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Beckman Coulter, Inc4300 N. Harbor Boulevard, Fullerton, CA 92834-3100

Copyright © 10/19/06 Beckman Coulter, Inc. Printed in U.S.A.

Biomek® FX 型与 FXP

型实验室自动化工作站

3.3 版自学教程

Beckman Coulter PN A43096修订版 AA

2006 年 8 月

ii

Beckman Coulter, Inc.

除非如经 Beckman Coulter, Inc. 领导签署之书面文件所规定，本系统及任何相关说明文件均以“按现状”方

式提供，无任何种类之明示或默示保证，包括系统“无差错”之保证。本信息系真诚提供，但就本系统之

使用或使用结果及相关说明文件之正确、准确、可靠、现时有效、遗漏或其他，Beckman Coulter, Inc. 不作

保证、担保或任何声明。本系统及相关说明文件之使用、结果及性能之全部风险由用户承担。

除非如于此所明文规定，Beckman Coulter, Inc. 不就任何事项作出任何其他口头或书面、明示或默示保证，

包括但不限于涉及适销性和特定目的适用性之保证，亦无由 Beckman Coulter, Inc. 或任何他人拥有之专利推

断的自由。

赔偿责任限制

对于由本系统和相关说明文件或本手册中指定之程序的使用或性能而导致或造成之任何损害，无论可预见

性或诉讼形式，是否因合同、侵权行为（包括疏失）、违背保证、后果责任或其他，并且包括但不限于由

数据损失或预期利润之损失而导致的损害，或任何特殊、间接、附带或间接损害，Beckman Coulter, Inc. 在无论任何范围内不负任何赔偿责任。在任何情况下，Beckman Coulter, Inc. 对用户之赔偿责任不得超出该用

户据此向 Beckman Coulter, Inc. 已支付之金额。用户对使用本系统和相关说明文件获得之结果和该等结果之

应用承担全部责任。

Beckman Coulter, Inc.美国印地安纳州印地安纳波利斯市

www.beckmancoulter.com

Biomek、 SAMI、 Orca、 Beckman Coulter 徽标均为 Beckman Coulter, Inc. 的注册商标， Beckman Coulter 和SAGIAN 均为 Beckman Coulter, Inc. 的商标。

Microsoft 和 MS-DOS 均为 Microsoft Corporation 的注册商标，Windows 为 Microsoft Corporation 的商标。本

手册中出现的所有其他商标均由其相应公司拥有。

© Beckman Coulter, Inc. 版权所有，2006 年。保留一切权利。未经 Beckman Coulter, Inc. 预先书面许可，本出

版物之任何部分均不得以任何形式或用任何手段，电子、机械、复印、录音或其他，复制、分发或转送，

或存储在数据库或检索系统中。

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Biomek® FX 型与 FXP 型实验室自动化工作站

保证和货物退还规定

Beckman Coulter, Inc. 辖制货物退还之所有标准方针均适用于本产品。除下述

例外情况外，在满足下述条件之前提下，本公司保证依本销售协议出售之产品

在本公司向原始买方交货后一年内无工艺与材料缺陷，并且倘若任何此等产

品在此一年期内经证实存在缺陷，本公司同意依其选择，要么 (1) 通过修理或

依本公司选择通过更换来纠正任何此等有缺陷产品，前提为经调查和工厂检

查发现此等缺陷系于正常且适当使用中产生，或者 (2) 退还购置价格。前述例

外情况与条件如下：

a: 本公司制造之部件或附件，若因其性质关系未意图为且不会工作达一

年之久，则只在合理时期中保证合理使用。何谓合理时间与合理使用

由本公司独自决定。工厂备有该等部件和附件之完整清单。

b: 本公司对非由其制造之部件或附件不作任何保证。倘若任何此等部件

或附件出现缺陷，本公司将为获得制造商自己之保证服务，给予买方

合理协助。

c: 任何声称为有缺陷之产品，倘若为本公司所要求，均必须预付运费退

回至工厂，并且将以对方支付运费之方式发还给买方；除非该产品经

确认存在缺陷，在此情况下该产品必须就任何化学、生物或放射性危

险材料得到适当净化。

d: 倘若据此保证之产品曾由并非本公司自己之特许维修人员的他人加以

修理或更改，则除非该他人进行之修理系依本公司之书面同意而进

行，本公司不必继续承担依据所有保证蜒无论明示或默示蜒之全部

义务。

e: 倘若该产品为试剂或类似物品，则只就交货时于标签上声明之期限

（但不超过一年）保证符合标签上声明之数量与内容。

各方明确同意上述保证须取代对适用性之所有保证和对适销性之保证，并且

本公司对由依本销售协议出售之任何产品的制造、使用、销售、搬运、修理、

维护或更换而导致之无论何种类型或出自任何原因的特殊或后果损害赔偿均

不负责。

由包括本公司经销商和代表在内之任何人所作的任何声称或保证，倘若与本

保证之条款不一致或冲突，除非已写成文书且由本公司经明确授权领导批准，

均对本公司不具约束力。

在保证期内更换之零件将保证至仪器保证期结束。

附注：性能特征与规格只在使用 Beckman Coulter 更换零件的情况下得到保证。

v


安全信息

本文件中的所有 “警告”和 “当心”信息均附有惊叹号、闪电符号或三角形内的闪光符号。请特别注意与此类符号相关的具体安全信息。

警告：如果以 Beckman Coulter,Inc. 未说明的方式使用器械，器械提供的保

护可能受到损害。

警告和当心定义

本文件中的所有 “警告”和 “当心”信息均附有惊叹号、闪电符号或三角形

内的闪光符号。

惊叹号符号是国际通用符号，用于提醒用户在尝试安装、使用、维护和修理之

前阅读和理解所有安全说明。

警告：警告提醒用户注意可能对操作员造成伤害的状况或可能的情形。

当心：当心提醒用户注意可能损坏或毁坏产品或操作员工作的状况或可能的

情形。

当本手册中显示该符号时，请特别注意与该符号相关的具体安全信息。

电气安全

为了预防与电气相关的伤害和财产损坏，请在使用前以适当方式检查所有电

气设备，并立即报告任何电气缺陷。任何要求移除盖板或面板的器械维修操作

均须与 Beckman Coulter 维修服务人员联系。

高压

该符号表示可能存在高压电源电击危险，在进行所有模块安装、维护和修理之

前应阅读和理解所有的安全说明。

请勿移除系统盖板。为了避免电击，仅限使用提供的电源线，并与适当接地

（三孔）壁式插座连接。仅限使用制造商提供的多插头电源板。

vi


电子设备弃置

理解和遵循所有有关电气设备安全和适当弃置的法规十分重要。

欧盟《废弃电气和电子设备（WEEE）指令》要求产品带有打叉轮箱符号。产

品上显示该符号表示：

• 该设备于 2005 年 8 月 13 日之后投放欧洲市场。

• 该设备不得通过欧盟任何成员国的市政废品收集系统弃置。

如需获得有关 WEEE 指令要求产品的适当防污染和回收计划信息，请与您的

经销商或地方办事处联系，他们可向您提供适当的搜集、治疗、康复、设备回

收和安全弃置的信息。

化学与生物安全

设备的正常操作可能涉及使用有毒、易燃或在其他方面具有生物有害性的材

料。使用此类材料时，请遵守以下注意事项：

• 依照妥善的实验室程序和方法处理传染性样品，以防传播疾病。

• 使用前遵守原溶液容器上印制的所有注意事项信息。

• 按照您所在设施的废品弃置程序弃置所有废溶液。

• 按照本手册中的说明操作设备，在使用病理性、有毒或放射性材料

时，采取所有必要的防范措施。

• 液体可能溅洒；因此，在使用具有潜在危险的液体时采取适当的安全

措施，例如佩戴安全镜和穿戴保护服。

• 在适当隔离的环境中使用有害材料。

• 在通电器械中或附近使用易燃液体时，应遵守安全管理人员规定的适

当防范程序。

• 在使用有毒、病理性或放射性材料时，应遵守安全管理人员规定的适

当防范程序。

附注：在设备操作过程中遵守所有附加或使用设备的警告和当心提示。查阅适

用的器械和设备使用手册中有关该设备的操作程序说明。

移动部件

为了避免移动部件造成伤害，请遵守以下规定：

• 切勿在器械操作过程中尝试更换实验室器皿、反应物或工具。

• 切勿尝试以物理形式限制设备的任何移动部件。

• 保持工作场所无障碍物，防止阻碍设备移动。

vii


清洁

遵守本用户手册中规定的清洁程序。清洁接触有害材料的器械之前：

• 应与适当的化学和生物安全工作人员联系。

• 应查阅本用户手册中包含的化学和生物安全信息。

维护

仅限执行本手册中说明的维护程序。本手册中未说明的维护程序应由BeckmanCoulter 维修服务代表执行。

在请求 Beckman Coulter 维修服务代表维修或将部件送回 Beckman Coulter 修理

之前，您有责任对部件消毒。 Beckman Coulter 不接受需要消毒但尚未消毒的

任何物品。如果退回任何部件，必须将部件装入密封的塑料袋内，并说明袋内

的物品无污染，可安全处理。

重要事项

ix


目录

1 多通道 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门1.1 介绍 Biomek 软件. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-1

1.1.1 使用本自学教程 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-11.1.2 在 Biomek® 软件使用入门中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-21.1.3 启动 Biomek 软件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-2

1.2 开始一个方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-41.2.1 介绍项目文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-41.2.2 创建新方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-51.2.3 理解开始步骤与完成步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-5

1.3 设置台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-61.3.1 确认 Biomek 软件中的台面正确无误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-61.3.2 配置 Instrument Setup 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-7

1.4 移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-101.4.1 配置移液头操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-101.4.2 配置来源实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-121.4.3 配置目的实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-131.4.4 确定方法完成估计时间（ETC）. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-14

1.5 运行方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-151.5.1 验证方法和确认台面设置 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-151.5.2 在 Biomek 模拟器中查看方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-16

1.6 保存方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1-18

2 多通道 Pod 蜒在方法中使用更多步骤2.1 在方法中使用更多步骤引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-1

2.1.1 在方法中使用更多步骤中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-12.1.2 为在方法中使用更多步骤设置您的台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-2

x


2.2 从多个来源向单一目的移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-32.2.1 配置移液头操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-32.2.2 配置来源实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-42.2.3 配置目的实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-5

2.3 混合实验室器皿中的内容物 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-72.3.1 配置 “Mix after dispensing liquid”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-7

2.4 在台面上移动实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-92.4.1 使用夹持工具移动实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-9

2.5 对出错信息作出响应 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-112.5.1 查找错误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-112.5.2 纠正错误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-11

2.6 在方法运行中添加实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-122.6.1 移动 pod 到新位置 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-122.6.2 暂停仪器 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-14

2.7 添加第二个仪器设置步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-162.7.1 在台面上添加实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-17

2.8 使用 96 通道 pod 向 384 孔板移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-182.8.1 在 Transfer 步骤中配置四分组 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-18

2.9 使用 Group 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-202.9.1 配置 Group 步骤. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-20

2.10 使用 Biomek FX 型仪器完成单项操作. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2-22

3 多通道 Pod 蜒使用单独步骤移液3.1 使用单独步骤引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-1

3.1.1 在使用单独步骤中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-13.1.2 为使用单独步骤设置台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-2

3.2 使用单独步骤移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-33.2.1 使用 Aspirate 步骤吸液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-33.2.2 使用 Dispense 步骤排液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-4

3.3 在方法中使用变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-63.3.1 在 Start 步骤里创建变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-63.3.2 在步骤配置中使用变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-73.3.3 在运行时更改变量的值 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-8

3.4 使用 Loop 重复移液步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-103.4.1 修改 Instrument Setup. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-103.4.2 使用 Loop 步骤重复操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-113.4.3 在表达式中使用变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-13

3.5 使用单独步骤节省移液头 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-163.5.1 在 Loop 外装上和卸下移液头 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-163.5.2 在 Loop 内洗涤移液头 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-17

3.6 在方法中使用盖子 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-183.7 在方法中堆叠孔板 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-20

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4 多通道 Pod 蜒使用工作单和条件4.1 使用工作单和条件引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-1

4.1.1 在使用工作单和条件中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-14.1.2 为使用工作单和条件设置您的台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-3

4.2 创建工作单文本文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-54.2.1 配置工作单文本文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-5

4.3 配置 Worklist 步骤以使用工作单 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-64.4 定义和运行程序 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-8

4.4.1 使用 Define Procedure 步骤定义程序 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-84.4.2 配置 Define Procedure 步骤内的步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-9

4.5 配置 If 步骤以在方法中使用条件. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-134.5.1 使用 If 步骤设置条件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4-13

5 Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门5.1 介绍 Biomek 软件. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-1

5.1.1 使用本自学教程 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-15.1.2 在 Biomek® 软件使用入门中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-25.1.3 启动 Biomek 软件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-3

5.2 开始一个方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-45.2.1 介绍项目文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-45.2.2 创建新方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-55.2.3 理解开始步骤与完成步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-5

5.3 设置台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-65.3.1 确认 Biomek 软件中的台面正确无误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-65.3.2 配置 Instrument Setup 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-7

5.4 移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-115.4.1 配置移液头操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-115.4.2 配置来源实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-135.4.3 配置目的实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-145.4.4 确定方法完成估计时间（ETC）. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-16

5.5 运行方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-175.5.1 验证方法和确认台面设置 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-175.5.2 在 Biomek 模拟器中查看方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-18

5.6 保存方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5-20

6 Span-8 Pod 蜒在方法中使用更多步骤6.1 在方法中使用更多步骤引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-1

6.1.1 在方法中使用更多步骤中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-16.1.2 为在方法中使用更多步骤设置您的台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-2

6.2 从多个来源向单一目的移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-36.2.1 配置移液头操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-36.2.2 配置来源实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-46.2.3 配置目的实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-6

xii


6.3 混合实验室器皿中的内容物 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-76.3.1 配置 “Mix after dispensing liquid”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-8

6.4 在方法运行中添加实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-96.4.1 移动 pod 到新位置 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-96.4.2 暂停仪器 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-11

6.5 添加第二个仪器设置步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-136.5.1 在台面上添加实验室器皿 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-14

6.6 使用 Group 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-156.6.1 配置 Group 步骤. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-15

6.7 对同一个标本进行多次稀释 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-176.8 对出错信息作出响应 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-19

6.8.1 查找错误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-196.8.2 纠正错误 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-19

6.9 使用 Biomek FX 型仪器完成单项操作. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-20

7 Span-8 Pod 蜒使用单独步骤移液7.1 使用单独步骤引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-1

7.1.1 在使用单独步骤移液中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-17.1.2 为使用单独步骤设置台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-2

7.2 使用单独步骤移液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-37.2.1 使用 Span-8 Aspirate 步骤吸液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-37.2.2 使用 Span-8 Dispense 步骤排液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-5

7.3 在方法中使用变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-77.3.1 在 Start 步骤里创建变量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-77.3.2 在步骤配置中使用变量和表达式 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-87.3.3 在运行时更改变量的值 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-9

7.4 使用 Loop 重复移液步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-117.4.1 使用 Loop 步骤重复操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-117.4.2 在 Dispense 步骤中指定排液的目的列 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-13

7.5 使用单独步骤节省移液头 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-147.5.1 在 Loop 外装上和卸下移液头 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-14

7.6 洗涤移液头心轴 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-157.7 查看日志数据 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7-17

8 Span-8 Pod 蜒使用工作单和条件8.1 使用工作单和条件引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-1

8.1.1 在使用工作单和条件中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-18.1.2 为使用工作单和条件设置您的台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-2

8.2 创建工作单文本文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-38.2.1 配置工作单文本文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-3

8.3 配置 Worklist 步骤以使用工作单 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-4

xiii


8.4 定义和运行程序 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-58.4.1 使用 Define Procedure 步骤定义程序 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-58.4.2 配置 Define Procedure 步骤内的步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-6

8.5 配置 If 步骤以在方法中使用条件. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-108.5.1 使用 If 步骤设置条件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8-10

9 Span-8 Pod 蜒使用文件直接移液9.1 使用 Transfer from File 引言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-1

9.1.1 在使用 Transfer from File 中您将学到的知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-19.1.2 为使用 Transfer from File 设置您的台面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-29.1.3 将 .CSV 文件复制到计算机桌面上 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-2

9.2 为命中选取创建一个环回 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-39.2.1 查看 Hits.csv 文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-39.2.2 插入 Loop 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-49.2.3 插入 Define Pattern 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-49.2.4 插入 Transfer 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-6

9.3 为反应设置插入 Transfer From File 步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-99.3.1 查看 TransferFromFile.csv 文件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-99.3.2 插入 Transfer From File 步骤. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9-11

多通道 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门 1-1


1 多通道Pod蜒Biomek® 软件使用

入门

1.1 介绍 Biomek 软件

附注：除非另有注明，本自学教程中的全部信息同时适用于 Biomek® FX 型和

FXP 型仪器。

欢迎使用 Biomek 软件和 Biomek FX 型实验室自动化工作站。

Biomek 软件控制 Biomek FX 型实验室自动化工作站上的多通道 Pod，并且设

计为：

• 为您完成大量的方法构建工作。

• 让您可以随心所欲地直接和精密控制此方法构建过程。

由此组合带来的灵活性，赋予了Biomek FX型实验室自动化工作站的强大功效。

1.1.1 使用本自学教程 7本自学教程设计为帮助您掌握将 Biomek 软件（3.3 版）与 Biomek FX 型仪器

上的多通道 Pod 一起使用。本自学教程中的各章可以依序修习，或者取决于学

习需要也可按任何顺序完成。这个格式让高级用户可以只完成包含他们需要

学习之主题的章节。一般说来，后续章节主题的复杂程度较高。本手册也有关

于 Biomek FX 型仪器上 Span-8 Pod 的章节。

本自学教程中关于多通道 Pod 的章节可与下列配置合用：

• 单多通道 Pod。

• 双多通道 Pod。

• 带有一个多通道 Pod 和一个 Span-8 Pod 的混合系统。

提示

为了有效学习，请

在使用前打印本自

学教程，从而将计

算机屏幕完全用于

显示 Biomek 软件。

1-2 多通道 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门


除本自学教程中的逐步指示外，您还将看到以如下形式包含有用信息的方框：

1.1.2 在 Biomek® 软件使用入门中您将学到的知识

在本章中，您将学习：

• 如何启动 Biomek 软件和方法构建过程的外观

• 如何设置台面以进行移液

• 如何构建移液方法

• 如何运行方法

• 如何保存和登记方法

1.1.3 启动 Biomek 软件

由开始菜单，选取所有程序 > Beckman Coulter > Biomek Software。

如果 Beckman Coulter 账户与许可已在您的系统上启用，您必须有已经建立的

账户，并且使用该帐户名和密码登录，才能完整学习本自学教程。如需更多信

息，请与您的系统管理员联系。

BIOMEK 概念

这些方框包含的信息旨在帮

助您理解 Biomek 软件或

Biomek FX型实验室自动化工

作站的重要特征与能力。尽

管即使不阅读这些方框中的

信息，您也可完成本手册中

的逐步指示；这些信息将增

强您的知识，并且让您对

Biomek 软件和您仪器的能力

有更全面的了解。

提示

这些方框中的信

息，会就如何使用

您的仪器和软件来

增强您想要在实验

室中进行的活动，

向您提供建议。

BIOMEK 概念账户与许可

“Beckman Coulter 账户与许

可”是 Biomek 软件内建的一

套集成功能，用于协助用户

遵守《联邦条例汇编》21 CFRPart 11关于封闭系统的规定。

许可提供了控制用户进行特

定程序操作的能力。请参阅Biomek Software User's Manual（Biomek 软件用户手册）第 2章 Using Accounts & Permis-sions （使用账户与许可）。



1.1.3.1 查看主编辑器

主编辑器（图1-1）是您为 Biomek FX 型实验室自动化工作站构建液体处理方

法的起点。您将从一个步骤选择板上选取方法步骤，然后将这些步骤以线性方

式放入方法视图。其中每个步骤的配置会在配置视图中出现。

小心：系统安装完毕后请勿在 Hardware Setup 中变更 pod 设定；如果变更

pod 设定，则必须再次请专业维修人员服务。

倘若使用带有一个多通道 Pod 和一个 Span-8 Pod 的仪器，则在完成本自学教程

时应将多通道 Pod 设置为默认 pod。为此：

在工具栏上的 pod 图标中选定默认 pod （图1-1）。

图 1-1、 Biomek 主编辑器

步骤选择板

表示用于构建方法的预定义步骤的图标在此区域中显示。

方法视图

将您想要您的方法完成的步骤放入此区域。

配置视图

每个步骤的配置在这个区域中出现。此视图将相应于在方法视图中突出显示的步骤而改变。

当前台面显示

此显示会动态改变，从而反映上一步骤完成时的台面状态。

如果仪器有一个 Span-8和一个多通道 Pod，在

此选定多通道 Pod。



1.2 开始一个方法

如要开始一个方法，您可以选择创建一个新方法或开启一个您已经完成、命名

且保存的现有方法。在本自学教程中，您将创建一个新方法。

不过在创建新方法之前，请养成确认您在使用正确的项目文件的习惯。

1.2.1 介绍项目文件

尽管项目文件可被创建、修订、删除、保存、导入、导出，在本自学教程中，

您将使用在仪器和 Biomek 软件安装时已经在系统上创建或导入的项目文件。

请查看图1-2，了解由主编辑器如何存取或查看项目文件信息。

图 1-2、项目文件

BIOMEK 概念项目文件

项目文件存储关于液体类

型、实验室器皿与移液头类

型、孔图案及吸液管吸液模

板与技巧的信息，作为方法

文件用于配置仪器操作的修

正。项目文件存储对该项目

文件内细项之所有变更、添

加及删除的历史。方法与项

目关联且包含执行该方法所

需的全部细项。

项目文件

当前已开启的项目文件在此显示。这里显示的项目文件是在将 Biomek软件安装到系统上时选

定 Biomek FXP 型工作站

的默认项目文件。

与项目文件关联的动作和编辑

器在工具栏上 Project 下面的下

拉式菜单中显示。



1.2.2 创建新方法

如要创建一个新方法：

在上面的工具栏里选取 New Method （图1-3）。

这就创建了您的新方法的起点。您最好将Biomek 编辑器扩展到覆盖整个屏幕。

图 1-3、创建新方法时的主编辑器

1.2.3 理解开始步骤与完成步骤

如您可以看到（图1-3），主编辑器的方法视图现在包含 Start 步骤和 Finish 步

骤。这两个步骤在创建方法时自动出现。这两个步骤始终存在，用于指明每个

方法的开头和结尾。您将在 Start 和 Finish 之间插入想要 Biomek FX 型仪器完

成的其余所有步骤。

当方法视图中的 Start 步骤被突出显示时，您会看到在配置视图中创建一些变

量的机会。在本自学教程中的第一章里，请不要理会此配置。

如果现在就想要知道关于 Start 配置的更深入信息，请参阅 Biomek SoftwareUser's Manual （Biomek 软件用户手册）第 13.2.1 节 Configuring the Start Step（配置开始步骤）。

您将在第1.4.4节确定方法完成估计时间（ETC）进一步学习对 Finish 步骤的

使用。

BIOMEK 概念方法

方法是控制 Biomek FX 型仪

器操作的一系列步骤。主编

辑器里的步骤选择板上有一

组图标，表示方法中可用的

步骤。如要构建一个方法，您

只需选定想用的步骤图标，

并且将它拖到主编辑器的方

法构建空间（方法视图）中。

放入和配置每个步骤，以执

行想要的操作。

新方法



1.3 设置台面

设置台面包括：

• 经由Deck Editor，确认Biomek软件中使用的当前台面与仪器的实物台

面一致。

• 配置 Instrument Setup 步骤，告知软件有哪些实验室器皿和每件实验

室器皿在台面上占据的台面位置。

1.3.1 确认 Biomek 软件中的台面正确无误

为了避免硬件碰撞，要点在于让 Biomek 软件中的台面与仪器的实物台面一

致。如果您想要在硬件上而不是以模拟方式运行这些自学教程方法，并且您的

台面与在此所示者不同，您可能必须修改这些方法，才能与您的硬件配合使用

（图1-4）。

附注：自动化实验室器皿定位器（Automated Labware Positioners，简称 ALP）是安装在台面上的可拆卸、可互换平台结构，用于完成自动化测定。

