herhangi bir çıkar çatışmam yoktur

TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya

Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri (KHDAK) Hastalarında NF-Kappa B 1

Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması

1

Yasemin Müşteri Oltulu 1, Gökhan Özkan1 , Engin Aynacı 2, Ender Coşkunpınar 1, Pınar Yıldız 2, İlhan Yaylım 1.

1. İstanbul Üniversitesi DETAE Moleküler Tıp AD, İstanbul2. Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim Araştırma Hastanesi, İstanbul

Herhangi bir çıkar çatışmam yoktur.

TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya 2

Akciğer Kanseri - GirişAkciğer kanseri tüm kanser ölümlerinin %

19,4’ünden sorumludur.


Giriş ve AmaçHastalığın

genetik, moleküler ve biyolojik özelliklerinin ortaya konması, sağkalımı artırmaya yönelik bireysel tedavi olanaklarının geliştirilmesine imkan sağlayacaktır.

NF-κB aktivasyonundaki artışın KHDAK’de birçok prognostik faktörün regülasyonunu etkilediği bilinmektedir.

Bu çalışmada NF-κB1 -94ins/del ATTG polimorfizminin KHDAK deki rolü araştırıldı.


KHDAK’de Hedefe Yönelik Kanser Tedavisi


NF-κB

NF-κB ilk kez 1986 yılında Baltimore ve arkadaşları tarafından tanımlanmıştır.

NF-κB geni B lenfositlerinin çekirdeklerinde yer alan bir transkripsiyon faktörü olarak tanımlanmaktadır.

Birçok organizmada ve hemen her hücre tipinde bulunan, birçok genin ekspresyonunun regülasyonunda önemli bir düzenleyici protein olduğu saptanmıştır.


NF-Kappa B Yapısı ve Üyeleri


NF-κB/Rel proteinleri C terminal dizisine göre 2 sınıfa ayrılır; 1. p50/p105 (NF-κB1) ve p52/p100 (NF-κB2)2. RelA (p65), RelB, c-Rel yer alır

7

Beş adet NF-κB polipeptidi homo- ve hetoro-dimerizasyon yoluyla 15 adet transkripsiyon faktörü oluşturabilir:

a. Gösterilen 9 adet dimer transkripsiyonal aktivasyon gösterebilen dimerlerdir.

b. Transkripsiyonal aktivasyon domaini bulunmayan dimerleri göstermektedir.

c. DNA’ya bağlanma kabiliyeti olmayan dimerleri göstermektedir.

TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012, Antalya

NF-κB1

NF-κB1 geni 4. kromozomun uzun kolunda lokalize (4q24) 156 kb ağırlığında ve 25 ekzondan oluşan bir gendir.


Bu varyasyonun, büyük bir sekansı etkilemesi, iki önemli promotör düzenleyici arasında yerleşmesi (Aktivatör protein-1 (AP-1) ve κB bağlanma yeri) ve bulunduğu pozisyon itibarı ile fonksiyonel κB bağlanma noktasına çok yakın olması nedenleriyle önemli olduğu düşünülmektedir.


NF-κB Aktivasyon Yolağı


TNFαIL-1LPS

LTBBAFFCD40

Serin Spesifik Fosforilasyon (Ser32-34)

Ubiqutinasyon(Lys21-22)(E2 – E3 ligaz)

Degredasyon(26 S proteozom)

Dimer nükleusa

IKK aktifleşir

Serin Spesifik Fosforilasyon

(C terminal)

