elvÁlasztÁstechnikai mÓdszerek elmÉlete És gyakorlata dr. kremmer...

41
ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA Dr. Kremmer Tibor VI. FOLYADÉKKROMATOGRÁFIÁS MÓDSZEREK GÉLKROMATOGRÁFIA EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest – 2013

Upload: xantha-buck

Post on 02-Jan-2016

56 views

Category:

Documents


4 download

DESCRIPTION

ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA Dr. Kremmer Tibor VI. FOLYADÉKKROMATOGRÁFIÁS MÓDSZEREK GÉLKROMATOGRÁFIA EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest – 2013. GÉLKROMATOGRÁFIA GEL CHROMATOGRAPHY - GEL FILTRATION - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK

ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA

Dr. Kremmer Tibor

VI.

FOLYADÉKKROMATOGRÁFIÁS MÓDSZEREK

GÉLKROMATOGRÁFIA

EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest – 2013

Page 2: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

GÉLKROMATOGRÁFIAGEL CHROMATOGRAPHY - GEL FILTRATION

MOLEKULA MÉRET SZERINTI ELVÁLASZTÁSÚ KROMATOGRÁFIA

SIZE EXCLUSION CHROMATOGRAPHY

SEC

GÉL PERMEÁCIÓS KROMATOGRÁFIA

GEL PERMEATION CHROMATOGRAPHY

GPC

Page 3: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS McBain (1929) Molecular Sieving - Molekula sziták, zeolitok – permutitok

Deuel és Neukom (1954) Desalting - Poliszacharid gélek, sómentesítés

Porath és Flodin (1954) Gel Filtration - GÉLSZŰRÉS Uppsala – Pharmacia Fine Chemicals, Sephadex – Sepharose gélek

Gelotte (1960), Pedersen (1962), Flodin és Porath (1961-63) Size Exclusion Chromatography (SEC) Méret szerinti kizáródásos kromatográfia Szterikus-volumetrikus térfogati megoszlási modell

Steere és Ackers (1962) Restricted Diffusion Chromatography

Hjerten és Mosbach (1962) Molecular Sieve Chromatography A molekula „szitálás” matematikai modellje

Moore (1964) Gel Permeatíon Chromatography (GPC)

Casassa (1967), Ogston (1968-70) Termodinamikai értelmezés Ozmotikus nyomás – entrópia változás alapján

Determann (1964) Gel Chromatography - GÉLKROMATOGRÁFIA

Page 4: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

A GÉLKROMATOGRÁFIA

ELVÁLASZTÁSI

MECHANIZMUSÁNAK

SZTERIKUS

ELMÉLETI

MODELLJE

Page 5: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Térhálós szerkezetű polidextrán alapú xerogél (Sephadex) pásztázó elektronmikroszkópos (SEM) képe.

Page 6: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

PORÓZUS SZILIKA GÉL ELEKTRONMIKROSZKÓPOS KÉPE

Page 7: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

GÉLKROMATOGRÁFIA AZ ELVÁLASZTANDÓ ANYAG(OK)

Kémiai tulajdonságai:Szerkezet – stabilitásFunkcionális csoportokBiológiai aktivitásMolekula méret-tömeg, eloszlás

Kis molekulák – Makromolekulák, Biopolimerek

Fizikai tulajdonságai:

Oldékonyság (poláris-apoláris)

Szolvatáció – hidratáció

Alak (globuláris - fibrilláris), konformáció – aggregáció

Hidrodinamikai jellemzők

Stokes-f rádiusz, diffúziós állandó,

belső viszkozitás, flexibilitás

Page 8: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

GÉLKROMATOGRÁFIA

AZ ÁRAMLÓ FÁZIS

AZ ELUENS – OLDÓSZER POLARITÁSA

pH, IONERŐSSÉG, ION MINŐSÉG

VISZKOZITÁS (KONCENTRÁCIÓ)