本自学教程中的步骤假定软件中当前台面的后排右起第二列包括一个 96 通道

移液头洗涤 ALP，因为您在后面将用到这个 ALP。您也可在 Deck Editor 中创

建一个台面，只在学习本自学教程时使用。

为此：

1. 查看图1-4 所示的当前软件台面。

2. 确认一个 96 通道移液头洗涤 ALP 已放在后排右起第二列的位置上

（图1-4）。请参阅如何添加此 ALP 的侧边提示。

图 1-4、包括一个 96 通道移液头洗涤 ALP 的当前台面

BIOMEK 概念 BIOMEK概念 Deck Editor

Deck Editor 用于定义和更改

存储于当前仪器文件中的台

面配置。台面是 Biomek 仪器

台面的软件表示，可供多个

方法存储和使用。但是，软件

台面必须始终与该方法中使

用的仪器实物台面一致。请

参阅 Biomek Software User'sManual （Biomek 软件用户手

册）第 6 章 Preparing andManaging the Deck（准备与管

理台面）。

提示

如要在您的台面上

添加一个 96 通道移

液头洗涤 ALP，请

选取 Instrument >Deck Editor。当前

台面出现。然后由

All，突出显示

WashStation96 并

将它拖到适当位

置。您在添加之前

可能必须从台面上

删除一个 ALP。然

后选取 Renum-ber，确保您的台面

与图1-4所示的台面

一致。

包括一个96通道移液头

洗涤 ALP 的当前台面



1.3.2 配置 Instrument Setup 步骤

本自学教程的下一项活动是配置移液程序的 Instrument Setup 步骤。您将在台

面上放置：

• 移液头

• 来源液槽

• 目的微孔板

要插入 Instrument Setup 步骤：

1. 选取（突出显示）方法视图中的 Start。

2. 让光标在步骤选择板中的 Instrument Setup 图标上悬停。在悬停的同时

查看方法视图，您将看到就在 Start 下面出现了一个黑条。此黑条指明下

一步骤将出现的插入点。在本例中，这是 Instrument Setup 步骤将插入的

位置。

3. 单击 Instrument Setup 图标，插入此步骤。 Instrument Setup 配置出现

（图1-5）。

4. 如果您创建了只与本自学教程一起使用的台面，请在 Deck 中选定您创建

的台面。

图 1-5、 Instrument Setup 步骤配置

提示

倘若 InstrumentSetup 步骤或任何

步骤被插入在方法

视图中的错误位

置，您可以将它拖

放到适当位置。

可用的实验室器皿

表示您的方法的实验室器皿选择。请将您的选择移到台面布局显示上。

向下移动此滚动条以显示

全部实验室器皿选择。

台面布局

代表您的 BiomekFX 型仪器台面的

布局。请将您的实验室器皿放在欲用的台面布局位置上。



使用您刚才插入的 Instrument Setup 步骤，您将学习如何选定和放置：

• AP96 200µL tips 于 TL1 （移液头装载器 1）台面位置

• Reservoir 于 P4 （4 号位置）台面位置

• BCFlat 96 微孔板于 P5 台面位置

要选取和放置实验室器皿：

1. 单击 AP96_200µL 移液头图标，然后单击台面布局中的 TL1 台面位置。

请注意，当您让光标在移液头箱上悬停时，会有一条工具提示指明台面位

置和实验室器皿。这个程序适用于您放置在台面上的所有实验室器皿。

2. 使用上述程序，将一个 Reservoir 放在 P4 台面位置。

3. 将液槽在台面上定位后，双击此图标或右击并选取 Properties。这就会开

启 Labware Properties（图1-6）。加入台面布局的每件实验室器皿都使用

Labware Properties 配置。 Labware Properties 中提供的信息在选取吸液

技巧或装上和卸下移液头时使用。

附注：指示Biomek仪器如何进行吸液操作的技巧，例如吸液、排液、混合。

图 1-6、液槽的实验室器皿属性

4. 在 Labware Properties 里，您可以给此液槽一个名称。您将命名这个液槽

为 Rsvr，但一般说来，您可以随意给实验室器皿起名。在 Name 域中键入

Rsvr。在配置完成后，此名称会出现在当前台面显示中的液槽上

（图1-7）。

5. 在 Labware contains an 中选取 Known。

6. 在Volume域中键入100000。这意味着您知道来源液槽中有10万微升液体。

7. 在 Liquid Type 下拉式菜单中选取 Water，或者在此域中键入 Water。

8. 在本自学教程中请将 Bar Code 留为空白，但它可用来指明特定方法中的

具体孔板。

9. 保留对Sense the liquid level the first time a well with Unknown or Nominalvolume is accessed "from the Liquid" 的默认选定。您将在后面的 Span-8自学教程中，进一步学习只由 Span-8 Pod 提供的液面高度感测功能。

10. 选取 OK。

11. 将一个 BCFlat96 微孔板放在台面的 P5 位置上。

提示

使用 LabwareProperties，移液头

可配置为装载回移

液头箱或垃圾桶。

提示

为台面上的实验室

器皿命名会有帮

助。您可以指定一

个注明该实验室器

皿中内容物的名

称，或者符合正在

贵实验室中进行的

工作的描述性名

称。这样能够大大

减少混淆。此名称

于是可在其他步骤

中使用，并且会出

现在日志文件里。



12. 双击此 P5 微孔板或右击并选取 Properties。

13. 在 Name 域中键入 Dest 以表示目的。


15. 在 Volume 域，将此值留为 0。

16. 请勿指定此目的孔板的 Liquid Type，因为它目前是空的。

17. 选取 OK。

这样就好了。您的台面现在已设置为移液，并且主编辑器看上去应如图1-7所示。

图 1-7、 Instrument Setup 步骤已完成

提示

您在选取Custom实

验室器皿类别后，

能够如您在这些步

骤中所做的那样设

置属性（名称、体

积、液体类型），然

后将该实验室器皿

向上拖并放回到可

用实验室器皿显示

中。此实验室器皿

将保留您设置的属

性，并且在您于其

他方法中访问

Instrument Setup时可供使用。



1.4 移液

现在您就可以插入和配置您的移液程序。Biomek 软件在Basic 步骤选择板上提

供一个 Transfer 步骤，令完成此任务轻而易举。

配置 Transfer 步骤包括配置：

• 移液头操作

• 来源实验室器皿

• 目的实验室器皿

1.4.1 配置移液头操作

为了设置移液，将 Transfer 步骤插入主编辑器的方法视图中，然后通过完成以

下工作来配置 Tip Handling：

1. 突出显示 Instrument Setup 步骤。

2. 从步骤选择板上选取 Transfer 图标，然后通过将它拖放到 InstrumentSetup 步骤下面而插入到方法中。Transfer 步骤配置出现（图1-8）。请注

意，编辑器底部的当前台面显示现已得到填充，从而反映您的台面设置；

这是因为它会为了与当前步骤开始时的台面状态一致而动态改变。

图 1-8、 Transfer 步骤已插入

3. 在 Tip Handling 中，请确定已选取 Load。

BIOMEK 概念Transfer 步骤

多通道 Pod 的 Transfer 步骤

从一个来源向一个或多个目

的移液。Transfer 步骤按照默

认规定将完成下列操作：装上

移液头、吸液、排液、卸下移

液头。此概念消除了插入四

个分开步骤的需要，尽管有

的方法偶尔需要单独完成这

些步骤。这些单独步骤将在

本自学教程的第 3 章中讨论。



4. 确定显示的移液头类型为 AP96_200µL，即您在 Instrument Setup 中已配

置的移液头类型。

5. 确定 unload them 已在下一个域中选定。

6. 复选 Change tips between sources。

7. 取消复选 Change tips between destinations。

8. 您的移液头已为您的移液得到配置，因此请单击 Tip Handling 旁边的向上

箭头（图1-8）。这将折叠 Tip Handling 配置，从而为实验室器皿配置留出

更多空间。在扩展的 Tip Handling 配置处会出现一个简单的文字说明，描

述操作移液头的方式。

9. 您目前将不变更 Transfer Details 部分，因此请单击 Transfer Details 旁边

的向下箭头，将 Transfer Details 配置折叠成概括。如此就让您有更多的空

间进行 Source 配置和Destination 配置。编辑器现在看上去如图1-9 所示。

图 1-9、 Tip Handling 已配置和折叠

提示

为了确定移液头在

方法执行中将如您

预期地表现，您只

需在此过程的任何

时候折叠 TipHandling 配置。由

此显示的句子会描

述您已配置了些什

么和移液头操作将

如何进行。如果此

描述与您希望的移

液头操作不同，请

扩展此配置，然后

做出变更。



1.4.2 配置来源实验室器皿

现在您将配置来源实验室器皿。在此您将指定从哪个实验室器皿吸液，以及移

液头在吸液之前下降到该实验室器皿内的高度。

要将名称为 Rsvr 的液槽配置成来源实验室器皿：

1. 单击 Click here to add a source。

2. 单击当前台面显示中 P4 位置上的 Rsvr 实验室器皿。如您可见，您在

Instrument Setup 中提供的信息已在来源实验室器皿配置中显示。

3. 右击此配置中液槽图形旁边的大移液头图示，并且选取 Measure fromBottom。

4. 为了调整和设置移液头下降到液槽内的吸液高度，将鼠标放在移液头图示

上。当光标变成一只手后，按住鼠标左键上下移动，直至自底部的高度已

尽可能接近 1.00 mm。然后依照页边空白上的提示，将高度精确调整至

1.00 mm。带有大移液头的来源液槽图形底部有一个小小的中断，这是表

明液槽比此图形所能够显示的更宽。

来源实验室器皿完成，编辑器现在看上去如图1-10 所示。

图 1-10、已配置来源实验室器皿

提示

在单击移液头后，

您能够更精确地调

整其高度：通过使

用键盘上的向上或

向下箭头键每按一

下将高度改变 0.10mm，或者使用

Page Up 键和 PageDown 键每按一下

将高度改变 1.0mm。您也可以右击

此图形，然后在出

现的菜单中选取

Custom Height。



1.4.3 配置目的实验室器皿

在此您将配置您想要将来源液槽中的水排出到何处。在本例中，您想要将水排

出到台面位置 P5 上的 BCFlat 96 微孔板内。

为此：

1. 单击当前台面显示中的 Dest 微孔板。这一项操作会完成与第1.4.2节配置

来源实验室器皿第 1 步和第 2 步相同的任务。请注意，来源实验室器皿配

置域现在已被概括该设置的一个简短句子所取代。在来源配置被折叠之

后，您可通过单击已折叠配置区域的任何位置，开启此配置。

2. Volume 域在目的配置中得到突出显示，令您可指定要排出的液体数量。

在本次自学中，您要转移 100µL，因此请在 Volume 域中键入 100。这意

味着您将在 96 孔微孔板的每个孔内排液 100µL，因此在这个例子中，您将

向该 96 孔微孔板总计排液 9600µL。

3. 右击大移液头图示，并且选取 Measure from Bottom。

4. 使用与设置吸液高度的相同技巧，在大移液头图示中将排液高度设置为

1.0 mm from bottom。

目的实验室器皿现已得到配置，并且编辑器看上去如图1-11 所示。

图 1-11、已配置目的实验室器皿

提示

如果您不小心开启

了太多的目的配

置，您只需右击配

置的标题。单击弹

出菜单中的

Delete，整个配置

就会消失。



1.4.4 确定方法完成估计时间（ETC）

您的移液已经设置完毕，现在让我们用 Finish 步骤，看看运行整个方法将需要

多久时间。

为此：

1. 单击方法视图中的 Finish 步骤。

2. 查看编辑器底部状态栏的 ETC 显示。这个方法的 ETC 大约为 51 秒

（图1-12）。 ETC 有些微变化是正常的。

图 1-12、 Finish 步骤显示 ETC

祝贺您！您刚刚使用 Biomek 软件构建了一个移液方法；您：

• 为新方法准备了主编辑器。

• 使用 Instrument Setup 步骤设置了台面和配置了您想要使用的实验室

器皿。

• 使用 Transfer 步骤添加和配置了移液。

ETC

在方法视图中的此方法完成估计时间。



1.5 运行方法

现在您已经构建了一个方法，让我们来运行一下。

1.5.1 验证方法和确认台面设置

当您选择 Run 时，此方法将在内部得到验证，以检查有无错误。在验证完成

后，主编辑器上将出现一条台面确认屏幕提示（图1-13）。此屏幕提示会显示

如软件所解释的台面设置。

如果您有意，您也可以在 Biomek 模拟器中查看此方法。请参阅第1.5.2节在

Biomek 模拟器中查看方法。

要确认台面设置：

1. 单击工具栏上的绿色箭头按钮或由 Execution 菜单选取 Run。台面确认出

现（图1-13）。

2. 在继续此方法之前，目视确认实物台面和 pod 设置与台面确认一致，包括

实验室器皿放置和 pod 上的移液头状态。

图 1-13、台面确认屏幕提示

3. 如果实物台面与所示台面不一致，请在台面上移动或放置实验室器皿，从

而实现一致。或者，您可以选择 Abort，然后依照您的实物台面设置，调

整 Instrument Setup 步骤。

4. 当实物台面设置与所示台面一致时，选择 OK。一旦选择 OK，此方法会立

即开始运行。您可以在方法视图中目视跟踪此方法的运行；正在执行的步

骤会突出显示。

台面和 pod 设置在此显示。请确定正

确的实验室器皿已经放置在台面上，

并且 pod 状态与软件的预期一致。



1.5.2 在 Biomek 模拟器中查看方法

小心：请确定正确的端口已在 Hardware Setup 中选取。模拟只在用 Biomek模拟器运行方法时使用。如要在仪器上运行方法，请选择仪器连接的 COM端口。

当一个方法以模拟方式运行时， Biomek 模拟器出现，显示执行该方法之仪器

的动画立体模型。设置模拟模式在 Hardware Setup 中配置（图1-15）。

如果您想要以模拟方式观看方法：

1. 从工具栏上选择 Instrument > Hardware Setup。 Hardware Setup 出现

（图1-14）。

图 1-14、硬件设置

2. 由 Port，选取 Simulate。

3. 选取 Accept。现在每当运行方法时，Biomek 仪器的动画立体模型就会显

示（图1-15）。于是您可以观看 Biomek 仪器执行该方法中步骤的模拟。

BIOMEK 概念硬件设置

Hardware Setup 用于由适当

的 Biomek 仪器信息（包括

Biomek 模拟器）配置 Biomek软件。尽管 Beckman Coulter服务工程师通常负责安装和

配置新装置，您可能有必要

使用 Hardware Setup 安装、

配置及拆除其他装置。请参

阅 Biomek Software User'sManual （Biomek 软件用户手

册）第 5.2 节 Accessing Hard-ware Setup（访问硬件设置）。

在此选取 Simulate，即可让方法在Biomek模拟器中运行。



如果您想要在硬件上运行方法，您必须回到 Hardware Setup，将 Port 从

Simulate 改为与 Biomek 仪器连接的微机 Com 端口。

图 1-15、以模拟方式运行方法

提示

模拟器能够是测试

方法的有用工具。

它可在不耗费贵重

的试剂或移液头的

同时确定有关方法

如预期地执行，并

且可在设置时和通

过加快运行速度而

节省时间。如需关

于模拟器的更多信

息，请参阅 BiomekSoftware User'sManual（Biomek 软

件用户手册）第 5.4节 Configuring theBiomek Simulator（配置 Biomek 模拟

器）。



1.6 保存方法

您将保存您刚刚创建的方法。

要保存方法：

1. 在工具栏上选取 Save Method 图标。

2. 在 Method Name 中键入保存您的方法的文件名。在本章中，请键入

Getting Started Tutorial （图1-16）。

图 1-16、保存方法

3. 选取 OK。现在您会看到，Biomek 主编辑器中的方法名称已经变成 GettingStarted Tutorial [Revision 1] （图1-17）。

BIOMEK 概念 BIOMEK概念保存方法

方法可在构建过程中随时保

存。保存方法会自动登记该

方法和创建一个修订记录；

该记录会保留在保存方法时

的方法配置。不同修订可日

后由修订历史访问。倘若任

何项目细项，例如实验室器

皿定义或技巧，在方法被保

存后有变更，该方法在下次

开启时将使用最新的定义。

如需更多信息，请参阅Biomek Software User's Manual（Biomek 软件用户手册）第

13.9 节 Saving a Method（保存

方法）和第 13.12 节 ViewingMethod History （查看方法历

史）。



图 1-17、方法名称已改变

现在请前往本自学教程的第 2 章，学习如何在方法中使用更多的步骤。

多通道 Pod 蜒在方法中使用更多步骤 2-1


2 多通道 Pod 蜒在方法中使用更多

步骤

2.1 在方法中使用更多步骤引言

在本自学教程的第 1章（请参阅第1章多通道Pod蜒Biomek® 软件使用入门），

您已经学到如何：

• 启动 Biomek 软件。

• 设置台面以进行移液。

• 构建移液方法。

• 保存、运行及登记方法。

如果您已经知道如何完成第1章多通道Pod蜒Biomek® 软件使用入门中的这些

任务，您可以直接由本章或后续章节入手。

2.1.1 在方法中使用更多步骤中您将学到的知识

本章将针对诸如反应设置和由一个密度改变成另一个，例如从 96 孔板向 384孔板移液，帮助您发展创建基本移液方法的技能。您也将学习如何暂停系统以

在台面上添加更多的实验室器皿和处理错误。本章也将描述如何为了改善方

法制作，使用 Single Step 执行单一操作。

更具体地说，本章中的逐步指示将教会您如何：

• 从两个来源向单一目的移液。

• 在实验室器皿中混合内容物。

• 使用多通道 Pod 上的夹持工具移动台面上的实验室器皿。

• 对错误做出响应。

• 在方法已开始运行后在台面上添加更多的实验室器皿。

• 将带有 96 通道头的多通道 Pod 与 384 孔板合用。

• 在方法视图中将步骤合乎逻辑地分组。

• 使用 Biomek FX 型仪器完成单项操作。

2-2 多通道 Pod 蜒在方法中使用更多步骤


2.1.2 为在方法中使用更多步骤设置您的台面

使用您在第 1 章中学到的知识，启动 Biomek 软件和用下列行动配置一个

Instrument Setup：

• 将 AP96 20µL 移液头箱放在 TL1 和 P1。

• 将 BCFlat96 孔板放在 P5 和 P6 上，将它们分别命名为 Source1 和

Source2。赋予这些来源孔板 Known 体积 150 µL 的 Water。

• 在P9上放一块CostarFlat384Square且命名为Dest。给予此目的孔板

0µL 的 Known 体积。

您的台面看上去应如图2-1 所示。现在请前往下一项活动，学习如何使用您的

方法中其他步骤创建一个方法。

图 2-1、已完成 Instrument Setup 步骤



2.2 从多个来源向单一目的移液

为了从一个或多个来源向单一目的移液，我们使用 Combine 步骤。它与使用

单一来源和一个或多个目的的 Transfer 步骤相似。

与 Transfer 步骤相似， Combine 步骤按照默认规定将完成下列操作：

• 装上移液头

• 吸液

• 排液

• 卸下移液头

在这项活动中，您将使用默认移液头操作、配置两个来源、配置目的、以及配

置移液细节。配置完毕的 Combine 步骤将从两块 96 孔来源孔板将来源转移到

一块 384 孔目的孔板。


要设置 Combine 步骤，您将在方法视图中插入 Combine 步骤，并且使用 TipHandling 的默认设定。

1. 请确认您的台面已根据第2.1.2节为在方法中使用更多步骤设置您的台面

中的指示得到配置。

2. 在 Instrument Setup 步骤后面添加一个 Combine 步骤。

3. 在 Tip Handling 中，请确定已选取 Load。

4. 确定显示的移液头类型为 AP96_20µL tips，即您在 Instrument Setup 中

已配置的类型。


6. 复选 Change tips between sources，并且确认 Change tips betweendestinations 未被复选。



7. 折叠 Tip Handling。您的主编辑器看上去应如图2-2 所示。

图 2-2、 Combine 步骤已插入且 Tip Handling 已折叠


要配置您将吸液的两块 96 孔板：

1. 单击 Click here to add a source （图2-2）

2. 单击 P5 上的 Source1。

3. 在 Volume 域中指定吸液量。在这个方法中，您将抽吸 40µL，因此请在

Volume 域中键入 40。

4. 单击当前台面显示中的Dest以添加一个目的。您将在下一节中配置目的，

但为了激活另一个来源，必须在此选取目的。

5. 单击下一个 Click here to add a source。

6. 单击 P6 上的 Source2，然后在 Volume 域中键入 20。



来源孔板现已得到配置，并且编辑器现在看上去应如图2-3 所示。

图 2-3、 Combine 步骤的来源实验室器皿已配置


下一个任务是指定您想要排出已抽吸液体的目的。在这个方法中，您想要排液

到 P9 台面位置上的 Dest 内。要实现此目标：

1. 单击 Destination: Dest 配置上任何一点。

2. 如果 Transfer Details 没有打开，单击旁边的箭头。

提示

孔体积显示反映了

孔中所装液体的数

量。如果在此显示

中看不到液体，您

可能在无意中试图

从空的目的而不是

来源吸液。

孔体积显示



3. 由 Stop when finished with，选取 Destinations （图2-4）。

图 2-4、 Stop when finished with Destinations 已选取

这样就好了。您刚刚完成了从两个来源吸液以排液到单一目的的 Combine步骤。

Combine 步骤使用 Source 配置和 Destination 配置及停止条件来配置一系列

的操作。在执行方法时， Combine 步骤将从每个来源孔板两次移液，从而使

得目的孔板的每个孔都刚好接收一个来源。在本章后面，您将使用一个 96 通

道头向一块 384 孔微孔板的特定四分组移液。

请前往下一项活动，学习如何在排液后混合目的孔板中的液体。



2.3 混合实验室器皿中的内容物

在 Transfer 步骤和 Combine 步骤中，您可以改变液体处理功能，从而超越简

单的吸液和排液。举例来说，您可以关闭移液头接触功能，激活预湿功能，或

者配置混合操作。这些修改通过自定技巧实现，并且用于控制吸液过程。

假设您想要在两个来源的液体都已经排出后，混合目的孔板的内容物。

要完成这项任务：

1. 单击台面显示中的Dest实验室器皿，或者单击目的配置周围的灰色区域。

这样就会扩展目的实验室器皿配置。

2. 在 Destination 配置域中，选取 Customize。 Technique Editor 开启至

Dispense 选项卡（图2-5）。

图 2-5、 Technique Editor 的 Dispense 选项卡

2.3.1 配置 “Mix after dispensing liquid”现在，您将配置在排液后混合目的中内容物的选项。

如要在排液后混合：

1. 由 Dispense 选项卡（图2-5），复选 Mix after dispensing liquid。此选

项的各域就会启用。我们将保留除混合数量与次数外的其他默认值。

2. 请在 Mix 域中输入 15。这就指定在混合过程中将吸液和排液的微升数。

BIOMEK 概念技巧

技巧是已预定义和存储之值

的集合，包括吸液与排液高

度、移液头接触及影响吸液

的其他属性。基于这些已存

储的值和属性集合，适当的

吸液技巧会得到自动选定。

如果想要控制这项原本是自

动的功能，您可以为移液中

的每个来源和目的选择

Customize。此自定选项也可

通过 Technique Editor 取得。

请参阅 Biomek Software User'sManual （Biomek 软件用户手

册）第10章Understanding andCreating Techniques （理解和

创建技巧）。



3. 在 time 域中输入 2。（配置后，time 变成复数的 times。）这就指定在排液

后您想要混合液体的次数。您已完成排液过程后混合的配置。 TechniqueEditor 现在看上去应如图2-6 所示。

图 2-6、已在自定技巧中配置混合

4. 选择 OK，关闭 Technique Editor。

在您配置好混合操作且回到 Combine 步骤配置后，您会看到一个表明此技巧

现包括混合的图标。这是在吸液管吸液技巧中表示不同程序的若干个图标之

一。您也将注意到，在技巧被自定后， Auto-Select 选项就会关闭。

提示

from the Bottom 吸

液有时能够导致液

体溢出，或者可能

污染移液头。在这

些情况下，从液体

中抽吸将是良好的

选择。这在本自学

教程中无需多虑，

因此您将为这个技

巧保留混合操作的

默认值。



2.4 在台面上移动实验室器皿

在步骤选择板上，您可以看到一个 Move Labware 步骤图标。当您在您的方法

中插入和配置这个步骤后，仪器将如下操作：

• pod 移动到选定的实验室器皿上方后下降。

• pod 上的夹持工具伸出，然后收紧并夹住该实验室器皿。

• pod 上升，然后将实验室器皿载运到指定位置。

• pod 下降，夹持工具松开，将实验室器皿放在新位置。

2.4.1 使用夹持工具移动实验室器皿

在本自学教程的这个部分，我们假设目的孔板的内容物已经沉淀，并且您需要

摇动内容物。我们进一步假设您在台面上某处已安装了一个摇动 ALP。

要移动台面上的实验室器皿：

1. 突出显示方法视图中的 Combine 步骤。

2. 由步骤选择板，在 Combine 步骤下面插入 Move Labware 步骤。 MoveLabware 配置出现（图2-7）。

图 2-7、 Move Labware 步骤配置

3. 在 Move labware from 域中选取 P9。

4. 在 to 域中选取 P6。



5. 保留对 Move the entire stack of labware 的复选。

6. 现在，单击方法视图中 Move Labware 步骤后面的 Finish 步骤，验证此

方法。

糟糕！！！您看到的醒目红色表明存在错误（图2-8）。不过没有关系，您只

要接着往下学就可以改正。

图 2-8、显示有错误的主编辑器



2.5 对出错信息作出响应

在本项活动中，您将学习如何查找和响应您刚刚收到的出错信息。

2.5.1 查找错误

Biomek 软件以若干种方式警告您存在错误，包括：

• 在有错误步骤后面的任何步骤被突出显示时，错误步骤会用红色在方

法视图中呈现。

• 当您让光标在造成错误的步骤上悬停时，会出现一条描述错误的工具

提示。

• 关联的红色出错信息会在编辑器底部的状态栏中显示。

• 该错误会显示在紧靠状态栏上方的错误栏里。

在出错信息框中还会显示其他错误。这些错误陈述问题和显示适当的改正选

项。请参阅 Biomek Software User's Manual （Biomek 软件用户手册）第 26 章

Handling and Preventing Errors （处理和防止错误）。

2.5.2 纠正错误

在本自学教程中，出错信息是：You cannot stack labware of classCostarFlat384Square on labware of class BCFlat96 at deck position P6. 这意