Ubiqutinasyon

Preolitik yıkım

Dimer nükleusa

NIK aktifleşir

11

Hipoksi , H2O2 Tirozin kinazı uyarıyor

IKBα Tyr42’den fosforilleniyor

Degredasyon

UV, HER2 Kazein Kinaz II’yi uyarıyor

IKBα fosforilleniyor

Degredasyon

Atipik Aktivasyon Yolağı


Materyal - Metod


Örneklerin Gelişi- Kayıt

DNA İzolasyonu

PCRAgaroz jel elekroforezi

Enzim Kesimi

UV Görüntüleme

İstatistik Analiz

13

PCR

NF-κB1 -94 ins/del ATTG polimorfizmi


Van91l (PflMI) Enzim Kesimi

RFLP

14

BULGULAR


KHDAK grubu Kontrol grubu

Ortalama SS Ortalama SS p değeri

Yaş 61,21 9,825 57,49 10,828 0,515

Sigara 53,86 35,44 29,13 17,08 <0,001

Erkek (n) (%) 89 93,7 67 67,7 <0,001

Kadın (n) (%) 6 6,3 32 32,3

LDH (U/L) 233,43 121,58 161,73 27,24 <0,001

Lökosit (103/mm3) 9,12 3,18 6,84 1,82 <0,001

HGB (g/l) 12,85 1,68 13,88 1,45 0,104

HCT (%) 39,14 4,97 41,91 4,12 0,068

FEV1 63,87 19,19 98,32 10,18 <0,001

FVC 67,16 16,67 97,13 10,12 <0,001

FEV1/FVC 79,60 16,09 93,94 15,20 0,596

DLCO 81,09 43,26 90,08 16,77 0,08015

KHDAK grubu Kontrol grubu

N(95) % N(99) % p değeri

Genotip

II 35 36,84 46 46,47

ID 44 46,32 47 47,47

DD 16 16,84 6 6,06 0,048**

Allel

I 114 60 139 70,2

D 76 40 59 29,8 0,035**

Genotip

DD (+) DD (-)

n % n % p değeri

KHDAK 16 16,8 79 83,2 0,018**

Kontrol 6 6,1 93 93,9


II:insersiyon/insersiyon DD:delesyon/delesyon ID:insersiyon/delesyon

Yazar-Yıl Populasyon Hastalık Sonuç

Karban ve ark (2004) Kuzey Amerika Ülseratif Kolit D alleli ve DD genotipi

risk faktörü p=0,002 p= 0,0043

Crohn Hastalığı İlişkisiz

Borm ve ark (2005)

Holanda-Beyaz

Ülseratif Kolit D alleli risk faktörü p=0,019

Crohn Hastalığı İlişkisiz Mirza ve ark (2005) İngiliz Ülseratif Kolit İlişkisiz Oliver ve ark (2005) İspanyol Ülseratif Kolit İlişkisiz

Kurylowicz ve ark (2007) Japonya-Polonya Graves D alleli risk faktörü p=0,0006

Adamzik ve ark (2007) Alman-Beyaz ARDS D alleli hastalığın şiddetini artırıyor

Lewander ve ark (2007) İsveç-Çin Kolorektal Kanser D alleli risk faktörü p= 0,0001

Lin ve ark (2006) Çin Oral SCC I alleli risk faktörü 1,78 kat

Fan ve ark (2011) Çin Over Kanseri II genotipi risk faktörü p=0,002

Zhang ve ark (2009) Çin Prostat Kanseri II genotipi risk faktörü p=0,035

17TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya

TARTIŞMA


D alelinin promotor aktivitesi

I alelinin promotor aktivitesi

I allelini taşıyan oligonükleotitlerin çekirdek proteinlerine sıkıca bağlandığı fakat D allelini taşıyan oligonükleotitlerin ise çekirdek proteinlerine bağlanmadığı ya da daha zayıf bağlandığı saptanmıştır.

D aleli, NF-κB1 ekspresyonunda azalmaya neden olup diğer Rel homo/hetero dimerlerin fazla ekspresyonuna neden olabilir.

Azalmış p50 (NF-κB1) ekspresyonu inflamatuvar yanıtın azalmasına yol açabilir.

SONUÇ

DD genotipli bireylerin frekansının hasta grubunda kontrole göre anlamlı şekilde yükseldiği ve hastalık oluşum riskini 3,13 kat arttırdığı gözlenmiştir (*p=0,018 , 2:5,605; OR: 3,13%95CI: 0,119-0853).


SONUÇ

NF-κB1 -94 ins/del ATTG promotor polimorfizmi akciğer karsinogenezinde ve prognozun belirlenmesinde önemli bir bulgu olabilir.

Akciğer kanserinde kritik sinyal yolaklarındaki moleküler mekanizmaların ortaya konması, yeni tanı

ve tedavi metodlarının geliştirilmesine imkan sağlayacaktır.



21

Gökhan Özkan, MSc

Ender Coşkunpınar, PhD

Engin Aynacı, Uzm Dr.

Pınar Yıldız, Doç. Dr.

Ayse Eren, MSc

İlhan Yaylım, Prof.Dr.

herhangi bir çıkar çatışmam yoktur

Documents