ADALÉKOK detergensek,

stabilizálók, antioxidánsok, antibakteriális vegyületek, stb,

Page 9: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

AZ ÁLLÓ (GÉL) FÁZIS

A TÖLTET KÉMIAI ÖSSZETÉTELE - SZERKEZETE

Xerogel - liogel, térhálós polimerek, Biokompatibilitás,

SZERVETLEN OXIDOK

SiO2, Al203, hidroxi apatit, TiO2, üvegszemcsék

(CPG),

SZERVES POLIMEREK

Dextrán, agaróz, akrilamid, akril-metakrilát, poliéter-

észter, polivinilalkohol, polisztirol-

divinilbenzol,

KEVERT TÍPUSOK

Szervetlen-szerves - Si02- poliszacharid,

Szerves-szerves – dextrán - agaróz,

Egyéb polimerek - akrilamid - PS-DVB

GÉLKROMATOGRÁFIA

Page 10: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

AGARÓZ GÉL SZERKEZETE (Araki, 1956)

Page 11: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

TÉRHÁLÓS DEXTRÁN GÉLEK (Sephadex) SZERKEZETE

Page 12: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

N,N’-METILÉN BIS-AKRILAMIDDAL TÉRHÁLÓSÍTOTT POLIAKRILAMID GÉLEK

Page 13: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

GFC - SECPOLÁRIS – HIDROFIL GÉLKROMATOGRÁFIÁS TÖLTETEK

Elnevezés Összetétel Gyártó - Forgalmazó

Sephacryl

S 100 -1000Allil - dextrán akrilamid Pharmacia-LKB

Superdex 30-200 Dextrán-agaróz Pharmacia-LKB

SynChrom GPC Polipropil-gliceril Waters- Millipore

Sigmachrom

GFC 100-300Dextrán - polietilénglikol Sigma-Aldrich

Chitopearl Chitopack Kitin – kitosan poliszacharid Fuji Spinning Co. (Japán)

Nucleosil

Phenomenex GPC-P

Daisogel 2205

SiO2Macherey-Nagel Phenomenex Daiso (Japán)

Unisphere Al2O3 Biotage

HA Type 8 Hidroxiapatit Koken Science

Page 14: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

GPC – SEC APOLÁRIS – HIDROFÓB/ORGANOFIL GÉLKROMATOGRÁFIÁS TÖLTETEK

Elnevezés Összetétel Gyártó-Forgalmazó

Styragel HMW PS – DVB Waters

Fractogel TSK Szilikagél, ill. Merck

G 3000 SW-PW Polivinil - sztirol polimer

Toyopearl HW 55F TosoHaas

Metachem GPC 102 - 106

PS - DVB Metachem Tecnol.

Jordi Gel DVB 500 Polidivinil benzol Jordi Associates

BioSep SEC

2000-4000PS - DVB Phenomenex

Asahipak HO Polivinil alkohol Asahi Chem. Co.

PL gel MIXEDPolietilénnel kevert

PS-DVB Polymer

PL Aquagel OH Polihidroxid Polihidroxil Lab Ltd,

Shodex UT 800

KF 80 M

Poliszachariddal kevert

PS – DVB kopolimerShowa Denko

Page 15: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Kereskedelmi HPLC-SEC oszloptöltetekNanorészecskék, makromolekulák, biopolimerek elválasztására

Elnevezés Összetétel Gyártó-Forgalmazó

Sepharose CL 2B, 4B, 6B Dextrán-agaróz Pharmacia LKB

Sephacryl S 200, S 300 Dextrán-akrilát Pharmacia LKB

Styragel HMW PS – DVB Waters

Fractogel TSK Szilikagél, ill. polimer Merck

TSKgel G 3000 SW-PW Polivinil - sztirol polimer TosoHaas

Toyopearl HW 55F, -75 Etilénglikol/metakrilát kopolimer TosoHaas

Shodex HA 30 Hidrofil PS - DVB TosoHaas

Shodex UT 800 KF 80 M Poliszachariddal kevert PS – DVB Showa Denko

PL aquagel OH Polihidroxid- polimer gyanta Polymer Laboratories

PL gel MIXED Polietilénnel kevert PS-DVB Polymer Laboratories

Phenogel OH Hidrofil polimer gyanta Polymer Laboratories

NUCLEOGEL GFC Hidrofil polimer gyanta Macherey-Nagel

BioSep SEC 2000-4000 PS – DVB Phenomenex

Asahipak HO Polivinil alkohol Asahi Chem. Co.