味着您已将软件配置为将实验室器皿堆叠在实验室器皿之上，而这是软件所

不允许的。您将在第 3 章中进一步学习如何将实验室器皿堆叠在实验室器皿之

上，因此我们现在将只是纠正这个错误。

要纠正堆叠错误：

1. 单击方法视图中的 Move Labware 步骤。

2. 在 to 域里，将位置变更为 P14。

3. 再次单击方法视图中的 Finish 步骤。

您看，错误已经得到纠正。

Biomek 软件会在您构建方法的过程中不断验证其步骤。每当您突出显示任何

一个步骤，当前方法中该点之上的步骤就会得到验证。如果遇到错误，造成错

误的步骤会用红色突出显示。



2.6 在方法运行中添加实验室器皿

假设您想要在目的孔板上加入另一种试剂，但您不希望在第一个 Transfer 完

成之前将第二个试剂放在台面上（或许该试剂只能与光线或外界空气有很短

暂的接触）。您可以通过在您的方法中添加第二个 Instrument Setup 步骤，向

软件表明台面上现在有更多的实验室器皿，来达到这个目的。

但是在添加第二个 Instrument Setup 步骤前，您将：

• 通过配置一个Move Pod 步骤，把 pod 移动到新的台面位置，从而确保

pod 被移到台面上不会妨碍您实际添加更多实验室器皿的地方。

• 通过配置一个 Pause 步骤让仪器暂停，给予您足够的时间来实际添加

更多的实验室器皿。

2.6.1 移动 pod 到新位置

Intermediate 步骤选择板上的 Move Pod 步骤会重新定位 pod，从而避开台面

上您想要人工到达的位置。由于您将要在台面上添加更多的实验室器皿以准

备另一个移液，您将需要让 pod 离开台面上的有关位置，然后暂停系统和添加


然而，由于 Move Pod 步骤是在 Intermediate 步骤选择板上，您在将此步骤添

加到您的方法中之前，需要首先显示该步骤选择板。



2.6.1.1 显示 Intermediate 步骤选择板

要将 Intermediate 步骤选择板加入主编辑器：

1. 右击 Basic 步骤选择板下面任何一点。

2. 选取 Intermediate。主编辑器现在看上去如图2-9 所示。

图 2-9、 Intermediate 步骤选择板已显示

BIOMEK 概念步骤选择板

步骤在步骤选择板上的分

组，是基于所控制之操作的

复杂性和配置时所需的知识

深度；但有些步骤则是依照

所控制的具体pod或仪器在步

骤选择板上分组。

Intermediate步骤选择板

Move Pod步骤



2.6.1.2 配置 Move Pod 步骤

要配置 Move Pod 步骤：

1. 将 Move Pod 步骤插入到方法视图中 Move Labware 步骤下面（图2-9）。

2. 从 Location 下拉式菜单中选取 WS1。这将指示 pod 移到 96 通道洗涤 ALP（WS1）上方停止（图2-10）。

图 2-10、已配置的 Move Pod 步骤

3. 单击 Finish 以验证此方法。

2.6.2 暂停仪器

通过添加和配置一个 Pause 步骤，您能够使仪器在方法运行中暂停指定的时

间或不固定的时间。取决于暂停的目的，您可用下列方式之一配置此步骤：

• 如果想要在特定位置培养某件实验室器皿的内容物一段特定时间，则

配置您想要让该位置停顿且不会与仪器互动的秒数。

• 如果想要在方法运行中人工移动实验室器皿（将它在台面上移动，或

者从台面上取下以拿到诸如读出器的某个装置处），则配置此步骤以

暂停不固定的时间。

当在运行中到达 Pause 步骤时， pod 会留在上一次操作的位置。



2.6.2.1 配置 Pause 步骤

您将配置 Pause 步骤为不固定时间，从而可以在台面上人工添加更多的实验

室器皿。软件将在主编辑器上面显示一条信息，直至您完成人工操作，然后它

将恢复方法的运行。

要将配置 Pause 步骤为不固定时间：

1. 将一个 Pause 步骤插入到方法视图中 Move Pod 步骤下面。

2. 选取 Pause the whole system and display this message:

3. 键入信息：Remove the two used tip boxes at TL1 and P1 and place anew AP96 20 µL on TL1.Place a reservoir containing a Known volumeof 100000 µL water at P7. 主编辑器现在看上去应如图2-11 所示。

图 2-11、已插入信息的暂停配置


在这个方法运行时，您将看到如图2-12 所示的屏幕提示；它将在您选取OK前

一直显示。

图 2-12、显示已配置信息的暂停屏幕提示

提示

如果您在 Pause 步

骤执行期间实际移

动了 pod，那么当您

在选取屏幕提示上

的 OK 以取消系统

暂停时，pod 会返回

至正确位置以继续

方法运行。



2.7 添加第二个仪器设置步骤

现在您已经做好在方法运行中向台面上添加更多实验室器皿的准备，可以开

始配置第二个 Instrument Setup 步骤。您将在 Pause 步骤下面插入第二个

Instrument Setup 步骤。第二个 Instrument Setup 步骤不仅指明台面的目前状

态，而且令您可添加更多的实验室器皿。

要配置第二个 Instrument Setup 步骤：

1. 将一个 Instrument Setup 步骤插入到方法视图中 User Pause 步骤下面。

这就会开启第二个 Instrument Setup 步骤配置。

2. 选取 As Is 方块下面的 Toggle。这就让软件知道，所有台面位置都将保持

不变。主编辑器现在看上去应如图2-13 所示。

图 2-13、添加 Instrument Setup 步骤和切换所有台面位置 As Is



3. 选取 Clear，然后单击 TL1 和 P1。这就除去用过的移液头箱。主编辑器现

在看上去应如图2-14 所示。

]图 2-14、使用 Clear 来除去用过的移液头箱

2.7.1 在台面上添加实验室器皿

现在您将添加实验室器皿，为下一个液体操作过程蜒使用 96 通道多通道头与

384 孔实验室器皿的 Transfer 步骤蜒做好准备。为此下一个液体处理过程，您

将需要添加另一个移液头箱和一个附加来源液槽。此新的实验室器皿就是您

已经配置为要在仪器暂停等候人工放置时显示的实验室器皿。

1. 在 TL1 上放一个 AP96 20µL 移液头箱。

2. 在 P7 上放一个 Reservoir，然后将它配置为装有 Known 体积 100000 的

Water。

现在就可以配置使用 96 通道多通道 Pod 和 384 孔板的下一个液体处理程序。

提示

尽管软件会自动找

到移液头，您必须

确定台面上有完成

作业所需的足够移

液头；否则您将收

到出错信息。



2.8 使用 96 通道 pod 向 384 孔板移液

Biomek 软件使您能够使用 96 通道 pod 在 96 孔板和 384 孔板之间移液，或者

使用 384 通道 pod 在 384 孔板和 1536 孔板之间移液。您可以将微孔板上的四

分组选作来源或目的。

图2-15 给出了四分组的图示。

图 2-15、 384 孔微孔板的四分组图示

2.8.1 在 Transfer 步骤中配置四分组

要学习如何使用和配置四分组，您将需要在第二个 Instrument Setup 步骤后面

添加和配置一个新的 Transfer 步骤。

1. 在方法视图中的第二个 Instrument Setup步骤下面插入一个新的Transfer步骤。 Transfer 步骤配置出现。

2. 在 Tip Handling 中，请确定 Change tips between sources 和 Changetips between destinations均未被复选。这意味着只用一箱移液头来完成

这个移液。

3. 选取 P7 上的 Reservoir 作为来源实验室器皿。

4. 选取 P14 上的 Dest 作为目的实验室器皿，并且指定 50µL 体积。

5. 双击 Dest 的图形以放大。由此您将选定 1 四分组和 4 四分组。

6. 单击第一列和第一行的第一个孔，选定 1 四分组。

BIOMEK 概念四分组

四分组让 96 通道 pod 可以同

时使用 384 孔板的 96 个孔，

或者让 384 通道头同时使用

1536 孔微孔板的 384 个孔。

384 孔微孔板和 1536 孔微孔

板被分成四个等间距孔组合

或四分组。使用四分组，多通

道 Pod 需要操作四次，才能使

用微孔板上的全部孔。



7. 在按住 Ctrl 键或 Shift 键的同时单击 4 四分组中的任何一个孔。主编辑器

看上去应如图2-16 所示。

图 2-16、目的实验室器皿的 1 四分组和 4 四分组已选取

8. 选取 Zoom Out。该图形回复成缩小显示。

9. 突出显示 Finish 步骤以验证此方法。

10. 运行此方法，观看多通道 Pod 如何使用四分组移液。

如您可见，方法视图中的所有这些步骤，让您的方法看起来相当复杂。请前往

下一节，学习您就此能够做些什么。

在此选取

Zoom Out。



2.9 使用 Group 步骤

为了避免让方法看起来过于复杂，您可以通过在方法视图中插入Group 步骤，

依逻辑关系将一些步骤组合在一个标题之下。在配置 Group 步骤的过程中，这

一组步骤会隐藏在方法视图中您给予的名称之下。

2.9.1 配置 Group 步骤

就本活动而言，您会将您的方法中已有的 Move Pod、 Pause、 InstrumentSetup 三个步骤组合在同一个标题之下。这些步骤都与使用四分组移液的准备

关联。

要组合这些步骤：

1. 将 Intermediate 步骤选择板上的 Group 步骤插入到方法视图中 MoveLabware 步骤下面。

2. 双击此 Group 步骤以揭示下一个 End Group 步骤。如有必要向左卷动方

法视图。

3. 在步骤配置的 Group Label 域中输入 Pause to add labware （图2-17）。

在此 Group 步骤得到配置且方法中的另一个后续步骤被突出显示时，此

Group 步骤在方法视图中将以 Group Label 中的标记命名。在本例中，

Group 步骤将在方法视图中被命名为 Pause to add labware （图2-18）。

图 2-17、已配置 Group 步骤

4. 突出显示Move Pod步骤，然后将它拖放到Group步骤内End Group上面。

BIOMEK 概念Group 步骤

Group 步骤令您可将一系列

相互连接的步骤“套”起来，

并且给此群组一个出现在方

法视图中的合理名称。这样

一来，在您开启您的方法时，

Group 步骤会以折叠方式显

现，其中的相互连接步骤被

隐藏起来。这会使得方法看

上去比较短，而且让您不必

上下卷动方法视图，即可看

到方法的更多内容。您只需

双击方法视图中的 Group 步

骤，即可扩展该步骤和显露

嵌套在其内的步骤。

提示

如果希望在其他方

法中使用某个已配

置的 Group 步骤，

您只需将已标记的

Group 步骤从方法

视图中拖放到主编

辑器的任何一个步

骤选择板上。这个

步骤于是将在该步

骤选择板上始终可

供其他方法使用。

这也适用于将用于

其他方法的任何已

配置步骤。

Group步骤



5. 分别对User Pause 步骤和第二个 Instrument Setup 步骤重复前面第 4 步。

请确定这些嵌套的步骤具有如图2-18 所示的顺序，因为在拖放步骤的过程

中很容易将顺序搞乱。

现在，Move Pod、User Pause、第二个 Instrument Setup 三个步骤就合乎逻

辑地嵌套在一个 Group 步骤内（图2-18）。您可以通过双击此 Group 步骤而

酌情展开和折叠这个步骤。

图 2-18、已配置的 Group 步骤，其中嵌套的步骤已展开

请前往下一节，学习如何使用 Single Step 查看这个方法的每一项操作。

提示

与 Group 步骤相

同， C o m m e n t（图2-18）步骤不会

在仪器上发起任何

动作。它是用于在

方法视图中为方法

提供描述信息和附

注。请参阅 BiomekSoftware User'sManual（Biomek 软

件用户手册）第16.6节Comment Step（注解步骤）。

Comment步骤



2.10 使用 Biomek FX 型仪器完成单项操作

在这项活动里，您将使用 Single Step，查看您刚刚创建的方法的每项操作。

1. 请选取 Execution > Single Step。 Single Step 出现（图2-19）。

图 2-19、 Single Step

2. 选取 Execution > Run。具体操作已显示的 Single Step 出现（图2-20）。

如果您的台面上有已配置的其他 ALP，它们的初始化过程会出现在 SingleStep 中。

图 2-20、具体操作已显示的 Single Step

BIOMEK 概念 BIOMEK概念 Single Step

Single Step 会使Biomek 仪器

在一个步骤中的每项操作之

间暂停，从而允许目视确认

该操作的正确性。执行单项

操作能够帮助对方法进行微

调。

提示

在使用 Single Step时不要着急慢慢

来。如果在方法中

前进得太快，就可

能错过需要查证的

步骤。



3. 请选取 Prepare to load tips 下面的 Launch。下一项操作就会启动

（图2-21）。

图 2-21、下一项操作已启动的 Single Step

4. 再次选取 Launch。Biomek 屏幕提示出现。如果实物台面与软件屏幕提示

一致，请选取 OK。 Single Step 继续显示每项操作，以及 Launch 和执行

该操作的选项。

5. 通过选取 Launch 继续查看每项操作，或者如要停止 Single Step，则请选

取 Exit，以允许此方法运行且无查看每项操作的选择。

6. 您可以选择保存这个方法。

现在请转到本自学教程的下一章，学习如何使用单独步骤对移液进行精确

控制。

多通道 Pod 蜒使用单独步骤移液 3-1


3 多通道 Pod 蜒使用单独步骤移液

3.1 使用单独步骤引言在本自学教程的前面章节（请参阅第2章多通道 Pod 蜒在方法中使用更多步

骤），您已经学到如何：



• 使用多通道 Pod 上的夹持工具移动台面上的实验室器皿。


• 在方法已开始运行后在台面上添加更多的实验室器皿。

• 将带有 96 通道头的多通道 Pod 与 384 孔板合用。



如果您已经知道如何完成第2章多通道 Pod 蜒在方法中使用更多步骤中的这些


3.1.1 在使用单独步骤中您将学到的知识

本章将帮助您增强您的方法构建技能，从而创建使用变量 “环回”或重复任

务的更高级方法。您也将学习如何使用堆叠和带盖孔板优化台面空间，以及如

何通过洗涤移液头节省移液头用量。


• 使用单独步骤独立地吸液和排液。

• 使用 Loop 步骤重复操作。

• 使用单独步骤独立地装上和卸下移液头。

• 在方法运行中于 96 通道移液头洗涤 ALP 处洗涤移液头。

• 在方法中操作盖子。

• 在方法中堆叠孔板。

3-2 多通道 Pod 蜒使用单独步骤移液


3.1.2 为使用单独步骤设置台面

启动 Biomek 软件和使用 Instrument Setup 步骤，配置下列细项：

• 在 TL1 上放一个 AP96_20uL 移液头箱。

• 在 P5 放一块 BCFlat96 微孔板。将它命名为 Source1 且配置为装有

300µL 的 Known 体积 Water。

• 在 P9 放一块 CostarFlat384Square 微孔板。将它配置为装有 0µL 的

Known 体积。

您的台面看上去应如图3-1 所示。现在请前往下一项活动，学习如何使用单个

移液步骤创建一个新方法。

图 3-1、使用单独步骤的初始 Instrument Setup



3.2 使用单独步骤移液

在前面章节里，当您想要从一块孔板向另一块移液时，您使用 Transfer 步骤和

Combine 步骤完成所有必要动作蜒装上移液头、吸液和排液、卸下移液头。然

而，有时您会想要对这些操作有更直接的控制；例如对标本转移顺序或何时

装上、卸下、洗涤移液头的精确控制。

当您对移液操作需要有更多的控制，而 Transfer 步骤和 Combine 步骤不能提

供此控制时，您可以使用单独步骤配置移液。与 Transfer 步骤和 Combine 步

骤不同，这些单独步骤均只完成一项任务（例如：吸液、排液、装上移液头、

洗涤移液头或卸下移液头）。

在本节中，您将使用 Aspirate 步骤和 Dispense 步骤从 96 孔来源孔板向 384 孔

目的孔板移液。

3.2.1 使用 Aspirate 步骤吸液

您可以使用 Aspirate 步骤从微孔板或液槽吸液。

要使用 Aspirate 步骤从 96 孔板吸液：

1. 请确认您已根据第3.1.2节为使用单独步骤设置台面中的指示配置台面。

2. 将 Aspirate 步骤由 Intermediate 步骤选择板拖到方法视图中并放在

Instrument Setup 步骤下面。

3. 在当前机台显示中，单击 Source1，将它选作将被吸液的实验室器皿。

提示

请确定您使用

Intermediate 步骤

选择板上的

Aspirate 步骤而非

Span-8 Aspirate 步

骤，后者只与 Span-8 Pod 合用。



4. 在 Volume，输入 60µL。

5. 选取 Refresh Tips （图3-2）。这意味着在此步骤开始时，在从来源孔板

吸液前， pod 将装上新的移液头。

图 3-2、 Aspirate 步骤已配置

3.2.2 使用 Dispense 步骤排液

现在已经抽吸了一些液体，您需要将它排出到另一件实验室器皿中。在本自学

教程，您将把已抽吸的液体排出到一块 384 孔板的一个四分组中。

要排出之前抽吸的液体：

1. 将 Dispense 步骤由 Intermediate 步骤选择板拖到方法视图中并放在

Aspirate 步骤下面。

2. 在当前机台显示中，单击 P9 位置上的 384 孔板以将它选作目的。

提示

如果已装上移液

头，pod 将在吸液前

卸下那些移液头

（以及其中的任何

液体，如果不空）和

装上新的移液头。

这个选项应只在没

有装上移液头或移

液头是空的时使

用。

提示

请确定您使用

Intermediate 步骤

选择板上的

Dispense 步骤而非Span-8 Dispense步骤，后者只与

Span-8 Pod 合用。



3. 在Volume，输入60µL。您将排出前面在Aspirate步骤中抽吸的全部液体。

4. 在 384 孔板的图形中，请选取第二个四分组。您的 Dispense 步骤看上去

应如图3-3 所示。

图 3-3、 Dispense 步骤已配置

您现在已经配置了一个简单方法，使用单独步骤从一块 96 孔来源孔板吸液，

然后排液到一块 384 孔目的孔板的一个四分组中。您可以选择在 Biomek FX 型

仪器或模拟器上运行这个方法（请参阅第1章多通道 Pod 蜒 Biomek® 软件使用

入门）。

在下一节里，您将使用吸液和排液体积的一个变量重新配置这个简单方法。



3.3 在方法中使用变量

变量可以简化对方法的修改。在配置步骤时，您在欲用的域中输入变量的名

称；在方法运行时，变量的实际值将被代入且有关操作得到执行。

您现在将为移液体积创建一个变量，然后将它用于 Aspirate 步骤和 Dispense步骤。这包括：

• 在 Start 步骤里创建变量（第 3.3.1 节）

• 在步骤配置中使用变量（第 3.3.2 节）

• 在运行时更改变量的值（第 3.3.3 节）

3.3.1 在 Start 步骤里创建变量

Start 步骤除作为方法中的第一个步骤外，还能够用于创建和命名可在该方法

各处使用的变量。在Start步骤中命名的变量可用于配置该方法中的其他步骤。

Biomek 软件中的其他步骤也允许您创建变量，但那些变量只限用于其创建所

在的步骤。您将在本章后面将那些变量与 Loop 步骤一起使用。

您现在将使用 Start 步骤为移液体积创建一个变量。

要在 Start 步骤里创建变量：

1. 从方法视图中选取 Start 步骤，从而显示其配置。

2. 在 Variable Name 栏，输入 Vol。请勿在 Vol 后面加句号。

3. 在 Value 栏，请输入 60。您的 Start 配置看上去应如图3-4 所示。您已经创

建了一个变量，其名称和值分别为 Vol 和 60。

图 3-4、 Vol 变量已在 Start 步骤中创建

BIOMEK 概念变量

使用变量有若干好处：

• 如果想要更改在方法中

多处使用的某个值，您

可以只在一处更改，然

后使用该变量的其他各

处都会自动更新。

• 变量的值可在运行时设

置，有关方法就会相应

自动更新。

• 您可在运行时基于变量

的值做出决定（这将在

下一章学习）。

提示

请勿使用变量名称

C_Volume。这个变

量已内建于 Biomek软件且与追踪体积

关联。



3.3.2 在步骤配置中使用变量

您现在将使用在 Start 步骤中创建的变量 Vol 来配置 Aspirate 步骤和 Dispense步骤的移液体积。

要在步骤配置中使用变量：

1. 请选取 Aspirate from Source1 步骤。

2. 如图3-5 所示，在 Volume 域中输入 =Vol （包括等号）。变量在输入到步

骤配置域中时，总是用等号起头。在此方法运行时， Vol 将被此变量的值

（在本例中为 60）取代。

图 3-5、使用变量 Vol 配置 Volume

3. 选取 Dispense to P9 步骤，然后在 Volume 域中输入 =Vol。此方法现已

配置成转移等于变量 Vol 的体积。

如要改变您想要转移的体积，您将变更 Start 步骤中变量 Vol 的值。在 Aspirate步骤和 Dispense 步骤中指定的 Volume，于是将在运行时当 Vol 的值被代入时

