. Mutant kvasca ima defektnu triozafosfat izomerazu koja je katalitički inaktivna. Što od navedenog očekujete u anaerobnim uvjetima?

a) Omjer sintetiziranog ATP/razgrađena glukoza biti će identičan kao i u normalnim stanicama;

b) Omjer sintetiziranog ATP/razgrađena glukoza biti će ½onoga što se inače dobiva u normalnim stanicama.

c) Omjer sitetiziranog ATP/razgrađena glukoza biti će nula.

4. Mehanizam glceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze ne uključuje:

a) Fosforilaciju supstrata s ATP;b) Oksidaciju i fosforilaciju supstrata;c) Kovalentni međuprodukt.

4

5. Iako je glukoza glavni šećer koji se razgrađuje glikolizm, drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri:

a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim putem;b) Moraju se prvo pretvoriti u glukozu kako bi se metabolizirali;c) Metaboliziraju se glikolitičkim putom zbog toga što se

pretvaraju u međuprodukte ovog puta.

6. Tri glavna regulacijska enzima u glikolitičkom putu su:a) heksokinaza, fosfofrukto-kinaza i piruvat kinaza;b) fosfofrukto-kinaza, gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza i

piruvat kinaza;c) heksokinaza, fosfofrukto-kinaza i gliceraldehid-3-fosfat

dehidrogenaza.

Page 3: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

3

5

7. Koji enzim glikolitičkog puta cijepa šećer sa šest C-atoma na dva produkta od 3-C atoma?

a) fosfogluko-izomeraza;b) enolaza;c) aldolaza.

8. Koji od navedenih nisu produkti glikolize ako se glukoza razgrađuje do piruvata?

a) 2 ATPb) 2 NAD+

c) 2 H2O

6

9. Galaktozemia nastaje kao nedostatak kojeg enzima?a) Galaktokinazeb) Glukoza-1-fosfat-uridil transferazec) Laktaze.

10. Koja je od navedenih molekula uključena u proces kojeg nazivamo stimulacijom prema naprijed?

a) fruktoza-2,6-bisfosfatb) HIF-1c) inzulin

Page 4: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

4

7

Monosaharidi• Monosaharidi – najjednostavniji ugljikohidrati. To su aldehidi ili

ketoni s 2 ili više hidroksilnih skupina• Najmanji n = 3 (TRIOZE) i to su gliceraldehid i

dihidroksiaceton• Aldoze – sadrže aldehidnu skupinu• Ketoze – sadrže keto-skupinu

8

• Općenito, molekula s n asimetričnih centara ima 2n

stereoizomernih oblika. Za npr. aldotrioze n = 1 i postoje 2 stereoizomera D- i L-gliceraldehid. Oni su enantiomeri(zrcalne slike)

CCH2OH

H OHC

HO1

2

3

D-gliceraldehid

Stereoizomeri

Page 5: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

5

9

Niz D-aldoza

10

Niz D-ketoza

Page 6: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

6

11

ANOMERI su oblici istog šećera koji se razlikuju pokonformaciji na anomernom atomu ugljika.

Anomerni ugljik je onaj ugljik koji je u necikličkom (linearnom) obliku šećerau sastavu aldehidne ili keto-skupine. U aldozama to je C1, a u ketozama C2. Na anomernom ugljiku zbiva se nukleofilna adicija prilikom ciklizacije šećera. Kod glukoze:

C

CH2OH

H OHOH HH OHH OH

HO

D-glukoza

C

OH H

O

CH2OH

HH

OH OH

H

H

OH

C

O HCH2OH

HH

OH OH

H

H

OHOH

C

O OHCH2OH

HH

OH OH

H

H

OHH

α-D-glukopiranoza

β-D-glukopiranoza

α-anomer je onaj kod kojeg se OH-skupina anomernog ugljika i najvećisupstituent na ostatku prstena(ovdje CH2OH na C5) nalaze nasuprotnim stranama prstena. Kod β-anomera ove dvije skupinesu na istoj strani prstena.

12

Page 7: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

7

13

EPIMERI: dva šećera su epimeri ako se razlikuju po konfiguraciji na samojednom asimetričnom ugljiku koji nije anomerni.

L-ŠEĆERI su zrcalna slika odgovarajućih D-šećera. U usporedbi s D-šećerimaistog naziva imaju suprotnu konfiguraciju na svim kiralnim centrima.