Jordi Gel DVB 500 Polidivinil benzol Jordi Associates

Metachem GPC 102 - 106 PS - DVB Metachem Technology

Page 16: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Sephadex G gélek kromatográfiás tulajdonságai

Géltípus Gélágy térfogatacm3/g xerogél*

Kizáródási moltömeg (kDa)

Frakcionálási tartomány (kDa)

G-10 2 – 3 ≈ 0,7 0,7 alatt

G-15 2,5 – 3 – 5 ≈ 1,0 1,0 alatt

G-25 4 – 6 5 1 –5

G-50 9 – 11 30 1,5 – 30

G-75 12 – 15 70 3 – 70

G-100 15 – 20 150 4 – 150

G-150 20 – 30 400 5 – 400

G-200 30 – 40 800 5 - 800

A száraz (xerogél) szemcsék mérete (μm) fajtától függően: durva (coarse) 100-300, közepes (medium) 50-150,

finom (fine) 20-80, vagy szuperfinom (superfine) 10-40 lehet.

Page 17: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HOMODISZPERZ SZTIROL-DIVINIL BENZOL KOPOLIMER SZEMCSÉK (BioBeads, 5 m) SEM KÉPE

Page 18: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor
Page 19: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor
Page 20: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HOMODISZPERZ SZFEROID SZEMCSÉK TÉRBELI ILLESZKEDÉSÉNEK HEURISZTIKUS MODELLEZÉSE

Page 21: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HOMODISZPERZ SZFEROID SZEMCSÉK 6 ÉS 8 KOORDINÁCIÓS SZÁMMAL ILLESZKEDŐ TÉRBELI MODELLJEI

Page 22: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

to VV3

1

)( otavoe VVKVV

ot

oeav VV

VVK

10 avK

A GÉLKROMATOGRÁFIA SZTERIKUS-VOLUMETRIKUS EGYENLETE

Page 23: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

AZ ÁLLÓ (GÉL) FÁZIS SZERKEZETE

A GÉLEK SZÁRAZANYAG (TÉRHÁLÓ) TARTALMA (súly %)

Agaróz 0.3 – 1.5

Sephadex 3 - 30

Poliakrilamid 2.5 - 15

A gélszemcsék 70 – 95 %-a víz (oldószer) !

ERŐSEN HIDRATÁLT (SZOLVATÁLT) SZERKEZET

A víz (oldószer) molekulák (dinamikus egyensúlyban) a térhálóhoz rögzített térszerkezetet képeznek.

A rögzített folyadéktér hozzáférhetőségét a térhálós szerkezet sűrűsége (keresztkötések száma, orientációja, „pórusméret”) és az oldott (elválasztandó) molekula mérete (tömege) határozza meg.

Page 24: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Az elválasztás technika szemlélete szerint a

GÉLKROMATOGRÁFIAa FOLYADÉK-FOLYADÉK MEGOSZLÁSI KROMATOGRÁFIA

SPECIÁLIS HATÁRESETE

ahol az álló és az áramló fázis ugyanaz az oldószer,

a szerkezetileg rögzített és a folyadék halmazállapotú vízmolekulák.

Az ELVÁLASZTÁS MECHANIZMUSA

a fázisok közötti térfogati megoszlás

(fázisarány, megoszlási együttható)

a molekula méretének (tömegének) függvénye.