自动更新。

提示

变量名称不分大小

写，因此VOL、vol、Vol、VoL 都会被视

为相同的变量。



3.3.3 在运行时更改变量的值

由于变量的值可通过在 Start 步骤变更该变量的值而在方法的各处改变，变量

使得重新配置除一两个细节外相似的不同方法快速简便。

就在 Start 步骤中创建的变量而言，您可以配置 Biomek 软件，从而在运行时提

示您为该变量指定一个值。如此配置之后，在该方法运行时，屏幕上会为每个

变量出现一个提示。您在 Start 步骤中为该变量输入的值现在成为该变量的默

认值。您可以通过选取 OK 而使用该值，或者输入一个新值并选取 OK，从而

变更该变量的值。该方法的运行于是将使用该变量的指定值且相应更新该

方法。

要在运行时更改变量的值：

1. 选取 Start 步骤。

2. 选取变量Vol的Prompt复选框。您的Start配置现在看上去应如图3-6所示。

图 3-6、提示输入变量的值



3. 运行此方法。一个屏幕提示出现，让您可以为该变量输入一个值

（图3-7）。

图 3-7、指定变量值的屏幕提示

4. 输入 50，然后选取 OK。如果您在 Biomek FX 型仪器上运行此方法，您应

会注意到， 50µL 而不是 60µL 将被转移到每个孔内。

在下一节里，您将学习使用变量和 Loop 步骤执行重复操作，从而由四个不同

的来源孔板吸液且排液到一块 384 孔板的全部四个四分组中。



3.4 使用 Loop 重复移液步骤

Loop 步骤令您能够以多个循环重复一个或多个步骤。每个循环或迭代会重复

此 Loop 中包含的步骤。您也可在 Loop 步骤中创建一个选用的变量。这个变

量将针对 Loop 的每个循环被分配一个起始值、一个结束值及具有规则间隔的

增量。

在本节里，您将使用一个 Loop 步骤修改您的方法，以从四块不同的 96 孔来

源孔板吸液和向该 384 孔目的孔板的每个四分组移液。为了完成这个任务，您

将在 Loop 步骤内创建一个变量，然后在方法执行中，随着移液操作的重复，

用此变量重新配置 Aspirate 步骤和 Dispense 步骤。

为此，您将需要：

• 在 Instrument Setup 步骤中向台面上添加更多的孔板（请参阅

第3.4.1节修改 Instrument Setup）。

• 使用 Loop 步骤重复吸液和排液操作（请参阅第3.4.2节使用 Loop 步骤

重复操作）。

3.4.1 修改 Instrument Setup为了从四个来源孔板向 384 孔目的移液，您的台面上需要有四块 96 孔来源孔

板。您现在将修改您的原始 Instrument Setup 步骤，以包括四块来源孔板。

要修改 Instrument Setup 步骤：

1. 从方法视图中选取 Instrument Setup 步骤，从而显示其配置。

2. 右击位置 P5 上的 Source1 来源孔板，然后选取 Copy。当您以此方式复

制实验室器皿时，该件实验室器皿的所有实验室器皿属性，包括名称和体

积信息，也会得到复制。

BIOMEK 概念Loop 步骤

Loop 步骤会重复已嵌套的一

个或多个步骤，直至超过其

End 值。对于 Loop 的第一个

循环来说，其值是 Start 值。

在完成该环回内的所有步骤

后，其值改变一个

Increment，这些步骤会再次

重复。这个过程将一直重复

下去，直到 Increment 将值改

变至超过 End 值。



3. 单击空位 P4、 P6、 P7，将 Source1 复制到这些位置。

4. 将位置 P5、P6、P7 上的 Source1 分别重新命名为 Source2、Source3、Source4。您现在应该有处于位置 P4 至 P7 且名为 Source1 至 Source4的四块 96 孔来源孔板（见图3-8）。

图 3-8、修改 Instrument Setup 步骤以添加更多的来源

3.4.2 使用 Loop 步骤重复操作

如果想要在一次方法运行中将某些操作重复若干次，您使用 Loop 步骤。Loop步骤令您可以重复一个或多个步骤的操作，而且无需为每次重复而插入和配

置那些步骤。将重复的步骤是放在（或嵌套在） Loop 步骤内的步骤。

Biomek 软件将在内部跟踪每个循环的 Loop 值，而 Start、End、Increment 三个值需要指定。您能够选择为 Loop 值指定一个名称，从而创建一个变量。这

个变量于是可以象任何其他变量那样用于配置步骤，但只能与 Loop 步骤内包

含的步骤合用。

要重复 Aspirate 步骤和 Dispense 步骤：

1. 将一个 Loop 步骤插入到 Instrument Setup 步骤下面。 Loop 图标和 EndLoop 图标在方法视图中出现，并且 Loop 步骤配置会显示。

2. 在 Variable 域中输入 quad。这将创建一个名为 quad 的变量，可用来配置

Loop 内的步骤。请参阅侧边提示。

3. 在 Start 域中输入 1。这将是在此环回的第一次迭代中分配给变量 quad 的

初始值。

提示

Loop 步骤也能够不

用变量地使用，例

如本例中的变量

quad。



4. 在 End 域中输入 4。这将是变量 quad 的最终值。当 quad 的值超过 End 值

时，此 Loop 步骤结束，并且继续执行方法的其余部分。

5. 在 Increment 域中输入 1。 Increment 值是在此 Loop 每次迭代时，变量

quad 的变化值。您的 Loop 步骤配置看上去应如图3-9 所示。

图 3-9、重复吸液和排液的 Loop 步骤

6. 将Aspirate步骤和Dispense步骤拖放到Loop图标和End Loop图标之间。

Loop步骤



3.4.3 在表达式中使用变量

现在您为创建变量 quad 而配置了 Loop 步骤，并且已经将 Aspirate 步骤和

Dispense 步骤放在此 Loop 内；您可以使用变量 quad 重新配置 Aspirate 步骤

和 Dispense 步骤。您现在将使用变量 quad 配置：

• 将要吸液的来源孔板。

• 目的孔板上将要得到排液的四分组。

然而，单靠变量有时是不够的；您需要使用表达式来修改变量。指定 Aspirate步骤中的来源孔板就是这样一种情况。如您所知，四块 96 孔来源孔板已命名

为 Source1、Source2、Source3、Source4。变量 quad 对于此环回的每个循

环的值分别为 1、 2、 3、 4。

为了指定从哪块孔板吸液，您需要将 Source 这个词加在变量 quad 的值前面。

这可通过使用 & 运算符来实现。此运算符会组合两个字符串。在本例中，它

会把一个常数字符串 Source 与变量 quad 的值组合在一起。为此：

1. 如下面的图3-10 所示，请在 Aspirate 步骤配置中，将 Position 更改为

="Source"&quad （包括等号且无空格）。引号里的值是文字串且始终具

有相同的值。

图 3-10、 Aspirate 步骤在表达式中使用 Loop 变量 quad

BIOMEK 概念表达式

表达式通过使用运算符修改

变量的方法组合文字、数字

常数及变量。这些运算符可

以完成多种数学运算或组合

文字串。如同变量一样，表达

式也会得到计算，并且结果

值会在运行时取代该表达

式。



2. 在 Dispense 步骤配置中，与其说使用 384 孔板的图形表示指定接受移液

的孔，您将使用变量 quad 来指定目的孔。为此，请右击 384 孔板的图形表

示，在显现的菜单中选取 Specify Selection as Text （图3-11）。 TextSelection 就会显示（图3-12）。

图 3-11、选取 Specify Selection as Text 的菜单

图 3-12、 Text Selection

3. 在 Text Selection 域中输入 =quad。这将指定得到排液的四分组。请确定

Specify the targets with the expression below 已得到复选。这意味着在此

环回的第一次迭代中将排液到 1 四分组中，在下一次迭代中则将排液到 2四分组，以此类推。

4. 选取 OK。



Dispense 步骤配置看上去如图3-13 所示。此实验室器皿的图形表示变成灰色，

表明排液的目标孔用文字指定。

图 3-13、 Loop 里的 Dispense 步骤



3.5 使用单独步骤节省移液头

此方法的当前配置将导致出错，因为台面上没有足够的移液头箱。这是由于

Aspirate 步骤会试图为 Loop 的每次迭代装上移液头，但台面上统共只有一箱

移液头。您将通过在 Loop 之前装上移液头，然后为 Loop 的每次迭代重复使

用这些移液头，在纠正此错误的同时节省移液头。如果您有洗涤 ALP，您将配

置此方法，以在每次排液后洗涤移液头。

节省移液头包括：

• 在 Loop 外装上和卸下移液头（第 3.5.1 节）。

• 在 Loop 内洗涤移液头（第 3.5.2 节）。

3.5.1 在 Loop 外装上和卸下移液头

要在 Loop 外装上和卸下移液头：

1. 在 Instrument Setup 步骤和 Loop 步骤之间插入一个 New Tips 步骤。

2. 选取 Loop 内的 Aspirate 步骤。

3. 取消对 Refresh Tips 复选框的选定。这就告知 Biomek 使用已经装上的无

论何种移液头完成吸液，而不是在 Aspirate 步骤开始时装上新的移液头。

4. 将一个 Unload Tips 步骤插入到方法视图中的 End Loop 图标下面。您的

方法现在看上去应如图3-14 所示。

图 3-14、在 Loop 外装上和卸下移液头

New Tips步骤

Unload Tips步骤



这个方法会装上新的移液头、使用相同的移液头完成 Loop 的四次吸液和排液

操作，并且在 Loop 的最后一次迭代后卸下移液头。

3.5.2 在 Loop 内洗涤移液头

如果您有洗涤 ALP （在软件中称为 Wash Station），您将添加一个 Wash 步

骤，在每次排液后洗涤移液头。

要在吸液操作之间洗涤移液头：

1. 在方法视图中的 Dispense 和 End Loop 之间插入一个 Wash 步骤。

2. 在 Volume 域中输入 100%。这意味着在每个洗涤循环中，等于已吸液和

排液之总体积的体积将用于清洁移液头。

3. 在 Wash Cycles 域中输入 3。这是 Volume 的洗液会被吸液和排液以清洁

移液头的次数（图3-15）。

图 3-15、洗涤移液头

BIOMEK 概念洗涤移液头

Wash步骤通过依指定次数吸

取和排出指定体积的洗液，

在Wash Station洗涤移液头。

Wash步骤



3.6 在方法中使用盖子

在第 2 章里，您曾经学到使用 Move Labware 步骤在台面上移动实验室器皿。

Move Labware 步骤的另一项用途是取下带盖微孔板或移液头箱的盖子。在本

节中，您将修改方法，把一块带盖 384 孔板用作目的。

要在方法中使用盖子：

1. 选取 Instrument Setup 步骤。

2. 在 Labware Category 中选取 Lid 以只显示盖子。

3. 将一个 CostarFlat384SquareLid 拖放到处于 P9 位置的 CostarFlat384-Square 孔板上。 Instrument Setup 现在看上去应如图3-16 所示。

图 3-16、修改 Instrument Setup 步骤以添加盖子

4. 为了作为此方法的组成部分而取下盖子，请紧接着 Instrument Setup 步骤

在其后插入一个Move Labware步骤。此步骤必须在New Tips步骤前面，

因为在装上移液头后，夹持器无法移动实验室器皿。



5. 配置 Move Labware 步骤以 Move labware from P9 to P8。

6. 复选第二个选项以 Move stack, leaving the bottom piece of labware atthe source position。这会告诉 Biomek 只抓起盖子，而将孔板留在其当

前位置。您的 Move Labware 步骤配置看上去应如图3-17 所示。

图 3-17、使用 Move Labware 取下盖子



3.7 在方法中堆叠孔板

Biomek FX 型仪器也能够处理实验室器皿堆叠，由利用夹持器的方法堆叠和拆

堆实验室器皿。在本节里，您将使用前面学到的关于 Loop 步骤和 MoveLabware 步骤的知识，堆叠四块来源孔板。

为此，您将使用有一个变量和一个表达式的另一个 Loop 步骤；该变量用于指

定拾取实验室器皿的台面位置，表达式则指定移动实验室器皿的目的位置。在

配置完毕后，这个三循环的 Loop 会如下表所示移动实验室器皿。

要堆叠四块来源孔板：

1. 在 Unload Tips 步骤下面插入一个 Loop 步骤。

2. 将此 Loop 步骤配置为创建一个名为 stack 的 Variable，其 Start 值为 7、End 值为 5、 Increment 值为 -1。

图 3-18、堆叠孔板的 Loop

BIOMEK 概念使用堆叠

在堆叠或拆堆实验室器皿

时， Biomek 软件由下而上工

作。如果是在台面上堆叠四

块微孔板，夹持器会将顶层

孔板放在第二层孔板上，然

后将上两层孔板放在第三层

孔板上，最后将上三层孔板

放在底层孔板上。

为了遵守 Biomek FX 型仪器

夹持器的堆叠规则，这些孔

板必须以此方式堆叠。如需

更多信息，请参阅 BiomekSoftware User's Manual（Biomek 软件用户手册）第

8.3.6.4.1 节 Biomek StackingRules （Biomek 堆叠规则）。

Biomek FX型仪器上允许的微

孔板堆叠最大高度为 5.5 cm（2.17 英寸）。四块标准 96 孔

板的堆叠约为 5.2 cm（2.05 英

寸）高。

表 3-1、循环的 Move Labware 步骤中所用变量和表达式的值

循环堆叠值自（"P"&stack）至（"P"&(stack-1)）1 7 P7 P6

2 6 P6 P5

3 5 P5 P4

4 4 堆叠的值小于 End 值，

中断环回，继续方法运行。



3. 在 Loop 图标和 End Loop 图标之间插入一个 Move Labware 步骤。

4. 在 Move Labware from 中键入 ="P"&stack。

5. 在 to 中键入 ="P"&(stack-1)。复选第一个选项：Move the entire stackof labware。您的 Move Labware 配置看上去应如图3-19 所示。

图 3-19、使用变量堆叠孔板

现在请转到本自学教程的最后一章，学习如何使用 Biomek 软件的一些高级

功能。

提示

使用连接运算符 &是用变量指定台面

位置的有用方法，

因为它会将变量的

值附加在常数字符

"P" 后面。

多通道 Pod 蜒使用工作单和条件 4-1


4 多通道 Pod 蜒使用工作单和条件

4.1 使用工作单和条件引言

为了成功地完成本章中的活动，您将需要知道如何：

• 配置一个 Instrument Setup 步骤，以反映您将为本章中的方法而设置

的实物台面（请参阅第1.3.2节配置 Instrument Setup 步骤）。

• 为您将在本章中使用的实验室器皿配置 Labware Properties。

• 配置一个 Transfer 步骤（请参阅第1.4节移液）。

• 配置一个 Move Labware 步骤。

• 在Biomek软件中使用变量和表达式（请参阅第3.3.1节在Start步骤里创

建变量）。

• 显示步骤选择板。

4.1.1 在使用工作单和条件中您将学到的知识

在本章中，您会发展将诸如工作单的外部数据源与 Biomek 方法合用的高级技

能。使用工作单将令您创建的方法可以使用在文本文件中定义的来源和目的

体积。您还将学到如何使用程序而在方法中若干次运行同一组已配置的步骤，

从而消除必须若干次配置每个步骤的情形；以及学到如何配置条件语句，用

来允许一个或多个步骤基于在方法运行中发生的实时条件而得到执行。

4-2 多通道 Pod 蜒使用工作单和条件



• 创建定义变量和值的工作单文件。

• 在Worklist步骤中使用工作单文件，从而无需配置单个Transfer步骤，

即可执行一系列的移液操作。

• 使用 If 步骤，基于条件决定用特定移液头由特定液槽移液。

• 使用 Define Procedure 步骤定义程序；该程序将基于 If 步骤中的条件

决定而运行。

• 使用 Run Procedure 步骤，基于条件决定运行已定义的程序。



4.1.2 为使用工作单和条件设置您的台面

使用您在第 1 章中学到的知识，启动 Biomek 软件，然后如下配置一个

Instrument Setup：

1. 在 P1 上放一箱 AP96 200µL 移液头箱并且命名为 TipsA。配置 Load nomore than 为 6。这意味着此移液头箱中的移液头不会重复使用超过 6 次。

2. 将相同的移液头箱类型放在 P2 上且命名为 TipsB ；将它如同 P1 一样配

置。

3. 在 P5 上放一个 Reservoir 且命名为 A，给它 100000µL 的 Known 体积

Water。

4. 在 P6 上放一个 Reservoir 且命名为 B，给它 100000µL 的 Known 体积

Ethanol。

5. 将 BCFlat96 孔板放在 P9、P10、P11、P13、P14、P15 上。给予每块孔

板 100 的 Known 体积 Water （请参阅侧边提示）。

6. 在每块 BCFlat96 孔板上放一个 TiterPlateLid。

请确定主编辑器上有下列步骤选择板：

• Basic

• Intermediate

• Advanced

• Specialty

提示

鉴于您将配置六块

属性相同的

BCFlat96 孔板，您

可以将第一块放在

P9 上并加以配置，

然后右击该板并选

取 Copy，接着单击

P10、 P11、 P13、P14、P15。实验室

器皿类型和属性就

会复制到那些位

置。



您的台面看上去应如图4-1 所示。现在请前往下一项活动，学习如何在您的方

法中使用工作单和条件。

图 4-1、 Instrument Setup 步骤已配置



4.2 创建工作单文本文件

工作单属于文本文件，其中包含一个或多个变量的多个值。 Biomek 软件的

Worklist 步骤使用在工作单定义的变量和值，在方法运行中配置一系列的重复

操作。这与您在本自学教程前面学到的 Loop 步骤的不同之处，在于工作单能

够包含非递增值和多个变量供在重复操作中使用。

您在能够使用Worklist 步骤之前，必须创建工作单文本文件和定义变量及关联

的值。就本章中的方法而言，您将为一系列的移液创建一个工作单，其中每次

移液的液体数量都不相同。

4.2.1 配置工作单文本文件

工作单文本文件的第一行定义变量名称。后续行列出将分配给这些变量的值。

变量和名称用逗号分隔。

要配置本自学教程的工作单文本文件：

1. 使用 “记事本”（Notepad）或 Microsoft Excel 创建一个如图4-2 所示的文

本文件。

图 4-2、已创建的工作单

2. 将您的文本文件以myworklist为名称保存在默认的“我的文档”文件夹中。

现在您已经配置了工作单，您将插入和配置一个 Worklist 步骤，令软件能够在

方法中使用此工作单。请前往下一节，学习如何完成此工作。

提示

如果诸如孔板名称

或条码的某个值包

含逗号，请将整个

值放在双引号内，

例如 "Dest1,4"。

提示

在创建工作单文本

文件时，值之间的

空格无关紧要，但

逗号（,）和回车

（CRLF）对正确创

建和使用此文件相

当重要。请勿在最

后一行结尾处加入

回车。



4.3 配置 Worklist 步骤以使用工作单

Worklist 步骤位于 Advanced 步骤选择板上。它向方法供应一个或多个变量的

多个值。倘若需要重复相同的动作，但一个或多个变量需要在此步骤每次循环

遍历此工作单时有所改变，Worklist 就会很有用处。当一个或一组步骤被放在

Worklist 步骤内且该等步骤使用在某文本文件中定义的变量时，Worklist 将就

该文本文件中的每一行自动执行每个步骤一次。

在本自学教程的这个部分，我们将使用一个 Worklist 步骤，从两个不同来源向

六块目的孔板转移特定数量的液体。您在第4.2节创建工作单文本文件中已经

配置的文本文件包含所有需要的详细资料。

要配置 Worklist 步骤：

1. 请确认您的台面已根据第4.1.2节为使用工作单和条件设置您的台面中的

指示得到配置。

2. 将一个 Worklist 步骤（图4-3）拖放到方法视图内的 Instrument Setup 步

骤下面。

3. 由配置窗口中的Worklistfile，使用Browse按钮找到和选取

myworklist.txt，即您在第4.2节创建工作单文本文件中已经配置的文本

文件。

4. 确认已复选 Loop entire worklist。这样就确保工作单中包含的所有值都

会得到使用。 Worklist 步骤配置看上去应如图4-3 所示。

BIOMEK 概念Worklist 步骤

Worklist 步骤具有若干项优

点：

• 文本文件中的数据可供

任何 Biomek 软件方法取

用。

• 在Worklist步骤配置中选

取该文本文件，即可将

所有变量数据由该文本

文件复制到此步骤，这

就无需逐个输入所有变

量。

• 在方法和文本文件之间

存在一个动态链接。对

文本文件的任何更新都

将包括在下一次方法运

行中，只是该文本文件

必须保持原有文件路

径，以让该方法可以找

到该文件。



图 4-3、已显示文本文件的 Worklist 步骤

现在，您要使用 Define Procedure 步骤定义一个程序，并且将它插入到

Worklist 步骤前面。这个程序会在您的方法循环遍历工作单的过程中运行。它

将被配置为装上移液头、移液、卸下移液头。

提示

您可以使用 Loopfrom line 而只针对

工作单中的某些行

执行此环回。

Worklist步骤



4.4 定义和运行程序

Define Procedure 步骤用于配置和保存一系列的步骤。该程序中这些步骤无需

逐一重新配置即可在方法中多次使用。Run Procedure 步骤将被插入到方法中

和用于指明将在方法中使用的已定义程序。在 Define Procedure 步骤中定义

的程序，只可通过插入Run Procedure步骤和在其步骤配置中选取欲用的程序

来运行。

4.4.1 使用 Define Procedure 步骤定义程序

在本自学教程的这个部分，您将插入和配置一个 Define Procedure，用来装上

特定移液头、转移基于您先前已配置之工作单的体积、然后卸下移液头。此已

定义的程序于是将作为您将在后面学习和配置的 If步骤的组成部分而运行。您

也将在这个程序里创建变量，其值将在 Run Procedure 步骤中指定。这使您可

以用与已定义的变量关联的不同值运行程序中的步骤。

1. 由 Specialty 步骤选择板（图4-4），在 Instrument Setup 步骤下面插入一

个 Define Procedure 步骤。

2. 在 Procedure 域中输入 TransferReagent（图4-4）。这就成为此程序的名

称且将在方法视图中作为 Define TransferReagent 出现。

图 4-4、程序已命名

3. 在 Variable Name 列中输入 Reagent，用 Tab 键转到 Default Value 列且输

入 A。

4. 按键盘上的 Enter 键，然后在 Variable Name 列中输入 Volume，用 Tab 键

转到 Default Value 列且输入 =AmountA。

5. 双击方法视图中的 Define TransferReagent 步骤以显露 End Procedure。

BIOMEK 概念程序

程序具有多项长处，例如在

方法中多次运行相同的步

骤，但只需配置这些步骤一

次。通过在方法视图中只显

示Run Procedure 步骤，而非

该程序访问的所有步骤，程

序可以控制方法视图中当前

方法的大小。

Define Procedure

步骤



4.4.2 配置 Define Procedure 步骤内的步骤

要配置 Define Procedure 步骤，从而取下 BCFlat 96 微孔板上面的盖子、装上

特定移液头、转移基于您先前已配置之工作单的体积、卸下移液头、然后将盖

子盖回到 BCFlat 96 微孔板上，您将需要在 Define Procedure 步骤中逐个配置

下列步骤：

• Move Labware 步骤（请参阅第4.4.2.1节使用 Move Labware 步骤取下

盖子）

• New Tips 步骤（请参阅第4.4.2.2节配置访问来源的不同移液头）

• Transfer 步骤（请参阅第4.4.2.3节在程序中移液）

• Unload Tips 步骤（请参阅第4.4.2.4节在程序中卸下移液头）

• Move Labware 步骤（请参阅第4.4.2.5节使用 Move Labware 步骤盖回

盖子）

此 Define Procedure 将作为您在后面配置的 If 步骤的组成部分而运行。



4.4.2.1 使用 Move Labware 步骤取下盖子

在 Define Procedure 步骤中插入和配置一个 Move Labware 步骤，用于在每次

移液前取下目的孔板上的盖子和将盖子放在空闲台面位置 P8 上。

1. 由Basic步骤选择板，将一个Move Labware步骤插入到Define Procedure中 End Procedure 步骤前面。 Define Procedure 步骤目前显示为 DefineTransferReagent 步骤。

2. 在 Move labware from 域中输入 =Destination。

3. 在 to 中选取 P8。

4. 复选 Move the topmost 1 piece of labware from the stack.。此选项只

允许移动盖子（堆叠顶层件）。主编辑器看上去应如图4-5 所示。

图 4-5、已配置的 Move Labware 步骤



4.4.2.2 配置访问来源的不同移液头

鉴于本自学教程方法中的液槽装有不同的液体，您将想要为每个液槽指定不

同的移液头。您将配置 New Tips 步骤作为程序的组成部分，以确保正确的移

液头被装上和用于访问正确的来源液槽。

1. 由 Intermediate 步骤选择板，在方法视图中 Define Procedure 内 MoveLabware from =Destination 步骤下面插入一个 New Tips 步骤。

