thl bakteeri-infektiot-yksikkö helsinki

Bakteeri-infektiot-yksikkö

Helsinki

Toiminnan kohteet

Avoimet ovet 2015

Vakavia yleisinfektioita aiheuttavat hengitystiebakteerit Pneumokokki

Meningokokki

Hemofilus

Legionella

Suolistoinfektioita, ruokamyrkytyksiä ja zoonooseja

aiheuttavat bakteerit EHEC (+ muut enteropatogeeniset E. colit)

Salmonella

Shigella

Listeria

Vibrio cholerae

Kampylobakteerit, Yersinia, C. difficile, C. perfringens

2 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Toiminnan painopisteet

Erikoistason bakteriologiset

laboratoriotutkimukset

Epidemioiden havaitseminen ja

selvittäminen

Kantatyyppien trendiseuranta

Kansallisen rokotusohjelman vaikuttavuuden

seuranta

Yhteistyö ja verkostot kansallisella ja

kansainvälisellä tasolla

Tutkimus- ja kehittämistyö

Avoimet ovet 2015 3 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 4

Erikoistason bakteriologiset

laboratoriotutkimukset

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 5

Perinteiset fenotyypitysmenetelmät

2.2.2015 5 29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 6

DNA-pohjaiset tyypitysmenetelmät

Menetelmiä n. 80 kpl

Määrityksiä n. 17 000/vuosi

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 7

Kokogenomin sekvensointi

2.2.2015 7

Vaiheittainen käyttöönotto 2015-2017

Pystytys, validointi, harmonisointi, akkreditointi

Tavoitteena korvata suuri osa perinteisistä

menetelmistä

Ensi vaiheessa: EHEC, Listeria, Meningokokki,

epidemiat

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 8

Potilas- ja löydöstiedot lähetelomakkeesta Tehtyjen määritysten tulokset

Noin 19 000 DNA-profiilia

LABORATORIOTIETOJÄRJESTELMÄ

KANTOJEN DNA-PROFIILIKIRJASTO

Tietojärjestelmät

NÄYTEHALLINTAJÄRJESTELMÄ

Tiedetään mitä kantoja säilötty -70ºC ja missä

ne sijaitsevat

TTR

TESSy /

ECDC

29.1.2015

Muutoksia tyypityksissä 2014, 2015

Avoimet ovet 2015

Tyypitykset osin otospohjaisesti

Vain kotimaiset tartunnat: Salmonella, Shigella

Ikäperusteisesti: Pneumokokki

Vain epidemia-/erityistilanteissa

Yersinia, C. difficile

9 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 10

Epidemioiden havaitseminen ja

selvittäminen

29.1.2015

• 2012 epätavallisen suuri lkm. huhti-toukokuussa

– valtaosin kotimaisia

• normaalisti 0-10 /vuosi

– yl. ulkomaan matkailijoilla

• tyypitys

– Antibiooteille herkkiä

– DNA-profiilit identtiset

0

5

10

15

20

19

88

19

90

19

92

19

94

19

96

19

98

20

00

20

02

20

04

20

06

20

08

20

10

20

12

epidemiaselvitys - syvähaastattelut (epidemiologit)

- vertailu elintarvikekantoihin (Evira)

- ECDCn kautta kansainvälinen kysely

Seurantatieto tärkeä epidemian havaitsemiseksi Salmonella Isangi

Avoimet ovet 2015 11 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 12

o 5 Salmonella-epidemiaa

o 1 EHEC-epidemia, 10 perheryvästä

o 3 Listeria-ryvästä

o 1 Yersinia pseudotuberculosis

o 1 C. difficile osastoepidemiaepäily

Kotimaiset epidemiat/epidemiaepäilyt

2014

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 13

EPIS-kyselyt

2014, 45 kpl

Suomesta yksi EHEC-kysely

Epidemic Intelligence Information System, ECDC

29.1.2015

14

The European Surveillance System

Vuodesta 2007, tapauskohtainen datan keruu

Molecular Surveillance Pilot, vuodesta 2012

Fenotyyppidata

Mikrobilääkeherkkyys

Genotyyppidata

Mahdollistaa Euroopan laajuisen tautiseurannan

Suolistobakteerit: mahdollisuus yhdistää eri maiden

yksittäiset tapaukset kansainväliseksi epidemiaksi

TESSy-tietokanta

MTCI 15 kpl 2014

4 Listeria monocytogenes

11 Salmonella

Avoimet ovet 2015 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 15

Kantatyyppien trendiseuranta

29.1.2015

Seroryhmä B-kannat, 2010

4

2

111

1

1

1

11

B:P1.7-2,4:F1-5

B:P1.22,14-6:F1-5

B:P1.12-1,9:F1-5

B:P1.17,16-3:F5-5

B:P1.18-1,34:F4-1

B:P1.18,25-11:F1-23

B:P1.19,13-1:F5-1

B:P1.5-1,10-4:F1-5

B:P1.7-12,14:F1-7

B:P1.7-2,10-7:F1-23

Seroryhmä B-kannat, 2011

10

2

2

1

1

1

11

B:P1.7-2,4:F1-5

B:P1.19,15:F5-9

B:P1.7-12,14:F1-7

B:P1.18,25-11:F1-23

B:P1.22,14:F5-5

B:P1.5,10-1:F4-1

B:P1.7-2,10-7:F1-23

B:P1.7,16:F3-3

Meningokokki ryhmä B Serotyypitys porA – fetA genotyypityksellä

Seurantatieto tärkeää trendimuutosten havaitsemiseksi

Avoimet ovet 2015 16 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 17

Kansallisen rokotusohjelman vaikuttavuuden

seuranta

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 18

Pneumokkikonjugaatti-rokotusohjelman vaikutus lasten vakavaan pneumokokkitautiin

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 19

Yhteistyö ja verkostot kansallisella ja

kansainvälisellä tasolla

29.1.2015

Kuntien mikrobiologiset laboratoriot

Zoonoosikeskus

INBA, Hki

WHO: Global Foodborne Infections Network

Muut THL:n

yksiköt

Yliopistot FiRe

Aluehallinto

virastot

STM

Avoimet ovet 2015 20 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 21

Tutkimus- ja kehittämistyö

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 22

Tutkitaan pneumokokkikonjugaattirokotteen

vaikutusta lasten pneumokokkikantajuuteen

rokotetuilla lapsilla

rokottamattomilla sisaruksilla

Rokotuksen suorat ja epäsuorat

(laumaimmuniteetti) vaikutukset

Jatkoa aiemmalle kantajuustutkimukselle 2011

Bakteriologiset työt INBA:ssa

Ensimmäiset tulokset loppuvuodesta 2015

Pneumokokki: FinIP-kantajuustutkimus

n = 3900

29.1.2015

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 23

Meningokokki

• Meninkokkien tautitaakka varusmiehillä 2002–2013

• Yhteistyötutkimus Puolustusvoimien kanssa

• Varusmiehillä suurentunut riski sairastua B-ryhmän

meningokokin aiheuttamaan vakavaan yleisinfektioon muuhun

väestöön verrattuna (Suomen Lääkärilehti 3-4/2015)

• Meningokokki B rokotteiden kantakattavuus

• Kuinka hyvin uudet B-ryhmän meningokokin aiheuttamaa

tautia vastaan suunnatut proteiinirokotteet antavat suojaa

Suomessa kiertäviä invasiivisia kantoja vastaan?

29.1.2015