C

C H 2 O H

H O HOH HH O HH O H

HO

D -g lu k o za

C

C H 2 O H

OH HOH HH O HH O H

HO

D -m a n o za

C

C H 2 O H

H O HOH HOH HH O H

HO

D -g a la k to zaC 2-e p im e r D -g lu ko ze C 4-e p im e r D -g lu ko ze

C

C H 2 O H

H O HOH HH O HH O H

HO

D -g luk o za

C

C H 2 O H

OH HH O HOH HOH H

HO

L -g luko za

14

Disaharidi

• Dva šećera povezana O-glikozidnom vezom

Page 8: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

8

15

Polisaharidi (glikani)• Monosaharidi povezani

glikozidnim vezama, linearni ili razgranati jer se glikozidna veza može ostvariti s bilo kojom hidroksilnom skupinom monosaharida

-Celuloza - β(1-4) – polimer glukoze

-Škrob - α(1-4) i α(1-6)

-Glikogen - α(1-4) i α(1-6)

16

Izračunajte ukupni oksidacijski broj ugljika u:

a) glukozib) piruvatuc) laktatud) glicerolu

Zadatak 1.

Page 9: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

9

17

• Oksidacijski broj svakog pojedinog atomaugljika računa se kao u anorganskimspojevima, osim što se C-C veze ne računaju:

a) Glukoza: ukupni oksidacijski broj je 0.

CCCCCCH2OH

H OHOH HH OHH OH

HO +1

-1

0

0

0

0

Rješenje

18

CCCH3

O O

O

piruvat

laktat-dehidrogenaza

NAD+NADH + H+

CCCH3

O O

HOH

laktat

b) Piruvat: ukupni oksidacijski broj je +2.

Iz ovoga rezultata vidimo da se pri pretvorbiglukoze (0) u dva piruvata (+4) ugljikov skeletukupno mora oksidirati tj. izgubiti 4 elektrona. To se zbiva u jedinoj redoks-reakciji glikolizekoju katalizira gliceraldehid-3-fosfat-dehidrogenaza. Svaka molekula NAD+ pri tome prima po jedan par elektrona.

CCCH3

O O

O

+3

-3

+2

Rješenje

Page 10: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

10

19

c) Laktat: ukupni oksidacijski broj je 0.

Mliječno kiselo vrenje u sumarnoj reakciji ne dovodido neto oksidacije niti redukcije bilo kojegmetabolita. Svrha njegove posljednje reakcije, kojukatalizira laktat-dehidrogenaza, je regeneracijaNAD+ utrošenog u reakciji gliceraldehid-3-fosfat-dehidrogenaze. Ovom regeneracijom održava se konstantan omjer NAD+/NADH, neophodan zaodvijanje glikolize.

d) Glicerol: ukupni oksidacijski broj je -2.

CCCH3

O O

HOH

+3

-3

0

CH2OHCHOHCH2OH

-1

-1

0

CCCH3

O O

O

piruvat

laktat-dehidrogenaza

NAD+NADH + H+

CCCH3

O O

HOH

laktatRješenje

20

Glikoliza

Page 11: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

11

21

22

Page 12: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

12

23

24

Zadatak 1.

Dodamo li glukozu obilježenu s 14C na C-1 u sustav u kojem se odvija glikoliza, koji će atomi biti obilježeni u:

a) piruvatu

b) laktatu (u mišiću)

c) etanolu (u kvascu)

Page 13: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

13

25

C

C

C

C

CCH2OH

H OH

OH H

H OH

H OH

HO

C

C

CH3

O O

O

C

C

CC

CCH2O

H OH

OH HH OH

H OH

HO

P

CH2OH

C

CC

CCH2O

O

OH HH OH

H OH

P

CH2OC

CCC

CH2O

O

OH HH OHH OH

P

P

CH2O

C

CH2OH

OP

C

C

CH2O

O H

H OH

P

CC

CH2O

O O~

H OH

P

PC

C

CH2O

O O

H OH

P

CC

CH2OH

O O

H O P

C

C

CH2

O O

O P

glukoza glukoza-6-fosfat fruktoza-6-fosfat fruktoza-1,6-bisfosfat

dihidroksiaceton-fosfat

gliceraldehid-3-fosfat 1,3-bisfosfoglicerat3-fosfoglicerat 2-fosfoglicerat

fosfoenolpiruvpiruvat

ATP ADP ATP ADP

ADP ATP

ADP ATP

+Pi +NAD+

NADH+ H+ H2O

* * * *

*

* * * *

* *

Rješenje

26

CCCH3

O O

O

piruvat

NAD+NADH + H+

CCCH3

O O

HOH

laktat* *

CCCH3

O O

O

piruvat

NAD+NADH + H+

CH2OHCH3

etanol

CCH3

O H

acetaldehid

CO2

* * *

Rješenje

c) etanol nastaje iz piruvata na sljedeći način

b) laktat nastaje iz piruvata na sljedeći način

Page 14: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

14

27

Zadatak 2.