2. 在配置视图的Tips域中，突出显示此域并输入="tips"&reagent（图4-6）。

图 4-6、 New Tips 已配置

4.4.2.3 在程序中移液

为了配置在此程序运行时将执行的实际移液，请完成如下工作：

1. 将一个 Transfer 步骤插入到方法视图中 New Tips 步骤下面。

2. 取消对 Load AP96_200µL tips 的复选。

3. 使用您在第 1 章中学到的知识，将此 Transfer 步骤中的 Source 配置为在

=Reagent 位置的 Reservoir。配置 =Reagent 意味着台面上的液槽具有与

将要使用的变量 Reagent 之值相同的名称。您将在后面于 Define 和 RunProcedure 步骤中配置这个变量。

4. 在此 Transfer 步骤中，将 Destination 配置为在 =destination 位置的

BCFlat96。配置 =destination 意味着目的将是您在工作单中已经配置的那

些目的。

5. 在 Destination 配置的 µL 域中输入 =Volume。

New Tips步骤



4.4.2.4 在程序中卸下移液头

在此您将配置这个程序，从而在移液操作后卸下移液头和将移液头放回到箱

中。要卸下移液头：

1. 将一个 Unload Tips 步骤插入到 Transfer 步骤下面。

2. 单击 Define TransferReagent 步骤。主编辑器看上去应如图4-7 所示，并

且您刚刚创建的已命名程序，将用于指定何时使用新的移液头，以及在移

液时将访问哪个液槽。

图 4-7、 Define Procedure 步骤已配置

4.4.2.5 使用 Move Labware 步骤盖回盖子

现在您将需要配置一个 Move Labware 步骤，将您在移液前取下的盖子盖回

去。

1. 将一个Move Labware步骤插入到方法视图中最后一个End分步骤上面。

2. 在 Move labware from 域选取 P8。

3. 在 to 域中输入 =Destination。

4. 复选 Move the entire stack of labware。

5. 单击 Finish 步骤验证此方法。

6. 双击 Define TransferReagent 步骤将它折叠起来。

提示

如果想要在其他方

法中重新使用某个

程序，请将已配置

的程序拖放到任何

一个在显示的步骤

选择板上。这样就

会出现一条屏幕提

示，询问您是否想

要将该步骤放在该

特定选择板上。您

也能够创建一个自

定步骤选择板（请

参阅 Biomek Soft-ware User's Manual（Biomek 软件用户

手册）第 30.4 节Customizing StepPalettes （自定步骤

选择板）。无论采

用哪种方法，此程

序日后就可通过被

拖放到方法视图中

而供其他方法使

用。



4.5 配置 If 步骤以在方法中使用条件

If 步骤控制着方法中基于条件决定而执行的步骤。在 If 运行时， Biomek 软件

会测验 If 条件是真或假，然后基于测验结果处理相应的分步骤组。（请参阅侧

边的 Biomek 概念。）

为了在本自学教程中配置 If 步骤以使用条件，您将：

• 插入一个 If 步骤和输入从来源 A 移液的条件。

• 为 Then 分步骤插入一个从来源 A 移液的 Run Procedure 步骤。

• 插入另一个 If 步骤和输入从来源 B 移液的条件。

• 为 Then 分步骤插入一个从来源 B 移液的 Run Procedure 步骤。

在您配置完 If 步骤后，您将在 Worklist 步骤中插入另一个 Move Labware 步

骤，用于将盖子由 P8 位置盖回到孔板上。

4.5.1 使用 If 步骤设置条件

在本自学教程的这一节中，您将配置两个 If 步骤；它们将基于您为 Worklist 步骤配置的来源，指定每次移液要访问的试剂槽和特定移液头箱。您将配置这些

If 步骤和将它们插入 Worklist 步骤。这些移液于是将运行您先前配置的

TransfersReagent 程序。该程序会找到正确的移液头，然后由正确的液槽转移

适当的体积。

BIOMEK 概念If 步骤

If 步骤的分步骤有：

• Then — 如果条件为真，

Then 后面的分步骤会得

到处理。

• Else — 如果条件为假，

Else 后面的分步骤会得

到处理。

• End — End 分步骤终止

每个 If、 Then、 Else 步

骤组。



要配置 If 步骤：

1. 由 Advanced 步骤选择板，在方法视图中 Worklist 步骤内插入一个 If 步骤。

2. 在 Condition 域中输入 AmountA > 0。主编辑器看上去应如图4-8 所示。

图 4-8、条件已输入到 If 步骤中

3. 由 Specialty 步骤选择板，在方法视图中 If 步骤的 Then 分步骤下面插入一

个 Run Procedure 步骤。

4. 在 Procedure 域中选取 transferreagent。



在本自学教程中，您不在 Else 分步骤中加入步骤。这意味着如果 If 步骤的评

估为假，就不会有进一步动作。主编辑器现在看上去应如图4-9 所示。

图 4-9、 transfersreagent 程序已作为 Then 分步骤而插入

5. 将另一个If步骤插入到方法视图最后一个End分步骤与End Worklist之间。

6. 在 Condition 域中输入 AmountB > 0。

7. 将一个Run Procedure 步骤插入到在方法视图中第二个 If 步骤的Then分

步骤下面。

8. 从 Procedure 域中选取 transferreagent。

9. 将 Reagent 的 Value 改成 B。



10. 将 Volume 的 Value 改成 =AmountB。您在此也不用 Else 分步骤，因此主

编辑器看上去应如图4-10 所示。

图 4-10、变量名称和值已改变

祝贺您！您刚刚使用工作单和带有已配置条件的 If步骤创建了一个方法。如果

您想要观看此方法以模拟方式运行，请单击工具栏上的绿色运行按钮。

在方法运行过程中，您会看到您创建的工作单如何得到执行。如果是从试剂 A移液，所用的是 TipsA ；如果是从试剂 B 移液，则使用 TipsB。移液的数量和

使用的目的孔板均依您在工作单中的配置而定。

本章结束 Biomek FX 型仪器多通道 Pod 的自学教程。后面尚有关于 Span-8 Pod的章节，因此请继续阅读，学习如何开始使用 Span-8 Pod。

Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门 5-1


5 Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使

用入门

5.1 介绍 Biomek 软件

欢迎使用 Biomek 软件和 Biomek FX 型实验室自动化工作站。

Biomek 软件控制 Biomek FX 型实验室自动化工作站上的 Span-8 Pod，并且设

计为：

• 为您完成大量的方法构建工作。

• 让您可以随心所欲地直接和精密控制此方法构建过程。

由此组合带来的灵活性，赋予了 Biomek FX 型实验室自动化工作站的强大功

效。

5.1.1 使用本自学教程

本自学教程设计为帮助您掌握将 Biomek 软件（3.3 版）与 Biomek FX 型仪器

上的 Span-8 Pod 一起使用。本自学教程中的各章可以依序修习，或者取决于学

习需要也可按任何顺序完成。这个格式让高级用户可以只完成包含他们需要

学习之主题的章节。一般说来，后续章节主题的复杂程度较高。本手册也有关

于 Biomek FX 型仪器上 Span-8 Pod 的章节。

本自学教程中关于 Span-8 Pod 的章节可与下列配置合用：

• 单一 Span-8 Pod.

• 带有一个多通道 Pod 和一个 Span-8 Pod 的混合系统。

提示

为了有效学习，请

在使用前打印本自

学教程，从而将计

算机屏幕完全用于

显示 Biomek 软件。

5-2 Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门


除本自学教程中的逐步指示外，您还将看到以如下形式包含有用信息的方框：

5.1.2 在 Biomek® 软件使用入门中您将学到的知识

在本章中，您将学习如何：

• 启动 Biomek 软件和查看方法构建过程的外观。



• 运行方法。

• 保存和登记方法。

BIOMEK 概念

这些方框包含的信息旨在帮

助您理解 Biomek 软件或

Biomek FX型实验室自动化工

作站的重要特征与能力。尽

管即使不阅读这些方框中的

信息，您也可完成本手册中

的逐步指示；这些信息将增

强您的知识，并且让您对

Biomek 软件和您仪器的能力

有更全面的了解。

提示

这些方框中的信

息，会就如何使用

您的仪器和软件来

增强您想要在实验

室中进行的活动，

向您提供建议。

如果使用固定移液头……

如果您的仪器上有固定移液头，这些方框中的指示将告

诉您如何使用这种移液头，而非自学教程指示中要求的

一次性移液头。



5.1.3 启动 Biomek 软件

由开始菜单，选取所有程序 > Beckman Coulter > Biomek Software。

如果 Beckman Coulter 账户与许可已在您的系统上启用，您必须有已经建立的

账户，并且使用该帐户名和密码登录，才能完整学习本自学教程。如需更多信

息，请与您的系统管理员联系。

5.1.3.1 查看主编辑器

主编辑器（图5-1）是您为 Biomek FX 型实验室自动化工作站构建液体处理方

法的起点。您将从一个步骤选择板上选取方法步骤，然后将这些步骤以线性方

式放入方法视图。其中每个步骤的配置会在配置视图中出现。

小心：系统安装完毕后请勿在 Hardware Setup 中变更 pod 设定；如果变更

pod 设定，则必须再次请专业维修人员服务。

倘若使用带有一个多通道 Pod 和一个 Span-8 Pod 的仪器，则在完成本自学教程

时应将 Span-8 Pod 设置为默认 pod。为此：

在工具栏上的 pod 图标中选定默认 pod （图5-1）。

图 5-1、 Biomek 主编辑器

BIOMEK 概念账户与许可

“Beckman Coulter 账户与许

可”是 Biomek 软件内建的一

套集成功能，用于协助用户

遵守《联邦条例汇编》21 CFRPart 11关于封闭系统的规定。

许可提供了控制用户进行特

定程序操作的能力。请参阅Biomek Software User's Manual（Biomek 软件用户手册）第 2章 Using Accounts & Permis-sions （使用账户与许可）。

步骤选择板

表示构建方法之预定义步骤的图标在这些区域中显示。

方法视图

将您想要您的方法完成的步骤放入此区域。

配置视图

每个步骤的配置在这个区域中出现。此视图将相应于在方法视图中突出显示的步骤而改变。

当前台面显示

显示会动态改变，从而反映上一步骤完成时的台面状态。

如果仪器上有两种 pod，请在

此选取 Span-8 Pod。



5.2 开始一个方法

如要开始一个方法，您可以选择创建一个新方法或开启一个您已经完成、命名

且保存的现有方法。在本自学教程中，您将创建一个新方法。

不过在创建新方法之前，请养成确认您在使用正确的项目文件的习惯。

5.2.1 介绍项目文件

尽管项目文件可被创建、修订、删除、导入、导出、登记或注销，在本自学教

程中，您将使用在仪器和 Biomek 软件安装时已经在系统上创建或导入的项目

文件。

请查看图5-2，了解由主编辑器如何存取或查看项目文件信息。

图 5-2、项目文件

BIOMEK 概念项目文件

项目文件存储关于液体类

型、实验室器皿与移液头类

型、孔图案及吸液管吸液模

板与技巧的信息，作为方法

文件用于配置仪器操作的修

正。项目文件存储对该项目

文件内细项之所有变更、添

加及删除的历史。方法与项

目关联且包含执行该方法所

需的全部细项。

项目文件

当前已开启的项目文件在此显示。这里显示的项目文件是在将Biomek 软件安

装到系统上时选定 BiomekFXP 型工作站的默认项目

文件。

与项目文件关联的动作和编辑

器在工具栏上 Project 下面的下

拉式菜单中显示。



5.2.2 创建新方法

如要创建一个新方法：

在上面的工具栏里选取 New Method （图5-3）。

这就创建了您的新方法的起点。您最好将Biomek 编辑器扩展到覆盖整个屏幕。

图 5-3、创建新方法时的主编辑器

5.2.3 理解开始步骤与完成步骤

如您可以看到（图5-3），主编辑器的方法视图现在包含 Start 步骤和 Finish 步

骤。这两个步骤在创建方法时自动出现。这两个步骤始终存在，用于指明每个

方法的开头和结尾。您将在 Start 和 Finish 之间插入想要 Biomek FX 型仪器完

成的其余所有步骤。

当方法视图中的 Start 步骤被突出显示时，您会看到在配置视图中创建一些变

量的机会。在本自学教程中的第一章里，请不要理会此配置。

如果现在就想要知道关于 Start 配置的更深入信息，请参阅 Biomek SoftwareUser's Manual （Biomek 软件用户手册）第 13.2.1 节 Configuring the Start Step（配置开始步骤）。

您将在第5.4.4节确定方法完成估计时间（ETC）进一步学习对 Finish 步骤的

使用。

BIOMEK 概念方法

方法是控制 Biomek FX 型仪

器操作的一系列步骤。主编

辑器里的步骤选择板上有一

组图标，表示方法中可用的

步骤。如要构建一个方法，您

只需选定想用的步骤图标，

并且将它移到主编辑器的方

法构建空间（方法视图）中。

放入和配置每个步骤，以执

行想要的操作。

新方法



5.3 设置台面

设置台面包括：

• 经由Deck Editor，确认Biomek软件中使用的当前台面与仪器的实物台

面一致。

• 配置 Instrument Setup 步骤，告知软件有哪些实验室器皿和每件实验

室器皿在台面上占据的台面位置。

5.3.1 确认 Biomek 软件中的台面正确无误

为了避免硬件碰撞，要点在于让 Biomek 软件中的台面与仪器的实物台面一

致。如果您想要在硬件上而不是以模拟方式运行这些自学教程方法，并且您的

台面与在此所示者不同，您可能必须修改这些方法，才能与您的硬件配合使用

（图5-4）。

附注：自动化实验室器皿定位器（Automated Labware Positioners，简称 ALP）是安装在台面上的可拆卸、可互换平台结构，用于完成自动化测定。

本自学教程中的步骤假定软件中当前台面的右起第一列和第二列之间包括一

个 Span-8 洗涤 ALP，因为您在后面将用到这个 ALP。您也将需要在后排右起

第一列位置有一个 Span-8 弃置 ALP。

BIOMEK 概念Deck Editor

Deck Editor 用于定义和更改

存储于当前仪器文件中的台

面配置。台面是 Biomek 仪器

台面的软件目视表示，可供

多个方法存储和使用。但是，

软件台面必须始终与该方法

中使用的仪器实物台面一

致。请参阅 Biomek SoftwareUser's Manual （Biomek 软件

用户手册）第 6 章 Preparingand Managing the Deck（准备

与管理台面）。



为此：

1. 查看当前软件台面（图5-4）。

2. 确认一个 Span-8 洗涤 ALP 已放在右起第一列和第二列之间，并且一个

Span-8弃置ALP也已放在后排右起第一列位置。请参阅如何添加这些ALP的侧边提示。

图 5-4、本自学教程的当前机台

5.3.2 配置 Instrument Setup 步骤

本自学教程的下一项活动是配置移液程序的 Instrument Setup 步骤。您将在台

面上放置：

• 移液头

• 来源液槽

• 目的微孔板


则不必有 Span-8 弃置 ALP。

提示

如要在您的台面上

添加一个 Span-8 洗涤 ALP，请选取Instrument>DeckEditor。当前台面

出现。然后由 All，突出显示

Span8WashLeft并将它拖到适当位

置。要添加 Span-8弃置 ALP，请突出

显示Span8TrashRight并将它拖放到适当

位置。您在添加这

些 ALP 之前可能必

须从台面上删除其

他 ALP。然后选取

Renumber，确保

您的台面与图5-4所示的台面一致。

Span8TrashRight

Span8WashLeft

尽管默认台面有一

个移液头装载器

ALP，该 ALP 只与多

通道 Pod 合用。

提示

倘若 InstrumentSetup 步骤或任何

步骤被插入在方法

视图中的错误位

置，您可以将它拖

放到适当位置。



要插入 Instrument Setup 步骤：

1. 选取（突出显示）方法视图中的 Start。

2. 让光标在步骤选择板中的 Instrument Setup 图标上悬停。在悬停的同时

查看方法视图，您将看到就在 Start 下面出现了一个黑条。此黑条指明下

一步骤将出现的插入点。在本例中，这是 Instrument Setup 步骤将插入的

位置。

3. 单击 Instrument Setup 图标，插入此步骤。 Instrument Setup 配置出现

（图5-5）。

图 5-5、 Instrument Setup 步骤配置

可用的实验室器皿

表示您的方法的实验室器皿选择。请将您的选择移到台面布局显示上。

台面布局

代表您的 BiomekFX 型仪器台面的

布局。请将您的实验室器皿放在欲用的台面布局位置上。

向下移动此滚动条以显示全

部实验室器皿选择。



使用您刚才插入的 Instrument Setup 步骤，您将学习如何选定和放置：

• Span_8_200µL 移液头在 P14 台面位置上

• Reservoir 在 P4 台面位置上

• BCFlat 96 微孔板于 P5 台面位置

要选取和放置实验室器皿：

1. 单击 Span_8_200µL 移液头图标，然后单击 P14 台面位置。请注意，当

您让光标在移液头箱上悬停时，会有一条工具提示指明台面位置和实验室

器皿。此技巧适用于您放置在台面上的所有实验室器皿。

2. 使用上述程序，将一个 Reservoir 放在 P4 台面位置。

3. 将液槽在台面上定位后，双击此图标或右击并选取 Properties。这就会开

启 Labware Properties（图5-6）。加入台面布局的每件实验室器皿都使用

Labware Properties 配置。 Labware Properties 中提供的信息在选取吸液

技巧或装上和卸下移液头时使用。

附注：指示 Biomek 仪器进行吸液管吸液操作的技巧，例如吸液、排液、

混合。

图 5-6、液槽的实验室器皿属性

4. 在 Labware Properties 里，您可以给此液槽一个名称。您将命名这个液槽

为 Rsvr，但一般说来，您可以随意给实验室器皿起名。在 Name 域中键入

Rsvr。在配置完成后，此名称会出现在当前台面显示中的液槽上

（图5-7）。


6. 在Volume域中键入100000。这意味着您知道来源液槽中有10万微升液体。

7. 在 Liquid Type 下拉式菜单中选取 Water，或者在此域中键入 Water。

8. 在本自学教程中请将 Bar Code 留为空白，但它可用来指明特定方法中的

具体孔板。

9. 略过 Sense the liquid level 的两个选项。因为我们已知实验室器皿中的体

积，我们在本章中将不使用液面高度感测功能，但您在后面章节中将使用

液面高度感测。

10. 选取 OK。

提示

为台面上的实验室

器皿命名会有帮

助。您可以指定一

个注明该实验室器

皿中内容物的名

称，或者符合正在

贵实验室中进行的

工作的描述性名

称。这样能够大大

减少混淆。



11. 将一个 BCFlat96 微孔板放在台面的 P5 位置上。

12. 双击此 P5 微孔板或右击并选取 Properties。

13. 在 Name 域中键入 Dest。


15. 在 Volume 域，将此值留为 0。

16. 请勿指定此目的孔板的 Liquid Type，因为它目前是空的。

17. 选取 OK。

这样就好了。您的台面现在已设置为移液，并且主编辑器看上去应如图5-7所示。

图 5-7、 Instrument Setup 步骤已完成

提示

您在选取Custom实

验室器皿类别后，

能够如您在这些步

骤中所做的那样设

置属性（名称、体

积、液体类型），然

后将该实验室器皿

向上拖并放回到可

用实验室器皿显示

中。此实验室器皿

将保留您设置的属

性，并且在您于其

他方法中访问

Instrument Setup时可供使用。



5.4 移液

现在您就可以插入和配置您的移液程序。 Biomek 软件在 Basic 步骤选择板上

提供一个 Transfer 步骤，令完成此任务轻而易举。

配置 Transfer 步骤包括配置：

• 移液头操作

• 来源实验室器皿

• 目的实验室器皿


为了设置移液，将 Transfer 步骤插入主编辑器的方法视图中，然后通过完成以

下工作来配置 Tip Handling：

1. 突出显示 Instrument Setup 步骤。

2. 从步骤选择板上选取 Transfer 图标，然后通过将它拖放到 InstrumentSetup 步骤下面而插入到方法中。Transfer 步骤配置出现（图5-8）。请注

意，编辑器底部的当前台面显示现已得到填充，从而反映您的台面设置；

这是因为它会为了与当前步骤开始时的台面状态一致而动态改变。

图 5-8、 Transfer 步骤已插入

3. 在 Use pod 中，请确认已选定 Span-8 Pod。如果您有一台混合式 BiomekFX 型仪器，请确定您在 Use pod 中选取正确的 pod ； Transfer 步骤的配

置看上去应如图5-8 所示。如果您的仪器上只有一个 Span-8 Pod， Span-8Pod Transfer 步骤配置将按照默认规定显示。

BIOMEK 概念Transfer 步骤

Span-8 Pod的Transfer步骤从

一个来源向一个或多个目的

移液。Transfer 步骤按照默认

规定将完成下列操作：装上移

液头、吸液、排液、卸下移液

头。此概念消除了插入四个

分开步骤的需要，尽管有的

方法偶尔需要单独完成这些

步骤。这些单独步骤将在本

自学教程的第 6 章中讨论。



4. 确定显示的移液头类型为 Span_8_200µL，即您在 Instrument Setup 中已

配置的移液头类型。


6. 允许默认的 Change tips between transfers 被复选。

7. 您的移液头已为您的移液得到配置，因此请单击 Tip Handling 旁边的向上

箭头（图5-8）。这将折叠 Tip Handling 配置，从而为实验室器皿配置留出

更多空间。在扩展的 Tip Handling 配置处会出现一个简单的文字说明，描

述操作移液头的方式。编辑器现在看上去如图5-9 所示。

图 5-9、 Tip Handling 已配置和折叠


在 Use Probes 中，右击任何探针并选取 Use FixedTips。您将不必撤消选定任何探针，因为您将使用此pod上已配置的所有探针。




现在您将配置来源实验室器皿。在此您将指定从哪个实验室器皿吸液，以及移

液头在吸液之前下降到该实验室器皿内的高度。

要将名称为 Rsvr 的液槽配置成来源实验室器皿：

1. 单击 Click here to add a source。

2. 单击当前台面显示中 P4 位置上的 Rsvr 实验室器皿。如您可见，您在

Instrument Setup 中提供的信息已在来源实验室器皿配置中显示。

3. 右击此配置中液槽图形旁边的大移液头图示，并且选取 Measure fromBottom。

4. 为了调整和设置移液头下降到液槽内的吸液高度，将鼠标放在移液头图示

上。当光标变成一只手后，按住鼠标左键上下移动，直至自底部的高度已

尽可能接近 1.00 mm。然后依照页边空白上的提示，将高度精确调整至

1.00 mm。带有大移液头的来源液槽图形底部有一个小小的中断，这是表

明液槽比此图形所能够显示的更宽。

来源实验室器皿完成，编辑器现在看上去如图5-10 所示。

图 5-10、已配置来源实验室器皿

提示

在单击移液头后，

您能够更精确地调

整其高度：通过使

用键盘上的向上或

向下箭头键每按一

下将高度改变 0.10mm，或者使用

Page Up 键和 PageDown 键每按一下

将高度改变 1.0mm。您也可以右击

此图形，然后在出

现的菜单中选取

Custom Height。




在此您将配置您想要将来源液槽中的水排出到何处。在本例中，您想要将水排

出到台面位置 P5 上的 BCFlat 96 微孔板内。

为此：

1. 单击当前台面显示中的 Dest 微孔板。这一项操作会完成与第5.4.2节配置

来源实验室器皿第 1 步和第 2 步相同的任务。请注意，来源实验室器皿配

置域现在已被概括该设置的一个简短句子所取代。如果您出于任何原因想

要重新开启此来源配置，请单击已折叠配置区域上的任何一点。

2. 双击此步骤配置中的 Destination Labware，放大这个实验室器皿。所有孔

都会按照默认规定被选定。

3. 鉴于所有的孔都已按照默认规定被选定，请单击第一列的第一个孔选定该

孔。现在，唯一被选定的孔是您刚刚单击的第一个孔，其他所有孔都已被

撤消选定。然后，通过按住 Ctrl 键并单击有关孔，在前六列上每隔一个孔

选定一个孔。您的图案看上去应如图5-11 所示。您刚刚已经配置了将由来

源液槽 Rsvr 注水的孔。

图 5-11、目的实验室器皿已放大

4. 保留 Direction、 Start、 Mark last well that is used 的默认选择。

5. 选取 Zoom Out。

6. 选定体积域，这就令您可指定排液量。在本次自学中，您要转移 100µL，因此请在 Volume 域中键入 100。这意味着您将在每个已选定的孔内排液

100µL。

提示

如果您不小心开启

了太多的目的配

置，您只需右击配

置的标题。单击弹

出菜单中的

Delete，整个配置

就会消失。



7. 右击大移液头图示，并且选取 Measure from Bottom。

8. 使用与设置吸液高度的相同技巧，在大移液头图示中将排液高度设置为

1.00 mm from bottom。

目的实验室器皿现已得到配置，并且编辑器看上去如图5-12 所示。

图 5-12、已配置目的实验室器皿

体积域



5.4.4 确定方法完成估计时间（ETC）

您的移液已经设置完毕，现在让我们用 Finish 步骤，看看运行整个方法将需要

多久时间。

为此：

1. 单击方法视图中的 Finish 步骤。

2. 查看编辑器底部状态栏的 ETC 显示。这个方法的 ETC 大约为 1:32（图5-13）。 ETC 有些微变化是正常的。

图 5-13、 Finish 步骤显示 ETC

祝贺您！您刚刚使用 Biomek 软件构建了一个移液方法；您：

• 为新方法准备了主编辑器。

• 使用 Instrument Setup 步骤设置了台面和配置了您想要使用的实验室

器皿。

• 使用 Transfer 步骤添加和配置了移液。

ETC

在方法视图中的此方法完成估计时间。



5.5 运行方法

现在您已经构建了一个方法，让我们来运行一下。

5.5.1 验证方法和确认台面设置

当您选择 Run 时，此方法将在内部得到验证，以检查有无错误。在验证完成

后，主编辑器上将出现一条台面确认屏幕提示（图5-14）。此屏幕提示会显示

如软件所解释的台面设置。

如果您有意，您也可以在 Biomek 模拟器中查看此方法。请参阅第5.5.2节在

Biomek 模拟器中查看方法。

要确认台面设置：

1. 单击工具栏上的绿色箭头按钮或由 Execution 菜单选取 Run。台面确认出

现（图5-14）。

2. 目视确认实物台面设置与台面确认一致。

图 5-14、台面确认屏幕提示

3. 如果台面确认与实物台面设置一致，请选取 OK ；或者选取 Abort，然后

依照实物台面设置，更改 Instrument Setup 步骤。一旦选择 OK，此方法

会立即开始运行。您可以在方法视图中目视跟踪此方法的运行；正在执行

的步骤会突出显示。

提示

如果此方法将在硬

件上运行，而不是

以模拟方式运行

（请参阅第5.5.2节在Biomek 模拟器中

查看方法），请确

定空气已从管线中

清除（参阅 BiomekSoftware User'sManual（Biomek 软

件用户手册）第

13.17.6 节 PurgingAir From Span-8 PodBefore a Method Run(FX and NX-S8 Only)（在方法运行前从