Kav ~ f(log M)

(A molekula rendelkezésére álló tér(fogat), „oldékonysága” különböző a két fázisban)

ot

oe

VV

VV

Page 25: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Determann egyenletek (1966-69) Dextrán (Sephadex) gélekre - fehérjékre, enzimekre

BIOPOLIMEREK MOLEKULA TÖMEGÉNEK (MÉRETÉNEK) MEGHATÁROZÁSA GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

logM = M0 - (6.06-5.00 )Ve

Vo

= a xerogél szemcse sűrűsége

log M Ve / V0 = Kav (Vt – V0)

(Vt – V0) állandó érték 2/3 . Vt

Kav = 0 – 1 log M Kav

Page 26: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

MOLEKULA TÖMEG (MÉRET) MEGHATÁROZÁSA GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 27: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

A gélkromatográfia térfogati paramétereinek összefüggése a diffúziós állandóval

Page 28: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

3

3

4 aNM

DN

RTa

6

A MOLEKULA TÖMEGÉNEK ÉS MÉRETÉNEK ÖSSZEFÜGGÉSE

A gélkromatográfia alkalmazására vonatkozóan hangsúlyozni kell a molekula tömegének és (virtuális) méretének összefüggését (eltérését), amely a molekula fajlagos parciális térfogatával és a Stokes-féle rádiusszal írható le:

M – molekulatömeg, N – Avogadro-féle szám, a – Stokes-féle rádiusz, D – diffuziós állandó, υ – molekula fajlagos parciális térfogata, η – viszkozitási együttható.

Page 29: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

A GÉLKROMATOGRÁFIA MÓDSZEREI ÉS ALKALMAZÁSI TERÜLETEI

PREPARATÍV (BATCH) MINTA ELŐKÉSZÍTÉS - ANALITIKAI

OSZLOPKROMATOGRÁFIA (LC – HPLC) - RÉTEGKROMATOGRÁFIA

BEKONCENTRÁLÁS

SÓMENTESÍTÉS

PUFFER CSERE

CSOPORT FRAKCIONÁLÁS

TISZTÍTÁS – ELVÁLASZTÁS

MOLEKULA TÖMEG (MÉRET) MEGHATÁROZÁS

DETERGENS GÉLKROMATOGRÁFIA

KROMATOFOKUSZÁLÁS

Page 30: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

MOLEKULA TÖMEG MEGHATÁROZÁS GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 31: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

CSOPORT FRAKCIONÁLÁS GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 32: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

POLIETILÉNEK (2-32 kDa) ÉS SZÉNHIDROGÉNEK (C5-C58) ELVÁLASZTÁSA MÉRET SZERINTI KIZÁRÓDÁSOS (SEC) GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 33: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

TRANSZFERRIN TISZTÍTÁSA GÉLKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 34: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

CHYLOMICRON VLDL

HUMÁN

SZÉRUM

LIPO

PROTEIN

OSZTÁLYOK

(SEM)

Page 35: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

A HUMÁN SZÉRUM LOW DENSITY LIPOPROTEIN (LDL) MOLEKULA DODEKAHEDRÁLIS (pentagon dodekaéder) MODELLJE

Page 36: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HUMÁN SZÉRUM LIPOPROTEIN OSZTÁLYOK ELOSZLÁSA

VLDLLDL

HDL

ELFO

UC

Page 37: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HUMÁN SZÉRUM

LIPOPROTEINEK

ELVÁLASZTÁSA

ELEKTROFORÉZISSEL

AGARÓZ GÉLEN

Page 38: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

HUMÁN SZÉRUM

LIPOPROTEINEK

SEC ELVÁLASZTÁSA

AGARÓZ (Sepharose 6B)

GÉLOSZLOPON

VLDL

LDL

HDL

Page 39: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

PLAZMA MEMBRÁN ÖSSZETEVŐK SZOLUBILIZÁLÁSA DETERGENSEKKEL

(SDS - Na-dodecil szulfát)

Detergens

Sejtmembrán

SDS

(900 – 5 min)

Fehérje és lipid micellák

Page 40: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor

Májsejtek plazma membrán fehérje és lipid tartalmának elválasztása detergens gélkromatográfiával Sepharose 4B oszlopon.

- o -

- ● -- X -

Page 41: ELVÁLASZTÁSTECHNIKAI MÓDSZEREK ELMÉLETE ÉS GYAKORLATA                           Dr. Kremmer Tibor