Anorganski fosfat označen s 32P dodan je s glukozom u stanični ekstrakt jetre te je inkubiran bez prisutstva kisika. Nakon kratkog vremena 1,3-BPG izolirate iz smjese. Na kojim ugljicima očekujete pronalazak radioaktivnog fosfata? Ukoliko inkubirate kroz duže vrijeme, hoće li se mjesto obilježavanja promijeniti? Zašto?

28

Rješenje:

Nakon kratke inkubacije, označeni fosfat se pojavljuje na C-1 1,3BPG-a. Anorganski fosfat ulazi u glikolizu u koraku kataliziranom s gliceraldehid 3-fosfat dehidrogenazom:

Nakon duže inkubacije, radioaktivna oznaka će biti na C-1 i C-3 1,3-BPG-a jer korak poslije nastajanja 1,3-BPG-a uključuje fosforilaciju ADP-a u ATP, koji će biti radioaktivno obilježen na γ - položaju:

Page 15: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

15

29

U drugim glikolitičkim reakcijama, radioaktivni ATP može fosforilirati C-1 fruktoza 6-fosfata i C-6 glukoze, oba su ekvivalenta C-3 u 1,3-BPG-u.

30

Kod anaerobne degradacije glukoze preko glikolize, ukupno ne dolazi do oksidacije ili redukcije supstrata. No, slobodna energijapotrebna za sintezu ATP-a dolazi iz povoljnih reakcija transferaelekrona. Koji metabolički intermedijer je elektron donor, a koji je elektron akceptor kad je glukoza razgrađena glikolitičkomfermentacijom:

a) u mišiću

b) u kvascu

Zadatak 3.

Page 16: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

16

31

32

Rješenje

a) Elektron donor je GAP čija se aldehidna skupina oksidira u karboksilnu (1,3-BPG). Elektron akceptor je piruvat čija ketonskaskupina se reducira u hidroksilnu skupinu laktata.

b) Elektron donor je ponovno GAP. Elektron akceptor je acetaldehidkoji se reducira u etanol.

Page 17: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

17

33

Zadatak 4.

U staničnim uvjetima, koje su reakcije glikolize gotovo ireverzibilne?

34

Rješenje zadatka 4.

- Prevorba glukoze u glukoza-6-fosfat pomoću heksokinaze;

- Pretvorba fruktoza-6-fosfata u fruktoza-1,6-bisfosfat pomoću fosforukto kinaze;

- Pretvorba fosfoenolpiruvata u piruvat pomoću piruvat kinaze.

Page 18: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

18

35

Zadatak 5.

Zbog čega je za mišić povoljno da izlučuje mliječnu kiselinu u krv tijekom intezivnog vježbanja?

36

Rješenje zadatka 5.

Mliječna kiselina je jaka kiselina. Ukoliko bi ostala u stanici, pH stanice bi se smanjio te bi moglo doći do denaturacije proteina a time i do oštećenja mišića.

Page 19: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

19

37

Zadatak 6.

Koja je fiziološka prednost za pankreas da ima transporter glukoze, GLUT2 s velikom KM?

38

Rješenje zadatka 6.

GLUT2 transportira glukozu kada je koncentracija glukoze u krvi visoka, a to je upravo koncentracija kod koje β-stanice pankreasa izlučuju inzulin.

Page 20: Ugljikohidrati i glikoliza - PMF Naslovnica · drugi šećeri kao što su galaktoza i fruktoza često su prisutni u krvi. Ovi šećeri: a) Ne mogu se metabolizirati glikolitičkim

20

39

Zadatak 7.

Predvidite utjecaje sljedećih mutacija na odvijanje glikolize u stanicama jetre:

a) Gubitak alosteričkog mjesta vezanja za ATP na fosfofruktokinazi;

b) Gubitak veznog mjesta za citrat na fosfofruktokinazi;c) Gubitak fosfatazne domene na bifunkcionalnom enzimu

koji kontrolira razinu fruktoza-2,6-bisfosfata;d) Gubitak veznog mjesta za fruktoza-1,6-bisfosfat na

piruvat kinazi.

40

Rješenje zadatka 7.

a) Povećanjeb) Povećanjec) Povećanjed) Smanjenje