Span-8 Pod 中清除

空气（限 FX 型和

NX-S8 型））。



5.5.2 在 Biomek 模拟器中查看方法

小心：请确定正确的端口已在 Hardware Setup 中选取。模拟只在用 Biomek模拟器运行方法时使用。如要在仪器上运行方法，请选择仪器连接的 COM端口。

当一个方法以模拟方式运行时， Biomek 模拟器出现，显示执行该方法之仪器

的动画立体模型。设置模拟模式在 Hardware Setup 中配置（图5-15）。

如果您想要以模拟方式观看方法：

1. 从工具栏上选择 Instrument > Hardware Setup。 Hardware Setup 出现

（图5-15）。

图 5-15、硬件设置

2. 由 Port，选取 Simulate。

3. 选取 Accept。现在每当运行方法时，Biomek 仪器的动画立体模型就会显

示（图5-16）。于是您可以观看 Biomek 仪器执行该方法中步骤的模拟。

BIOMEK 概念硬件设置

Hardware Setup 用于由适当

的 Biomek 仪器信息（包括

Biomek 模拟器）配置 Biomek软件。尽管 Beckman Coulter服务工程师通常负责安装和

配置新装置，您可能有必要

使用 Hardware Setup 安装、

配置及拆除其他装置。请参

阅 Biomek Software User'sManual （Biomek 软件用户手

册）第 5.2 节 Accessing Hard-ware Setup（访问硬件设置）。

在此选取 Simulate，即可让方法在 Biomek模拟器中运行。



如果您想要在硬件上运行方法，您必须回到 Hardware Setup，将 Port 从

Simulate 改为与 Biomek 仪器连接的微机 Com 端口。

图 5-16、以模拟方式运行方法

提示

模拟器能够是测试

方法的有用工具。

它可在不耗费贵重

的试剂或移液头的

同时确定有关方法

如预期地执行，并

且可在设置时和通

过加快运行速度而

节省时间。如需关

于模拟器的更多信

息，请参阅 BiomekSoftware User'sManual（Biomek 软

件用户手册）第 5.4节 Configuring theBiomek Simulator（配置 Biomek 模拟

器）。



5.6 保存方法

您将保存您刚刚创建的方法。

要保存方法：

1. 在工具栏上选取 Save Method 图标。

2. 在 Method Name 中键入保存您的方法的文件名。在本章中，请键入

Getting Started Tutorial （图5-16）。

图 5-17、保存方法

3. 选取 OK。现在您会看到，Biomek 主编辑器中的方法名称已经变成 GettingStarted Tutorial [Revision 1] （图5-18）。

BIOMEK 概念保存方法

方法可在构建过程中随时保

存。保存方法会自动登记该

方法和创建一个修订记录；

该记录会保留在保存方法时

的方法配置。不同修订可日

后由修订历史访问。倘若任

何项目细项，例如实验室器

皿定义或技巧，在方法被保

存后有变更，该方法在下次

开启时将使用最新的定义。

如需更多信息，请参阅Biomek Software User's Manual（Biomek 软件用户手册）第

13.9 节 Saving a Method（保存

方法）和第 13.12 节 ViewingMethod History （查看方法历

史）。



图 5-18、方法名称已改变

现在请前往下一章，学习如何在方法中使用更多的步骤。

Span-8 Pod 蜒在方法中使用更多步骤 6-1


6 Span-8 Pod 蜒在方法中使用更多

步骤

6.1 在方法中使用更多步骤引言

在本自学教程的上一章（请参阅第5章Span-8 Pod蜒Biomek® 软件使用入门），

您已经学到如何：

• 启动 Biomek 软件。



• 保存、运行及登记方法。

如果您已经知道如何完成第5章Span-8 Pod蜒Biomek® 软件使用入门中的这些


6.1.1 在方法中使用更多步骤中您将学到的知识

本章将针对诸如从试管向孔板移液、液面高度感测及序列稀释等任务，帮助您

发展创建方法的技能。您也将学习如何暂停系统以在台面上添加更多的实验

室器皿和处理错误。本章也将描述如何为了改善方法制作，使用 Single Step执行单一操作。

在本章中，您将学习如何：



• 在方法已开始运行后在台面上取下和添加实验室器皿。


• 使用自动序列稀释功能。



6-2 Span-8 Pod 蜒在方法中使用更多步骤


6.1.2 为在方法中使用更多步骤设置您的台面

使用您在第5章 Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入门中学到的知识，启动

Biomek 软件和用下列行动配置一个 Instrument Setup：

• 在 P5 上放一个 AP96_200µL_LLS 移液头箱。

• 在P9和P10各放一个SmallTuberack_Microfuge试管架，分别命名为

Tubes1 和 Tubes2。给它们 Nominal 体积 1000 µL 的 Serum，并且

选取 Sense the liquid every time a well is accessed "from theLiquid"。 from the Liquid 感测液面高度有助于改善吸液管吸液性能，

因为这样比较不太可能将空气与液体一起吸取。请参阅侧边提示。

• 在P13上放一块BCFlat 96，将它命名为Dest。给予这个微孔板0 µL的Known 体积。


法中使用其他步骤。

图 6-1、已完成 Instrument Setup 步骤

BIOMEK 概念液面高度感测

液面高度感测功能利用特别

设计的 LLS 移液头来确定实

验室器皿中的液面高度。更

多信息请见 Biomek® FX andFX-P Laboratory AutomationWorkstations User's Manual（Biomek® FX型和 FX-P型实

验室自动化工作站用户手

册）第 3.3.1 节 Liquid LevelSensing （液面高度感测）。



6.2 从多个来源向单一目的移液

为了从一个或多个来源向单一目的移液，我们使用 Combine 步骤。它与使用

单一来源和一个或多个目的的 Transfer 步骤相似。

与 Transfer 步骤相似， Combine 步骤按照默认规定将完成下列操作：

• 装上移液头

• 吸液

• 排液

• 卸下移液头

在这项活动中，您将使用默认移液头操作、配置两个来源、配置目的、以及配

置移液细节，从而完成试管至孔板移液和将标本汇集到 96 孔板的第一列中。


要设置 Combine 步骤，您将在方法视图中插入此 Combine 步骤，然后配置此

步骤。

为此：

1. 请确认您的台面已根据第6.1.2节为在方法中使用更多步骤设置您的台面

中的指示得到配置。

2. 在 Instrument Setup 步骤后面添加一个 Combine 步骤。

3. 确定 Span-8 Pod 和全部八个探针都已选定以供使用。请见图6-2。


您无需配置装上或卸下移液头的 Combine 步骤。



4. 鉴于您将使用默认设定进行移液，请折叠 Tip Handling。确定 LoadAP96_200µL_LLS tips, between transfers, and unload them whenfinished 在显示。您的主编辑器看上去应如图6-2 所示。

图 6-2、 Combine 步骤已插入且 Tip Handling 已折叠


要配置您将吸液的两个小试管架：

1. 单击 Click here to add a source （图6-2）

2. 单击 P9 上的 Tubes1。

3. 在 Volume 域中指定吸液量。在这个方法中，您将抽吸 25µL，因此请在

Volume 域中键入 25。

4. 单击当前台面显示中的 Dest 孔板，添加一个目的。您将在下一节中配置

目的，但为了激活另一个来源，必须在此选取目的。

5. 单击下一个 Click here to add a source。

6. 单击 P10 上的 Tubes2，然后在 Volume 域键入 25。


在 Use Probes 中，右击任何探针并选取 Use FixedTips。



这些来源现已得到配置，并且编辑器现在看上去应如图6-3 所示。

图 6-3、 Combine 步骤的来源实验室器皿已配置

提示

孔体积显示反映了

孔中所装液体的数

量。如果在此显示

中看不到液体，您

可能在无意中试图

从空的目的而不是

来源吸液。

孔体积显示




下一个任务是指定您想要排出已抽吸液体的目的。在这个方法中，您想要排液

到 P13 台面位置上 96 孔板的第一列中。要实现此目标：

1. 如有必要，向下卷动，直至看到Destination: Dest。单击Destination: Dest配置上任何一点。

2. 单击 P13 上的 96 孔板。

3. 双击此步骤配置中的 Destination 实验室器皿图形。

4. 请只选定第一列中的孔。

5. 选取 Zoom Out。

6. 在 Stop when finished with 中，确定已选取 Sources （图6-4）。

图 6-4、 Stop when finished with Sources 已选取

这样就好了。您刚刚完成了从两个来源吸液以排液到单一目的的 Combine 步

骤。请前往下一项活动，学习如何在排液后混合目的孔板中的液体。



6.3 混合实验室器皿中的内容物

在 Transfer 步骤和 Combine 步骤中，您可以改变液体处理功能，从而超越简

单的吸液和排液。举例来说，您可以关闭移液头接触功能，激活预湿功能，或

者配置混合操作。这些修改通过自定技巧实现，并且用于控制吸液过程。

假设您想要在两个来源的液体都已经排出后，混合目的孔板的内容物。

要完成这项任务：

1. 单击台面显示中的Dest实验室器皿。这样就会扩展目的实验室器皿配置。

2. 在 Destination 配置域中，选取 Customize。 Technique Editor 开启至

Dispense 选项卡（图6-5）。

图 6-5、 Technique Editor 的 Dispense 选项卡

BIOMEK 概念技巧

技巧是已预定义和存储之值

的集合，包括吸液与排液高

度、移液头接触及影响吸液

的其他属性。基于这些已存

储的值和属性集合，适当的

吸液技巧会得到自动选定。

如果想要控制这项原本是自

动的功能，您可以为移液中

的每个来源和目的选择

Customize。此自定选项也可

通过 Technique Editor 取得。


册）第10章Understanding andCreating Techniques （理解和

创建技巧）。



6.3.1 配置 “Mix after dispensing liquid”现在，您将配置在排液后混合目的中内容物的选项。

如要在排液后混合：

1. 由 Dispense 选项卡（图6-5），复选 Mix after dispensing liquid。此选

项的各域就会启用。我们将保留除混合数量与次数外的其他默认值。

2. 请在 Mix 域中输入 25。这就指定在混合过程中将吸液和排液的微升数。

3. 在 time 域中输入 2。这指定在排液后您想要混合液体的次数。

您已完成排液过程后混合的配置。Technique Editor现在看上去应如图6-6所示。

图 6-6、已在自定技巧中配置混合

4. 选取 OK。

在您配置好混合操作且回到 Combine 步骤配置后，您会看到一个表明此技巧

现包括混合的图标。这是在吸液管吸液技巧中表示不同程序的若干个图标之

一。您也将注意到，在技巧被自定后， Auto-Select 选项就会关闭。

提示

from the Bottom 吸

液有时能够导致液

体溢出，或者可能

污染移液头。在这

些情况下，从液体

中抽吸将是良好的

选择。这在本自学

教程中无需多虑，

因此您保留默认

值。



6.4 在方法运行中添加实验室器皿

现在您可以为另一个移液过程在台面上添加实验室器皿。假设您想要在目的

孔板上加入另一种试剂，但您不希望在第一个 Transfer 完成之前将第二个试

剂放在台面上（或许该试剂只能与光线或外界空气有很短暂的接触）。这意味

着您将在您的方法中添加第二个 Instrument Setup 步骤，向软件表明台面上现

在有更多的实验室器皿。

但是在添加第二个 Instrument Setup 步骤前，您将：

• 通过配置一个Move Pod 步骤，把 pod 移动到新的台面位置，从而确保

pod 被移到台面上不会妨碍您实际添加更多实验室器皿的地方。

• 通过配置一个 Pause 步骤让仪器暂停，给予您足够的时间来实际添加


6.4.1 移动 pod 到新位置

Intermediate 步骤选择板上的 Move Pod 步骤会重新定位 pod，从而避开台面

上您想要人工到达的位置。由于您将要在台面上添加更多的实验室器皿以准

备另一个移液，您将需要让 pod 离开台面上的有关位置，然后暂停系统和添加


然而，由于 Move Pod 步骤是在 Intermediate 步骤选择板上，您在将此步骤添

加到您的方法中之前，需要首先显示该步骤选择板。



6.4.1.1 显示 Intermediate 步骤选择板

要将 Intermediate 步骤选择板加入主编辑器：

1. 右击 Basic 步骤选择板下面任何一点。

2. 选取 Intermediate。Intermediate步骤选择板出现在主编辑器上（图6-7）。

图 6-7、 Intermediate 步骤选择板已显示

BIOMEK 概念步骤选择板

步骤在步骤选择板上的分

组，是基于所控制之操作的

复杂性和配置时所需的知识

深度；但有些步骤则是依照

所控制的具体pod或仪器在步

骤选择板上分组。

Intermediate步骤选择板

Move Pod步骤



6.4.1.2 配置 Move Pod 步骤

要配置 Move Pod 步骤：

1. 将 Move Pod 步骤插入到方法视图中 Combine 步骤下面（图6-7）。

2. 从 Location 下拉式菜单中选取 P16。这将指示 pod 移到 P16 位置上方停

下（图6-8）。

图 6-8、已配置的 Move Pod 步骤


6.4.2 暂停仪器

通过添加和配置一个 Pause 步骤，您能够使仪器在方法运行中暂停指定的时

间或不固定的时间。取决于暂停的目的，您可用下列方式之一配置此步骤：

• 如果想要在特定位置培养某件实验室器皿的内容物一段特定时间，则

配置您想要让该位置停顿且不会与仪器互动的秒数。

• 如果想要在方法运行中人工移动实验室器皿（将它在台面上移动，或

者从台面上取下以拿到诸如读出器的某个装置处），则配置此步骤以

暂停不固定的时间。

当在运行中到达 Pause 步骤时， pod 会留在上一次操作的位置。



6.4.2.1 配置 Pause 步骤

您将配置 Pause 步骤为不固定时间，从而可以在台面上人工添加更多的实验

室器皿。软件将在主编辑器上面显示一条信息，直至您完成人工操作，然后它

将恢复方法的运行。

要将配置 Pause 步骤为不固定时间：

1. 将一个 Pause 步骤插入到方法视图中 Move Pod 步骤下面。

2. 选取 Pause the whole system and display this message:

3. 用以下信息取代信息框中的 Paused：Remove and store the tube racksat P9 and P10, remove the tip box at P5, and place a diluent reservoirat P14 and two new tip boxes at P5 and P6.

主编辑器现在看上去应如图6-9 所示。

图 6-9、已插入信息的暂停配置

在这个方法运行时，您将看到如图6-10 所示的屏幕提示；它将在您选取OK前

一直显示。

图 6-10、显示已配置信息的暂停屏幕提示



6.5 添加第二个仪器设置步骤

现在您已经做好在方法运行中向台面上添加更多实验室器皿的准备，可以开

始配置第二个 Instrument Setup 步骤。您将在 Pause 步骤下面插入第二个

Instrument Setup 步骤。第二个 Instrument Setup 步骤不仅指明台面的目前状

态，而且令您可添加更多的实验室器皿。但在往台面上添加更多实验室器皿之

前，您将取下一些实验室器皿。

要配置第二个 Instrument Setup 步骤：

1. 将一个 Instrument Setup 步骤插入到方法视图中 User Pause 步骤下面。

这就会开启第二个 Instrument Setup 步骤配置。

2. 选取 As Is 方块下面的 Toggle。这就让软件知道，所有台面位置都将保持

不变。主编辑器现在看上去应如图6-11 所示。

图 6-11、添加 Instrument Setup 步骤和切换所有台面位置 As Is



3. 选取 Clear，然后单击 P5、 P9、 P10。这将清除试管架和用过的移液头

箱。主编辑器现在看上去应如图6-12 所示。

图 6-12、使用 Clear 来除去用过的移液头箱

6.5.1 在台面上添加实验室器皿

现在您将添加实验室器皿，为下一个液体操作过程蜒 Serial Dilution 蜒做好准

备。为此下一个液体处理过程，您将需要再添加两个移液头箱和一个附加来源

液槽。此新的实验室器皿就是您已经配置为要在仪器暂停等候人工放置时显

示的实验室器皿。

1. 在 P14 上放一个 Reservoir，将它命名为 Diluent。配置此液槽为装有

Unknown 体积的 Water。确定 Sense the liquid level the first time a wellwith Unknown or Nominal volume is accessed 襢 rom the Liquid” 已被选定。

2. 在 P5 和 P6 位置放上 Span_8_200µL 移液头箱。

您或许会觉得，方法视图中的所有这些步骤，让您的方法看起来相当复杂。请

前往下一节，学习您就此能够做些什么。

提示

尽管软件会自动找

到移液头，您必须

确定台面上有完成

作业所需的足够移

液头；否则您将收

到出错信息。


您将不添加移液头箱。



6.6 使用 Group 步骤

为了避免让方法看起来过于复杂，您可以通过在方法视图中插入Group 步骤，

依逻辑关系将一些步骤组合在一个独特的标题之下。在配置 Group 步骤的过

程中，这一组步骤会隐藏在方法视图中您给予的名称之下。

6.6.1 配置 Group 步骤

就本活动而言，您会将您的方法中已有的 Move Pod、 Pause、 InstrumentSetup 三个步骤组合在同一个标题之下。这些步骤都与序列稀释的准备关联。

要组合这些步骤：

1. 将 Intermediate 步骤选择板上的 Group 步骤插入到方法视图中 Move Pod步骤上面。

2. 双击此 Group 步骤以揭示下一个 End Group 步骤。如有必要向左卷动方

法视图。

3. 在步骤配置的 Group Label 域中输入 Pause to remove and add labware（图6-13）。

图 6-13、已配置 Group 步骤

4. 突出显示Move Pod步骤，然后将它拖放到Group步骤内End Group上面。

5. 分别对User Pause 步骤和第二个 Instrument Setup 步骤重复前面第 4 步。

BIOMEK 概念Group 步骤

Group 步骤令您可将一系列

相互连接的步骤“套”起来，

并且给此群组一个出现在方

法视图中的合理名称。这样

一来，在您开启您的方法时，

Group 步骤会以折叠方式显

现，其中的相互连接步骤被

隐藏起来。这会使得方法看

上去比较短，而且让您不必

上下卷动方法视图，即可看

到方法的更多内容。您只需

双击方法视图中的 Group 步

骤，即可扩展该步骤和显露

嵌套在其内的步骤。

Group步骤



现在，Move Pod、User Pause、第二个 Instrument Setup 三个步骤就合乎逻

辑地嵌套在一个 Group 步骤内（图6-14）。您可以通过双击 Group 步骤的标

题而酌情展开和折叠这个步骤。

图 6-14、已配置的 Group 步骤，其中嵌套的步骤已展开

请前往下一节，学习如何在一块微孔板上对同一个标本进行多次稀释。提示

与 Group 步骤相

同，Comment 步骤

不会在仪器上发起

任何动作。它是用

于在方法视图中为

方法提供描述信息

和附注。请参阅Biomek Software Us-er's Manual（Biomek 软件用户

手册）第 16.6 节

Comment Step（注解

步骤）。



6.7 对同一个标本进行多次稀释

Serial Dilution 步骤用于在一块微孔板上对同一个标本进行多次稀释。这个步

骤由一块微孔板上的孔向同一块微孔板上的其他孔移液，并且可能在这些孔

中添加稀释剂。

在下一项活动中，我们将使用 P13 上微孔板第一列中的标本。

1. 将一个 Serial Dilution 步骤插入到已折叠的 Group 步骤下面（图6-15）。

图 6-15、 Serial Dilution 步骤已插入

2. 确定 Span-8 Pod 和全部八个 Probes 都得到使用。

3. 在 Use Tips 中，选取 Span_8_200µL。

4. 单击 P13 上的 Dest 孔板。

5. 在 Volume 域中输入 50。这是您将由一个孔向下一个移液的体积。

6. 在Direction中，确定Left to Right已选定，因为您将跨孔板的行进行稀释。

7. 复选 Discard extra volume from last wells 和 Change tips betweentransfers。

8. 选取 Diluent Properties 以扩展。

9. 复选 Add diluent before transfer。

BIOMEK 概念Serial Dilution 步骤

Serial Dilution 步骤通过依序

进行下列操作，完成多次稀

释。

• 将一定体积的稀释剂转

移到所有已选定的孔

中。

• 将一定体积的标本从第

一个选定孔转移到下一

个选定孔中。

• 利用Technique Editor混合此溶液。

• 将一定体积的溶液转移

到下一个选定孔中。

• 利用Technique Editor混合此溶液。

• 重复此移液操作和混合

操作，直至所有选定孔

都得到使用。


在 Use Probes 中，右击任何探针并选取 Use FixedTips。

提示

Serial Dilution 步骤

必须使用邻近的

孔。就 Direction 而

言，Left to Right 比较快。



10. 选取 P14 处的 Diluent 液槽。这意味着在标本转移之前，稀释剂将被注入

所有孔内。

11. 通过在 Dilution Ratio 域中输入 2，将稀释比配置为 1:2。稀释比是标本体

积与总溶液的比率，因此 1:2 的稀释比意味着就每 µL 标本而言将加入 1µL的稀释剂，亦即 50% 稀释。

12. 确定 Change tips between diluent transfers 未被复选。

13. 突出显示Finish步骤以验证此方法。糟糕！！！屏幕上的醒目红色表明存

在错误（图6-16）。请前往下一节，学习如何纠正这个错误。

图 6-16、错误已显示


您不会遇到错误。但请通读下一节，学习如何对出错信

息做出响应。



6.8 对出错信息作出响应

在本项活动中，您将学习如何查找和响应您刚刚收到的出错信息。

6.8.1 查找错误

Biomek 软件以若干种方式警告您存在错误，包括：

• 在有错误步骤后面的任何步骤被突出显示时，错误步骤会用红色在方

法视图中呈现。

• 当您让光标在造成错误的步骤上悬停时，会出现一条描述错误的工具

提示。

• 关联的红色出错信息会在编辑器底部的状态栏中显示。

• 该错误会显示在紧靠状态栏上方的错误栏里。

在出错信息框中还会显示其他错误。这些错误陈述问题和显示适当的改正选

项。请参阅 Biomek Software User's Manual （Biomek 软件用户手册）第 26 章

Handling and Preventing Errors （处理和防止错误）。

6.8.2 纠正错误

在本自学教程中，出错信息是 Cannot liquid level sense with tip typeSpan8_P200。如果您还记得，您在第二个 Instrument Setup 步骤中使用了

Span_8_200µL 移液头，而不是您在第一个 Instrument Setup 步骤中使用的

AP96_200µL_LLS 移液头。由于您已将 Diluent 液槽的 Labware Properties 配

置为感测液面高度，并且您没有使用 LLS 移液头，因此出错。

要纠正这个错误：

1. 扩展 Group 步骤，然后突出显示第二个 Instrument Setup 步骤。

2. 将 P5 和 P6 上的移液头箱拖放到 Clear。

3. 将 AP96_200µL_LLS 移液头箱放在 P5 和 P6 位置上。

4. 突出显示方法视图中的 Serial Dilution 步骤。

5. 在 Use Tips 中，将移液头类型更改为 AP96_200µL_LLS。

6. 再次单击方法视图中的 Finish 步骤。

您看，错误已经得到纠正。

Biomek 软件会在您构建方法的过程中不断验证其步骤。每当您突出显示任何

一个步骤，当前方法中该点之上的步骤就会得到验证。如果遇到错误，造成错

误的步骤会用红色突出显示。

现在请前往下一节，学习如何在这个方法中使用 Single Step 查看每项操作。



6.9 使用 Biomek FX 型仪器完成单项操作

在这项活动里，您将使用 Single Step，查看您刚刚创建的方法的每项操作。

1. 请选取 Execution > Single Step。 Single Step 出现（图6-17）。

图 6-17、 Single Step

2. 在 Single Step 仍然打开时，从已转灰的工具栏中选取 Execution > Run。具体操作已显示的 Single Step 出现（图6-18）。如果您的台面上有已配置

的其他 ALP，它们的初始化过程会出现在 Single Step 中。

图 6-18、具体操作已显示的 Single Step

BIOMEK 概念Single Step

Single Step 会使Biomek 仪器

在一个步骤中的每项操作之

间暂停，从而允许目视确认

该操作的正确性。执行单项

操作能够帮助对方法进行微

调。

提示

在使用 Single Step时不要着急慢慢

来。如果在方法中

前进得太快，就可

能错过需要查证的

步骤。



3. 请选取 Prepare to load tips 下面的 Launch。下一项操作就会启动

（图6-19）。

图 6-19、下一项操作已启动的 Single Step

4. 再次选取 Launch。Biomek 屏幕提示出现。如果实物台面与软件屏幕提示

一致，请选取 OK。 Single Step 继续显示每项操作，以及 Launch 和执行

该操作的选项。

5. 通过选取 Launch 继续查看每项操作，或者如要停止 Single Step，则请选

取 Exit，以允许此方法运行且无查看每项操作的选择。

请前往下一章，学习如何使用单独步骤更精确地控制移液。

Span-8 Pod 蜒使用单独步骤移液 7-1


7 Span-8 Pod 蜒使用单独步骤移液

7.1 使用单独步骤引言

在本自学教程的前面章节（请参阅第5章 Span-8 Pod 蜒 Biomek® 软件使用入

门和第6章 Span-8 Pod 蜒在方法中使用更多步骤），您已经学到如何：

• 启动 Biomek 软件和构建、运行及保存简单的移液方法。



• 在方法已开始运行后在台面上取下和添加更多的实验室器皿。


• 使用自动序列稀释功能。


如果您已经知道如何完成这些任务，您可以直接由本章或后续章节入手。

7.1.1 在使用单独步骤移液中您将学到的知识

本章将帮助您增强您的方法构建技能，从而创建更高级的方法，使用变量、表

达式及 “环回”来重复任务。您也将学习如何节省和洗涤移液头，以及如何

查看日志文件。


• 使用单独步骤独立地吸液和排液。

• 使用变量和表达式。

• 使用 Loop 步骤重复操作。

• 使用单独步骤独立地装上和卸下移液头。

• 在方法运行中于 Span-8 移液头洗涤 ALP 处洗涤移液头。

• 查看与方法关联的日志文件。

7-2 Span-8 Pod 蜒使用单独步骤移液


7.1.2 为使用单独步骤设置台面

启动 Biomek 软件，开始一个新方法，然后使用 Instrument Setup 步骤配置下

列细项：

1. 1. 在 P9 上放一个 AP96_200µL_LLS 移液头箱。

2. 在P10上放一个Reservoir。将它命名为Source，然后配置为装有

Unknown 体积液体。

3. 在 P14 上放一块 BCFlat96 微孔板。将它命名为 Dest，然后配置为装有

Unknown 体积液体。

您的台面看上去应如图7-1 所示。现在请前往下一项活动，学习如何在方法中

使用单独步骤移液。

图 7-1、使用单独步骤的初始 Instrument Setup



7.2 使用单独步骤移液

在前面章节里，当您想要从一块孔板向另一块移液时，您使用 Transfer 步骤和

Combine 步骤完成所有必要动作蜒装上移液头、吸液和排液、卸下移液头。然

而，有时您会想要对这些操作有更直接的控制；例如对标本转移顺序或何时

装上、卸下、洗涤移液头的精确控制。

当您对移液操作需要有更多的控制，而 Transfer 步骤和 Combine 步骤不能提

供此控制时，您可以使用单独步骤配置移液。与 Transfer 步骤和 Combine 步

骤不同，这些单独步骤均只完成一项任务（例如：吸液、排液、装上移液头、

洗涤移液头或卸下移液头）。

在本节中，您将使用 Span-8 Aspirate 步骤和 Span-8 Dispense 步骤，从

Reservoir 来源向 BCFlat96 目的孔板移液。

7.2.1 使用 Span-8 Aspirate 步骤吸液

您可以使用 Span-8 Aspirate 步骤从微孔板或液槽吸液。

要使用 Span-8 Aspirate 步骤从液槽中吸液：

1. 请确认您已根据第7.1.2节为使用单独步骤设置台面中的指示配置台面。

2. 将 Span-8 Aspirate 步骤由 Span-8 步骤选择板拖到方法视图中并放在

Instrument Setup 步骤下面。



3. 在当前机台显示中，单击 Source 以将它选作吸液的来源实验室器皿。

图7-2 出现。

图 7-2、 Span-8 Aspirate 步骤的来源已选取

4. 复选 Individual Volumes，然后选取 Edit （图7-2）。 Individual Volumes出现。

5. 在 Individual Volumes 中，如图7-3 所示，将每根探针的吸液体积轮换设置

为 40 和 50。

图 7-3、已为 Span-8 Aspirate 步骤配置 Individual Volumes

6. 在 Individual Volumes 域中输入体积后，选取 OK。请注意该步骤配置上的

Volume 现已转成灰色。

Individual Volumes

Refresh Tips

Span-8 Aspirate 步骤



7. 在 Span-8 Aspirate 步骤配置中，复选 Refresh Tips（图7-3）。如此就会在

pod 吸液前装上新的移液头。请确定已选取 AP96_200µL_LLS。 Span-8Aspirate 步骤已得到配置，并且主编辑器看上去应如图7-4 所示。

图 7-4、 Span-8 Aspirate 步骤已配置

7.2.2 使用 Span-8 Dispense 步骤排液

现在已经抽吸了一些液体，您需要将它排出到另一件实验室器皿中。在本自学

教程，您将把已抽吸的液体排出到 Dest 孔板的一些孔中。

要排出之前抽吸的液体：

1. 将 Span-8 Dispense 步骤由 Span-8 步骤选择板拖到方法视图中并放在

Span-8 Aspirate 步骤下面。

2. 在当前机台显示中，单击 P14 位置上的 Dest，将它选作目的。

3. 确定此微孔板的第一列已被选定。


您不会装上和卸下移液头，因此无需刷新移液头。请跳

过第 7 步，前往下一节。

提示

如果已装上移液

头，Refresh Tips 将

在吸液前卸下那些

移液头（以及其中

的任何液体，如果

不空）和装上新的

移液头。这个选项

应只在没有装上移

液头或移液头是空

的时使用。



4. 复选 Individual Volumes，然后选取 Edit。Individual Volumes 出现。请注

意，您前面为 Span-8 Aspirate 步骤配置的体积会显示（图7-5）。

图 7-5、 Individual Volumes

5. 在 Individual Volumes 中选取 OK。请注意该步骤配置上的 Volume 现已转

成灰色。

您现在已经配置了一个简单方法，使用每根探针的单个体积从一个液槽来源

孔板吸液，然后使用单独步骤排液到一块目的孔板的一列中。您可以选择在

Biomek FX 型仪器或模拟器上运行这个方法（请参阅第5章 Span-8 Pod 蜒

Biomek® 软件使用入门）。

在下一节里，您将使用吸液和排液体积的一个变量重新配置这个简单方法。



7.3 在方法中使用变量

变量可以简化对方法的修改。在配置步骤时，您在欲用的域中输入变量的名称；

在方法运行时，变量的实际值将被代入且有关操作得到执行。

您现在将为单个移液体积创建一个变量，并且将它用于 Span-8 Aspirate 步骤

和 Span-8 Dispense 步骤。这包括：

• 在 Start 步骤里创建变量（第 7.3.1 节）

• 在步骤配置中使用变量和表达式（第 7.3.2 节）

• 在运行时更改变量的值（第 7.3.3 节）

7.3.1 在 Start 步骤里创建变量

Start 步骤除作为方法中的第一个步骤外，还能够用于创建和命名可在该方法

各处使用的变量。在Start步骤中命名的变量可用于配置该方法中的其他步骤。

Biomek 软件中的其他步骤也允许您创建变量，但那些变量属于局部变量且只

限用于其创建所在的步骤。您会在本章后面将局部变量与Loop步骤一起使用。

您现在将使用 Start 步骤为移液体积创建一个变量。

要在 Start 步骤里创建变量：

1. 从方法视图中选取 Start 步骤，从而显示其配置。

2. 在 Variable Name 域中输入 Vol。

3. 在 Value 栏，请输入 50。您的 Start 配置看上去应如图7-6 所示。您已经创

建了一个变量，其名称和值分别为 Vol 和 50。

图 7-6、 Vol 变量已在 Start 步骤中创建

BIOMEK 概念变量

使用变量有若干好处：

• 如果想要更改在方法中

多处使用的某个值，您

可以只在一处更改，然

后使用该变量的其他各

处都会自动更新。

• 变量的值可在运行时设

置，有关方法就会相应

自动更新。

• 您可在运行时基于变量

的值做出决定（这将在

下一章学习）。

提示

请勿使用变量名称

C__Volume。这个

变量已内建于

Biomek 软件且与追

踪体积关联。



7.3.2 在步骤配置中使用变量和表达式

您现在将在 Start 步骤中创建的变量 Vol 与表达式合用，配置 Span-8 Aspirate步骤和 Span-8 Dispense 步骤中移液的一些单个体积。

要在步骤配置中使用变量：

1. 选取方法视图中的 Aspirate at Source 步骤。

2. 选取 Individual Volumes 旁边的 Edit。

3. 如图7-7 所示，在 Individual Volumes 中，为 Probe 1 输入 =Vol （包括等

号），为 Probe 2 输入 =Vol+5，为 Probe 3 输入 =Vol+10。变量和表达式

在输入到步骤配置域中时，总是用等号起头。在此方法运行时， Vol 将被

此变量的值和表达式的计算值取代。在本例中，Probe 1 为 50µL，Probe 2为 50 ＋ 5 即 55µL， Probe 3 为 50 ＋ 10 即 60µL。

图 7-7、使用变量的 Individual Volumes 已输入

4. 选取 OK。

5. 在方法视图中选取 Dispense at Dest 步骤，然后使用您在配置 Aspirate atSource 步骤时的相同变量和体积，配置 Individual Volumes。您将需要配

置这项；因为与在第7.2.2节使用 Span-8 Dispense 步骤排液的行为不同，在

此它不会自动显示您在 Aspirate at Source 步骤中已配置的体积；这是因

为它只在有关步骤的体积初次得到配置时才会更新。

6. 在 Individual Volumes 已如图7-7 所示正确配置后，选取 OK。

如要改变您想要转移的体积，您将变更 Start 步骤中变量 Vol 的值。在 Span-8Aspirate 步骤和 Span-8 Dispense 步骤的 Individual Volumes 中为探针指定的

体积，于是将在 Vol 的值在运行时被代入时自动更新。

提示

变量名称不分大小

写，因此VOL、vol、Vol、VoL 都会被视

为相同的变量。

BIOMEK 概念表达式

表达式通过使用运算符修改

变量的方法组合文字、数字

常数及变量。这些运算符可

以完成多种数学运算或组合

文字串。如同变量一样，表达

式也会得到计算，并且结果

值会在运行时取代该表达

式。



7.3.3 在运行时更改变量的值

由于变量的值可通过在 Start 步骤变更该变量的值而在方法的各处改变，变量

使得重新配置除一两个细节外相似的不同方法快速简便。

就在 Start 步骤中创建的变量而言，您可以配置 Biomek 软件，从而在运行时提

示您为该变量指定一个值。如此配置之后，在该方法运行时，屏幕上会为每个

变量出现一个提示。您在 Start 步骤中为该变量输入的值现在成为该变量的默

认值。您可以通过选取 OK 而使用该值，或者输入一个新值并选取 OK，从而

变更该变量的值。该方法的运行于是将使用该变量的指定值且相应更新该方

法。

要在运行时更改变量的值：

1. 选取 Start 步骤。

2. 选取变量Vol的Prompt复选框。您的Start配置现在看上去应如图7-8所示。

图 7-8、提示输入变量的值



3. 运行此方法。一个屏幕提示出现，让您可以为该变量输入一个值

（图7-9）。

图 7-9、指定变量值的屏幕提示

4. 输入 40，然后选取 OK。如果您在 Biomek FX 型仪器上运行此方法，您应

会注意到，Probe 1 的移液量为 40µL，Probe 2 为 40 ＋ 5 即 45µL，Probe 3为 40 ＋ 10 即 50µL。

5. 如所有方法一样，台面设置确认屏幕提示出现。请适当回应。

在下一节里，您将学习使用变量和 Loop 步骤执行重复操作，从而向目的孔板

排液。



7.4 使用 Loop 重复移液步骤

Loop 步骤令您能够以多个循环重复一个或多个步骤。每个循环或迭代会重复

此 Loop 中包含的步骤。您也可在 Loop 步骤中创建一个选用的变量。这个变

量将被分配一个起始值，该值随着Loop的每个循环而递增，直至达到结束值。

在本节里，您将使用一个 Loop 步骤修改您的方法，从而向一块孔板的全部 12列而非只是第一列吸液和排液。为了完成这个任务，您将在 Loop 步骤内创建

一个变量，然后在方法执行中，随着移液操作的重复，用此变量重新配置

Span-8 Aspirate 步骤和 Span-8 Dispense 步骤。

7.4.1 使用 Loop 步骤重复操作

如果想要在一次方法运行中将某些操作重复若干次，您使用 Loop 步骤。Loop步骤令您可以重复一个或多个步骤的操作，而且无需为每次重复而插入和配

置那些步骤。将重复的步骤是放在（或嵌套在） Loop 步骤内的步骤。

Biomek 软件将内部跟踪每个循环的 Loop 值，而 Start、End、Increment 三个

值需要指定（请参阅侧边解释）。您能够选择为 Loop 值指定一个名称，从而

创建一个变量。这个变量于是可以象任何其他变量那样用于配置步骤，但只能

与 Loop 步骤内包含的步骤合用。

要重复 Span-8 Aspirate 步骤和 Span-8 Dispense 步骤：

1. 将一个 Loop 步骤插入到 Instrument Setup 步骤下面。 Loop 图标和 EndLoop 图标在方法视图中出现，并且 Loop 步骤配置会显示。

2. 在 Variable 域中输入 column。这将创建一个名为 column 的变量；它可

用来配置 Loop 内的步骤。

3. 在 Start 域中输入 1。这将是在此环回的第一次迭代中分配给变量 column的初始值。

4. 在 End 域中输入 12。这将是变量 column 的最终值。当 column 的值超过

End 值时，此 Loop 步骤结束，并且继续执行方法的其余部分。

BIOMEK 概念Loop 步骤

Loop 步骤会重复已嵌套的一

个或多个步骤，直至超过其

End 值。对于 Loop 的第一个

循环来说，其值是 Start 值。

在完成该环回内的所有步骤

后，其值改变一个

Increment，这些步骤会再次

重复。这个过程将一直重复

下去，直到 Increment 将值改

变至超过 End 值。



5. 在 Increment 域中输入 1。 Increment 值是在此 Loop 每次迭代时，变量

column 的变化值。您的 Loop 步骤配置看上去应如图7-10 所示。

图 7-10、重复吸液和排液的 Loop 步骤

6. 将 Aspirate at Source 步骤和 Dispense at Dest 步骤拖放到 Loop 图标和

End Loop 图标之间。



7.4.2 在 Dispense 步骤中指定排液的目的列

现在您为创建变量 column 配置了 Loop 步骤，并且已经将 Aspirate 步骤和

Dispense 步骤放在此 Loop 内；您可以使用变量 column 重新配置Dispense 步

骤，从而使得 Dest 微孔板的全部 12 列都得到排液，而不只是您起初配置的第

一列。

1. 突出显示 Dispense at Dest 步骤配置。

2. 右击实验室器皿图形中的任何一点，然后选取 Specify Selection asText。 Text Selection 出现（图7-11）。

图 7-11、 Text Selection

3. 输入 =column。这意味着它将使用全部 8 根探针，由编号等于 Loop 变量

值的孔开始排液。由于第一行孔的编号为 1 至 12，它将从用 column 值开

始的列中吸液。

4. 选取 OK。

Dispense步骤配置看上去如图7-12所示。此实验室器皿的图形表示变成灰色，

表明排液的目标孔用文字指定。

图 7-12、 Loop 里的 Dispense 步骤



7.5 使用单独步骤节省移液头

按照此方法的当前配置，整整一箱的移液头都将被用掉。这是由于 Aspirate 步

骤会为 Loop 的每次迭代装上移液头。由于来源是一个液槽，并且无需挂虑交

叉污染，您可在 Loop 的全部 12 次迭代中重新使用移液头。为此，您将在 Loop前面使用一个 Span-8 New Tips 步骤，并且在 Loop 后面使用一个 Span-8 TipDiscard 步骤。

7.5.1 在 Loop 外装上和卸下移液头

要在 Loop 外装上和卸下移液头：

1. 在Instrument Setup步骤和Loop步骤之间插入一个Span-8 New Tips步骤。

2. 选取 Loop 内的 Aspirate 步骤。

3. 取消对 Refresh Tips 复选框的选定。这就告知 Biomek 使用已经装上的无

论何种移液头完成吸液，而不是在 Aspirate 步骤开始时装上新的移液头。

4. 将一个 Span-8 Tip Discard 步骤插入到方法视图中的 End Loop 图标下

面。您的方法现在看上去应如图7-13 所示。

图 7-13、在 Loop 外装上和卸下移液头

这个方法会装上新的移液头、使用相同的移液头完成 Loop 的全部 12 次迭代，

并且在 Loop 的最后一次迭代后卸下移液头。


您不用装上和卸下移液头。请前往下一节。

Span-8 New Tips 步骤



7.6 洗涤移液头心轴

如前一节所述卸下移液头后，您可以在 Span-8 洗涤 ALP 处洗涤移液头心轴。

如果您没有卸下移液头，一条错误信息将会显示，因为一次性移液头不能在

Span-8 洗涤 ALP 处洗涤。

您很可能实际上不需要洗涤移液头心轴，但请完成本节，学习如何使用 Span-8 Wash Tips 步骤。如果您迟早要使用固定移液头，您将想要知道如何使用这

个步骤来洗涤这些移液头。

现在您将添加一个 Span-8 Wash Tips 步骤，用来洗涤移液头心轴。

要洗涤移液头心轴：

1. 将一个 Span-8 Wash Tips 步骤插入到 Span-8 Tip Discard 步骤下面。

2. 在 Position 中选取 W1。

3. 确定全部八根探针都已选定。

4. 选取 Passive Wash。

BIOMEK 概念洗涤移液头

Span-8 Wash Tips 步骤通过

依指定次数吸取和排出指定

体积的洗液，在

Span8WashALPLeft 或

Span8WashALPRight洗涤移

液头。


将一个 Span-8 Wash Tips 步骤插入到 Loop 步骤下面。



5. 保留其他默认设定。主编辑器看上去应如图7-14 所示。

图 7-14、 Span-8 Wash Tips 步骤已配置

6. 突出显示 Finish 以验证此方法。

7. 选取 Options > Log Configuration > Span8Pipetting。您将在下一节里

查看此日志文件（请参阅第7.7节查看日志数据）。

8. 保存和运行此方法。

请前往下一节，学习如何查看与此方法关联的日志数据。

Span-8 Wash Tips 步骤



7.7 查看日志数据

日志提供方法运行的文字记录。此文字记录或日志文件的内容是基于所要求

的日志类型。可用的日志类型是基于 pod 类型。举例来说， Errors、Span8Pipetting、 Span8Transfer 按照默认规定可供您刚刚运行的方法使用，

不过您也可生成其他日志。请参阅侧边解释。

要查看您刚刚运行的方法的日志数据：

1. 浏览至 C:\Documents and Settings\All Users\ Documents\Biomek\Logs （图7-15）。

图 7-15、浏览日志

BIOMEK 概念日志文件

Span-8 Pod有下列日志文件可

用：

• Details — 捕获方法运行

中的每项操作。

• Errors — 捕获方法运行

中发生的任何错误。

• Span8Pipetting — 捕获

吸液操作，包括位置和

实验室器皿名称或类

型。

• Span8Transfer — 捕获

移液操作，包括位置和

实验室器皿名称或类

型。

• UnifiedPipetting — 捕获

吸液操作，以及有关孔

的标本 ID。

• UnifiedTransfer — 捕获

吸液操作，以及有关孔

的标本 ID。

更多信息，请参阅 BiomekSoftware User's Manual（Biomek 软件用户手册）第

27章Generating and Using LogData （生成和使用日志数

据）。



2. 双击最新的 Span8Pipetting 日志，图7-16 出现。

图 7-16、 Span8Pipetting 日志的一部分

3. 在图7-16 中，请就您刚刚创建和运行的方法，注意此日志的下列具体细

节。这些具体细节（依下列顺序排列）在日志的每一行由左至右显示。

• 方法运行的日期与时间。

• 执行操作的 pod （Pod1 或 Pod2）。

• 操作（吸液或排液）。

• 操作发生的位置。

• 在 Labware Properties 中指定给实验室器皿的名称。

• 吸液或排液的孔号。

• 探针号。

• 液量。

• 技巧名称。

4. 关闭文件。

请前往下一章，学习如何使用工作单和条件。

Span-8 Pod 蜒使用工作单和条件 8-1


8 Span-8 Pod 蜒使用工作单和条件

8.1 使用工作单和条件引言







建变量）。


8.1.1 在使用工作单和条件中您将学到的知识

在本章中，您会发展将诸如工作单的外部数据源与 Biomek 方法合用的高级技

能。使用工作单将令您创建的方法可以使用在文本文件中定义的移液量和目

的。您还将学到如何使用程序而在方法中若干次运行同一组已配置的步骤，从

而消除必须若干次配置每个步骤的情形；以及学到如何配置条件语句，用来

允许一个或多个步骤基于在方法运行中发生的实时条件而得到执行。


• 创建定义变量和值的工作单文件。

• 在Worklist步骤中使用工作单文件，从而无需配置单个Transfer步骤，

即可执行一系列的移液操作。

• 使用 If 步骤，基于条件决定用特定移液头由特定液槽移液。

• 使用 Define Procedure 步骤定义程序；该程序将基于 If 步骤中的条件

决定而运行。

• 使用 Run Procedure 步骤，基于条件决定运行已定义的程序。

8-2 Span-8 Pod 蜒使用工作单和条件


8.1.2 为使用工作单和条件设置您的台面

使用您在前面学到的知识，启动 Biomek 软件，开始一个新方法，然后如下配

置一个 Instrument Setup 步骤：

1. 在 P5 上放一个 AP96_200µL_LLS 移液头箱且命名为 TipsA。

2. 将相同的移液头箱类型放在 P6 上且命名为 TipsB。

3. 在 P9 上放一个 Reservoir 且命名为 ReagentA。将 liquid type 配置为

Unknown 体积的 Ethanol。

4. 在 P13 上放另一个 Reservoir 且命名为 ReagentB。将 liquid type 配置为

Unknown 体积的 Water。

5. 将 BCFlat96 孔板放在 P10、 P11、 P14、 P15 上。分别命名为 Plate1、Plate2、 Plate3、 Plate4。

请确定主编辑器上已显示下列步骤选择板：

• Basic

• Intermediate

• Advanced

• Specialty

• Span-8


法中使用工作单和条件。




8.2 创建工作单文本文件

工作单属于文本文件，其中包含一个或多个变量的多个值。 Biomek 软件的

Worklist 步骤使用在工作单定义的变量和值，在方法运行中配置一系列的重复

操作。这与您在本自学教程前面学到的 Loop 步骤的不同之处，在于工作单能

够包含非递增值和多个变量供在重复操作中使用。

您在能够使用Worklist 步骤之前，必须创建工作单文本文件和定义变量及关联

的值。就本章中的方法而言，您将为一系列的移液创建一个工作单，其中每次

移液的液体数量都不相同。

8.2.1 配置工作单文本文件

工作单文本文件的第一行定义变量名称。后续行列出将分配给这些变量的值。

变量和名称用逗号分隔。如果诸如孔板名称或条码的某个值包含逗号，请将整

个值放在双引号内，例如 "Dest1, 4"。

要配置本自学教程的工作单文本文件：

1. 使用 “记事本”（Notepad），创建一个如图8-2 所示的文本文件。

图 8-2、已创建的工作单

2. 将您的文本文件以 myworklist 为名称保存在计算机桌面上。如果您已经

学完多通道 Pod 的内容，并且想要保留您在多通道 Pod 章节中创建的工作

单，请将您的文本文件保存为 myworklistS-8。

现在您已经配置了工作单，您将插入和配置一个 Worklist 步骤，令软件能够在

方法中使用此工作单。请前往下一节，学习如何完成此工作。

提示

在创建工作单文本

文件时，值之间的

空格无关紧要，但

逗号（,）和回车

（CRLF）对正确创

建和使用此文件相

当重要。请勿在最

后一行结尾处加入

回车。



8.3 配置 Worklist 步骤以使用工作单

Worklist 步骤位于 Advanced 步骤选择板上。它向方法供应一个或多个变量的

多个值。倘若需要重复相同的动作，但一个或多个变量需要在此步骤每次循环

遍历此工作单时有所改变，Worklist 就会很有用处。当一个或一组步骤被放在

Worklist 步骤内且该等步骤使用在某文本文件中定义的变量时，Worklist 将就

该文本文件中的每一行自动执行每个步骤一次。

在本自学教程的这个部分，我们将使用一个 Worklist 步骤，从两个不同来源向

四块目的孔板转移特定数量的液体。您在第8.2节创建工作单文本文件中已经

配置的文本文件包含所有需要的详细资料。

要配置 Worklist 步骤：

1. 请确认您的台面已根据第8.1.2节为使用工作单和条件设置您的台面中的

指示得到配置。

2. 将一个 Worklist 步骤（图8-3）拖放到方法视图内的 Instrument Setup 步

骤下面。

3. 由配置窗口中的 Worklist file，使用 Browse 按钮找到和选取

myworklist.txt，即您在第8.2节创建工作单文本文件中已经配置的文本文

件。如果您在第8.2节创建工作单文本文件中保存工作单时使用的是

myworklistS-8，则请选取此名称。

4. 确认已复选 Loop entire worklist。这样就确保工作单中包含的所有值都

会得到使用。 Worklist 步骤配置看上去应如图8-3 所示。

图 8-3、已显示文本文件的 Worklist 步骤

现在，您要使用 Define Procedure 步骤定义一个程序，并且将它插入到

Worklist 步骤前面。这个程序会在您的方法循环遍历工作单的过程中运行。它

将被配置为装上移液头、移液、卸下移液头。

BIOMEK 概念Worklist 步骤

Worklist 步骤具有若干项优

点：

• 文本文件中的数据可供

任何 Biomek 软件方法取

用。

• 在Worklist步骤配置中选

取该文本文件，即可将

所有变量数据由该文本

文件复制到此步骤，这

就无需逐个输入所有变

量。

• 在方法和文本文件之间

存在一个动态链接。对

文本文件的任何更新都

将包括在下一次方法运

行中，只是该文本文件

必须保持原有文件路

径，以让该方法可以找

到该文件。

Worklist步骤



8.4 定义和运行程序

Define Procedure 步骤用于配置和保存一系列的步骤。该程序中这些步骤无需

逐一重新配置即可在方法中多次使用。Run Procedure 步骤将被插入到方法中

和用于指明将在方法中使用的已定义程序。在 Define Procedure 步骤中定义

的程序，只可通过插入Run Procedure步骤和在其步骤配置中选取欲用的程序

来运行。

8.4.1 使用 Define Procedure 步骤定义程序

在本自学教程的这个部分，您将插入和配置一个 Define Procedure，用来装上

特定移液头、转移基于您先前已配置之工作单的体积、然后卸下移液头。此已

定义的程序于是将作为您将在后面配置的 If步骤的组成部分而运行。您也将在

这个程序里创建变量，其值将在 Run Procedure 步骤中指定。这使您可以用与

已定义的变量关联的不同值运行程序中的步骤。

1. 由 Specialty 步骤选择板（图8-4），在 Instrument Setup 步骤下面插入一

个 Define Procedure 步骤。

2. 在 Procedure 域中输入 ReagentAddition （图8-4）。这就成为此程序的

名称且将在方法视图中作为 Define ReagentAddition 出现。

图 8-4、程序已命名

3. 在 Variable Name 列中输入 Reagent，用 Tab 键转到 Default Value 列且输

入 A。您输入 A，因为它作为表达式的一部分，是默认值的一部分。

4. 按键盘上的 Enter 键，然后在 Variable Name 列中输入 Amount，用 Tab键转到 Default Value 列且输入 =AmountA。

BIOMEK 概念程序

程序具有多项长处，例如在

方法中多次运行相同的步

骤，但只需配置这些步骤一

次。通过在方法视图中只显

示Run Procedure 步骤，而非

该程序访问的所有步骤，程

序可以控制方法视图中当前

方法的大小。

Define Procedure

步骤

在此输入 Procedure 名。



5. 双击方法视图中的 Define Procedure 步骤以显露 End Procedure（图8-5）。 Define Procedure 步骤目前显示为 Define ReagentAddition 步

骤。

图 8-5、变量已在 Define Procedure 步骤中输入

8.4.2 配置 Define Procedure 步骤内的步骤

要配置 Define Procedure 步骤，从而装上移液头、转移基于您先前已配置之工

作单的体积、然后卸下移液头，您将需要在 Define Procedure 步骤中逐个配置

下列步骤：

• Span-8 New Tips步骤（请参阅第8.4.2.1节配置访问来源的不同移液头）

• Transfer 步骤（请参阅第8.4.2.2节在程序中移液）

• Span-8 Tip Discard 步骤（请参阅第8.4.2.3节在程序中卸下移液头）

此 Define Procedure 将作为您在后面配置的 If 步骤的组成部分而运行。


您不用装上和卸下移液头，因此不必完成第8.4.2.1节配

置访问来源的不同移液头或第8.4.2.3节在程序中卸下移

液头。请转到第8.4.2.2节在程序中移液。



8.4.2.1 配置访问来源的不同移液头

鉴于本自学教程方法中的液槽装有不同的液体，您将想要为每个液槽指定不

同的移液头。您将配置 Span-8 New Tips 步骤作为程序的组成部分，以确保正

确的移液头被装上和用于访问正确的来源液槽。

1. 由 Span-8 步骤选择板，在方法视图中 Define ReagentAddition 步骤内插入

一个 Span-8 New Tips 步骤。

2. 在配置视图的 Tips 域中，突出显示此域并输入 =“tips”&reagent（图8-6）。请不要忘记变量名称不分大小写。

图 8-6、 Span-8 New Tips 已配置

Span-8 New Tips 步骤



8.4.2.2 在程序中移液

为了配置在此程序运行时将执行的实际移液，请完成如下工作：

1. 将一个 Transfer 步骤插入到方法视图中 Span-8 New Tips 步骤下面。

2. 取消对 Load AP96_200µL_LLS tips 和 Change tips between transfers的选定。

3. 使用您在第 1 章中学到的知识，将此 Transfer 步骤中的 Source 配置为在

=“Reagent”&Reagent 位置的 Reservoir。配置 =“Reagent”&Reagent意味着台面上的液槽具有与将要使用的变量Reagent 之值相同的名称。您

将在后面于 Define 和 Run Procedure 步骤中配置这个变量。

4. 在此Transfer步骤中，将Destination 配置为在=plates位置的BCFlat96。

5. 在 Destination 配置的 µL 域中输入 =Amount。


将一个Transfer步骤插入到Define Reagent步骤下面，

保留默认的 Tip Handling。

提示

当在 Define Proce-dure 步骤内配置

Transfer步骤时，台

面不活动。



8.4.2.3 在程序中卸下移液头

在此您将配置这个程序，从而在移液操作后卸下移液头。要卸下移液头：

1. 将一个 Span-8 Tip Discard 步骤插入到 Transfer 步骤下面。

2. 单击 Define ReagentAddition 步骤。主编辑器看上去应如图8-7 所示，并

且您刚刚创建的已命名程序，将用于指定何时使用新的移液头，以及在移

液时将访问哪个液槽。

图 8-7、 Define Procedure 步骤已配置

3. 双击 Define ReagentAddition 步骤将它折叠起来。

4. 单击 Finish 步骤验证此方法。

请前往下一节。您将配置一个 If 步骤，从而学习如何在方法中使用条件。

提示

如果想要在其他方

法中重新使用某个

程序，请将已配置

的程序拖放到任何

一个在显示的步骤

选择板上。这样就

会出现一条屏幕提

示，询问您是否想

要将该步骤放在该

特定选择板上。您

也能够创建一个自

定步骤选择板（请

参阅 Biomek Soft-ware User's Manual（Biomek 软件用户

手册）第 30.4 节Customizing StepPalettes （自定步骤

选择板）。无论采

用哪种方法，此程

序日后就可通过被

拖放到方法视图中

而供其他方法使

用。

Span-8 Tip Discard 步骤



8.5 配置 If 步骤以在方法中使用条件

If 步骤控制着方法中基于条件决定而执行的步骤。在 If 运行时， Biomek 软件

会测验 If 条件是真或假，然后基于测验结果处理相应的分步骤组。（请参阅侧

边的 Biomek 概念。）

为了在本自学教程中配置 If 步骤以使用条件，您将：

• 插入一个 If 步骤和输入从来源 ReagentA 移液的条件。

• 为Then分步骤插入一个从来源ReagentA移液的Run Procedure步骤。

• 插入另一个 If 步骤和输入从来源 ReagentB 移液的条件。

• 为Then分步骤插入一个从来源ReagentB移液的Run Procedure步骤。

8.5.1 使用 If 步骤设置条件

在本自学教程的这一节中，您将配置两个 If 步骤；它们将基于您为 Worklist 步骤配置的来源，指定每次移液要访问的试剂槽和特定移液头箱。您将配置这些

If 步骤和将它们插入 Worklist 步骤。这些移液于是将运行您先前配置的

ReagentAddition 程序。该程序会找到正确的移液头，然后由正确的液槽转移

适当的体积。

要配置 If 步骤：

1. 由 Advanced 步骤选择板，在方法视图中 Worklist 步骤内插入一个 If 步骤。

2. 在 Condition 域中输入 AmountA > 0。主编辑器看上去应如图8-8 所示。

图 8-8、条件已输入到 If 步骤中

3. 由 Specialty 步骤选择板，在方法视图中 If 步骤的 Then 分步骤下面插入一

个 Run Procedure 步骤。

BIOMEK 概念If 步骤

If 步骤的分步骤有：

• Then — 如果条件为真，

Then 后面的分步骤会得

到处理。

• Else — 如果条件为假，

Else 后面的分步骤会得

到处理。

• End — End 分步骤终止

每个 If、 Then、 Else 步

骤组。

If 步骤



4. 在 Procedure 域中选取 reagentaddition。

在本自学教程中，您不在 Else 分步骤中加入步骤。这意味着如果 If 步骤的评

估为假，就不会有进一步动作。主编辑器现在看上去应如图8-9 所示。

图 8-9、 ReagentAddition 程序已作为 Then 分步骤而插入

5. 将另一个If步骤插入到方法视图最后一个End分步骤与End Worklist之间。

6. 在 Condition 域中输入 AmountB > 0。

7. 将一个Run Procedure 步骤插入到在方法视图中第二个 If 步骤的Then分

步骤下面。

8. 从 Procedure 域中选取 reagentaddition。

9. 将 Amount 的 Value 改成 =AmountB。

Run Procedure

步骤



10. 将 Reagent 的 Value 改成 B。您在此也不用 Else 分步骤，因此主编辑器


图 8-10、变量名称和值已改变

祝贺您！您刚刚使用工作单和带有已配置条件的 If步骤创建了一个方法。如果

您想要观看此方法以模拟方式运行，请单击工具栏上的绿色运行按钮。

Span-8 Pod 蜒使用文件直接移液 9-1


9 Span-8 Pod 蜒使用文件直接移液

9.1 使用 Transfer from File 引言







建变量）。


9.1.1 在使用 Transfer from File 中您将学到的知识

在本章中，您将使用前面学到的高级技能配置一个 Transfer from File 步骤：


• 为命中选取配置一个 Loop 步骤。

• 在此 Loop 步骤内插入一个 Define Pattern 步骤。

• 使用两个已提供的 .csv 文件配置一个 Transfer from File 步骤。

9-2 Span-8 Pod 蜒使用文件直接移液


9.1.2 为使用 Transfer from File 设置您的台面

使用您在前面学到的知识，启动 Biomek 软件，创建一个新方法，然后如下配

置一个 Instrument Setup 步骤：

1. 将 AP96_200µL_LLS 移液头箱放在 P5 和 P13 上。

2. 将 BCDeep96Round 孔板放在 P6、 P7、 P14、 P15 上。

3. 将 P6、P7、P14、P15 上的四块孔板分别命名为 Samples1、Samples2、Samples3、 Samples4，然后配置为装有 Unknown 体积的 Serum。

4. 在 P10 上放一块 BCFlat96 且命名为 Dest。此孔板开始时是空的，因此配

置为具有 0µL 的 Known 体积。

5. 将一个 SmallTuberack_Microfuge 放在 P9 上且命名为 Primers。将它配

置为装有 Unknown 体积的 Water。

请确定主编辑器上有下列步骤选择板：

• Basic

• Intermediate

• Span-8

您的台面看上去应如图9-1 所示。


9.1.3 将 .CSV 文件复制到计算机桌面上

将两个已提供的 .csv 文件（hits.csv 和 transferfromfile.csv）复制到您的计算机

桌面上。这些文件可在本自学教程附带的光盘上找到。



9.2 为命中选取创建一个环回

鉴于药物发现实验室使用库存化合物，在大数目的微孔板上进行高通过速度

筛选以产生“命中”，环回的重复过程就相当有用。在本节中，您将使用已提

供的 hits.csv 文件，并且假定此文件已指明在若干块微孔板上的许多命中；这

些命中将在您的方法中得到进一步处理。在您创建一个环回以进一步处理这

些命中之前，您将打开此 .csv 文件。然后您将使用一个 Define Pattern 步骤来

指定您将使用 Transfer 步骤向其中移液的那些命中。

9.2.1 查看 Hits.csv 文件

hits.csv 文件是一个简单的两列文件。每一行指明一个属于命中的孔；该命中

需要进一步的研究或处理。第一列指明该命中所在的孔板，第二列指明该命中

位于该孔板上的哪个孔。

要查看此 .csv 文件：

1. 双击您计算机桌面上的 hits.csv， hits.csv 文件就会开启（图9-2）。

图 9-2、已提供的 hits.csv 文件



2. 请注意每一行如何指明一个属于命中的孔。也请注意，第一列指明该命中

所在的孔板，第二列指明该命中位于该孔板上的哪个孔。

3. 请关闭此 .csv 文件。因为您必须先将它关闭，才能在 Define Pattern 步骤

中使用。

9.2.2 插入 Loop 步骤

要插入 Loop 步骤：

1. 将一个 Loop 步骤插入到方法视图中 Instrument Setup 步骤下面。

2. 在 Variable 域中输入 plate。

3. 在 Start 域中输入 1。

4. 在 End 域中输入 4。

5. 在 Increment 域中输入 1。

9.2.3 插入 Define Pattern 步骤

要插入 Define Pattern 步骤：

1. 如果 Loop 步骤已折叠，请双击其上。

2. 在此 Loop 步骤内插入一个 Define Pattern 步骤（图9-3）。

图 9-3、 Define Pattern 已插入到 Loop 内

3. 在 Create a pattern named 域中输入 SamplesToTransfer。

4. 在 Model it after the labware type 中选取 BCDeep96Round。

BIOMEK 概念Define Pattern 步骤

Define Pattern 步骤用于创建

图案和为这些图案命名，以

供方法中的其他步骤使用，

例如 Transfer 步骤或

Combine 步骤。使用 DefinePattern 步骤定义的孔图案与

方法关联且作为该方法的组

成部分而嵌入，而使用 WellPattern Editor 创建的孔图案

则与项目关联且可跨多个方

法使用。如需关于使用 WellPattern Editor 的更多信息，


册）第 12 章 Creating WellPatterns （创建孔图案）。

Define Pattern步骤



5. 复选 Read from file，此配置就会改变（图9-4）。

图 9-4、 Read from File 已选取

6. 由 Browse 按钮，选取 Hits.csv。前几行会在 Example data 中显示。

7. 复选 File has a header row。

8. 选取 Use rows where column . . .matches，然后选取 Plate。

9. 在 matches 后面，保留对上层选项的选定，并且选取 Name。

10. 在 from 域中输入 ="Samples"&plate。这使用在 Loop 步骤中创建的变量

来指明此图案适用于哪块标本孔板。这样一来，在每次通过此 Loop 时，

图案将会改变，从而与在该次迭代中处理的标本孔板一致。

11. 在 Wells are specified by 中选取 Numerics (e.g., 1-96)。



12. 从 in column 中选取 Well。此步骤配置看上去应与图9-5 相似。

图 9-5、 Read from file 已配置

9.2.4 插入 Transfer 步骤

要插入 Transfer 步骤：

1. 将一个 Transfer 步骤插入到 Define Pattern 步骤下面。

2. 保留默认的 Tip Handling，并且将它折叠。

3. 选定 Click here to add a source。

4. 从 Source 配置的实验室器皿类型下拉清单中选取 BCDeep96Round。

5. 在 at 域中输入 ="Samples"&plate。

6. 在 Using liquid type 中由下拉式菜单中选取 Serum。

7. 双击来源孔板将它放大。



8. 选定 Use Pattern，然后选取前面在 Define Pattern 步骤中创建的

SamplesToTransfer 图案。主编辑器看上去应如图9-6 所示。

图 9-6、 SamplesToTransfer 图案已选取

9. 选取 Zoom Out，返回到主 Transfer 步骤配置。

10. 选定 Click here to add a destination。

11. 单击当前台面显示中 P10 上的 Dest 实验室器皿以选定之。

12. 输入 50 µL 的体积。您将为每个命中孔转移相同的体积。这是与您将在本

章后面配置之Transfer From File步骤的一项关键不同之处，因为TransferFrom File 令您也可为每个孔对孔移液配置不同的体积。

13. 在目的实验室器皿图形下面，请确认Start after last marked well 和Marklast well that is used 均已被选定。这是右起的最后两个。如果其中任何

一个未被选定，那么就此 Loop 的每次迭代而言， Transfer 将从第一个选

定的孔（A1）开始。



14. 在 Transfer Details 中选取 Stop when finished with Sources。主编辑器


图 9-7、已配置 Loop 内的 Transfer 步骤

Start at last mark

Set mark



9.3 为反应设置插入 Transfer From File 步骤jj 在本节中，您将插入一个 Transfer From File 步骤，从而执行反应设置。前面

曾经移液的每个命中孔将需要由 Primers 试管架添加两个引物。每个标本所需

添加的引物及其体积各不相同。您在本节开始时已复制到计算机桌面上的

TransferFromFile.csv 文件，为每个目的指定了需要转移的引物及其体积。

首先您将查看 TransferFromFile.csv 文件。

9.3.1 查看 TransferFromFile.csv 文件

TransferFromFile.csv 文件是一个五列文件，其中每一行指定一个孔对孔移液：

• 第一列指定来源实验室器皿。

• 第二列指定来源实验室器皿上将被吸液的孔。

• 第三列指定目的实验室器皿。

• 第四列指定目的实验室器皿上将被排液的孔。

• 第五列指定移液体积。

BIOMEK 概念Transfer From File 步骤

Transfer From File 步骤通过

从一个逗号分隔文本文件

（.txt 或 .csv）读取数据，允许

将指定的体积由指定的来源

孔转移到指定的目的孔。逗

号分隔文本文件是一个文本

文件，其中通过用分隔每一

列和回车分隔每一行，指定

了一个表格中的所有值。



要查看此 .csv 文件：

1. 双击计算机桌面上的 TransferFromFile.csv， TransferFromFile.csv 文件就会

开启（图9-2）。

图 9-8、已提供的 TransferFromFile.csv 文件

2. 请注意其中的五列。

3. 请关闭此 .csv 文件。因为您必须先将它关闭，才能在 TransferFromFile 步

骤中使用。



9.3.2 插入 Transfer From File 步骤

1. 将一个 Transfer From File 步骤插入到 Loop 步骤的结尾处（图9-9）。

图 9-9、 Transfer From File 已插入

2. 保留默认的 Tip Handling，并且将它折叠。

3. 如果 File Properties 部分没有显示，请将它展开。这个选项指定了要使用

的文件，并且指示 Biomek 软件使用该文件中所包含数据的方式。

4. 由 Browse 按钮，选取 TransferFromFile.csv。前几行会在 Example data中显示。

5. 复选 File has a header row。

6. 选定 Example data 下面的全部五个复选框。

7. 在 File specifies source position in column 中选取 Source。

8. 在 File contains source well information in column 中选取 SourceWell。这

是需要包括在该文件中的唯一细项；其他一切都可如同常规Transfer步骤

那样配置。

9. 在 File specifies destination position in column 中选取 Dest。

10. 在 File contains destination well information in column 中选取 DestWell。

11. 在 File contains volume information in column 中选取 Volume。最后一个

复选框指示 Transfer From File 步骤跳过 Volume 为 0 的任何行。如果不选

定此选项，它将为进行 0 体积移液而完成装上移液头的操作，却实际上不

转移任何液体。

12. 折叠 File Properties。尽管 Source 和 Destination 已由此文件指定，此文

件不包含关于实验室器皿和液体类型的任何信息。Transfer From File步骤

为了能够选取移液要使用的正确技巧，将需要此信息（请参阅第9.3.2.1节为 Transfer From File 步骤配置一些需要的来源和目的信息）。



9.3.2.1 为 Transfer From File 步骤配置一些需要的来源和

目的信息

1. 单击 Source 配置将它打开。

2. 在第一个下拉式菜单中选取 SmallTuberack_Microfuge。

3. 在 Using liquid type 中选取 Water。

4. 单击 Destination 配置将它打开。

5. 在第一个下拉式菜单中选取 BCFlat96。

6. 在 Using liquid type 中选取 Water。主编辑器看上去应如图9-10 所示。

图 9-10、 Transfer From File 已配置

您可以运行此方法，但如您可见，这将花费约 15 分钟时间。

祝贺您！您已经学完 Biomek FX 型仪器的 Span-8 章节。